刺參池塘養(yǎng)殖環(huán)境中幾類細菌的周年變化規(guī)律及快速檢測方法研究
發(fā)布時間:2021-04-16 16:34
隨著刺參(Apostichopus japonicus)人工養(yǎng)殖業(yè)的快速發(fā)展,刺參病害日漸突出。微生物是刺參養(yǎng)殖池塘生態(tài)系統(tǒng)的重要組成部分,理化參數(shù)也與刺參的健康狀況息息相關(guān)。因此,研究刺參養(yǎng)殖池塘中可培養(yǎng)細菌的周年變化規(guī)律及其與理化參數(shù)的關(guān)系,對刺參健康養(yǎng)殖具有重要意義。另外,快速定量檢測環(huán)境中刺參病原菌的數(shù)量變化,也有助于對刺參疾病的發(fā)生進行預(yù)警,以便及時采取防治措施。本論文通過定期采樣檢測幾類可培養(yǎng)細菌的數(shù)量和理化指標,研究了刺參養(yǎng)殖池塘水體和沉積物細菌的周年變化規(guī)律及其與理化環(huán)境因子的相關(guān)性,并建立了沉積環(huán)境中2種主要致病菌的快速檢測方法,主要內(nèi)容及結(jié)果如下:1.本研究于2012年4月至2013年4月,對山東省即墨刺參養(yǎng)殖池塘水體中4種可培養(yǎng)細菌(總異養(yǎng)菌、弧菌、硝化細菌、硫化細菌)、4項理化參數(shù)(溫度、pH、鹽度、溶解氧)和沉積環(huán)境中的6種可培養(yǎng)細菌(總異養(yǎng)菌、弧菌、硝化細菌、硝酸鹽還原菌、硫化細菌、硫酸鹽還原菌)、6項理化參數(shù)(溫度、pH、氧化還原電位、硫化物、有機碳、總氮)的動態(tài)變化進行了監(jiān)測;并分析了不同細菌類群之間及其與理化指標間的相關(guān)性。結(jié)果顯示:水體中可培養(yǎng)總異養(yǎng)...
【文章來源】:中國海洋大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:76 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
0 前言
1 綜述
1.1 微生物生態(tài)學(xué)和海洋微生物多樣性概述
1.1.1 微生物生態(tài)學(xué)的概念
1.1.2 微生物生態(tài)學(xué)的發(fā)展
1.1.3 微生物生態(tài)學(xué)的研究意義
1.1.4 海洋微生物多樣性
1.2 微生物多樣性的研究方法
1.2.1 傳統(tǒng)的研究方法
1.2.2 現(xiàn)代分子生物學(xué)研究方法
1.3 刺參養(yǎng)殖養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展概況
1.3.1 我國刺參養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀
1.3.2 刺參養(yǎng)殖技術(shù)
1.3.3 影響刺參健康的理化因子
1.3.4 我國刺參養(yǎng)殖業(yè)存在的問題
1.4 刺參養(yǎng)殖常見疾病及主要致病微生物
1.4.1 腐皮綜合癥
1.4.2 育苗期疾病
1.4.3 霉菌病
1.4.4 扁形動物病
1.4.5 纖毛蟲病
1.4.6 其它類生物引發(fā)的疾病
1.5 本論文研究目的、意義及內(nèi)容
1.5.1 研究目的和意義
1.5.2 研究內(nèi)容
2 刺參養(yǎng)殖池塘中理化因子和可培養(yǎng)細菌類群的周年變化研究
2.1 材料與方法
2.1.1 實驗池塘
2.1.2 樣品采集
2.1.3 理化參數(shù)的測定
2.1.4 配制培養(yǎng)基
2.1.5 細菌數(shù)量的測定
2.1.6 數(shù)據(jù)處理
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 刺參養(yǎng)殖池塘水體中理化參數(shù)和可培養(yǎng)細菌的動態(tài)變化規(guī)律
2.2.2 刺參養(yǎng)殖池塘沉積物中理化參數(shù)和可培養(yǎng)細菌的動態(tài)變化規(guī)律
2.3 討論
2.3.1 刺參養(yǎng)殖環(huán)境中理化參數(shù)和微生物群落的季節(jié)變化
2.3.2 微生物數(shù)量與理化參數(shù)間的變化關(guān)系
2.3.3 理化參數(shù)間的變化關(guān)系
3 養(yǎng)殖沉積環(huán)境中氣單胞菌屬細菌的實時熒光定量 PCR 檢測方法的建立
3.1 材料與方法
3.1.1 材料
3.1.2 方法
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 模擬沉積物樣品中 DNA 的提取
3.2.2 PCR 擴增結(jié)果
3.2.3 質(zhì)粒標準曲線和模擬沉積物樣品標準曲線的建立
3.2.4 特異性試驗
3.2.5 靈敏性試驗
3.2.6 重復(fù)性試驗
3.3 討論
4 養(yǎng)殖沉積環(huán)境中副溶血弧菌的實時熒光定量 PCR 檢測方法的建立
4.1 材料與方法
4.1.1 菌種來源
4.1.2 引物選擇
4.1.3 反應(yīng)體系及反應(yīng)條件
4.1.4 方法
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 PCR 擴增結(jié)果
4.2.2 質(zhì)粒標準曲線和模擬沉積物樣品標準曲線的建立
4.2.3 特異性試驗
4.2.4 靈敏性試驗
4.2.5 重復(fù)性試驗
4.3 討論
5 結(jié)論
參考文獻
致謝
個人簡歷
發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
【參考文獻】:
期刊論文
[1]養(yǎng)殖刺參“化板癥”病原菌的分離與鑒定[J]. 王印庚,郭偉麗,榮小軍,李彬,廖梅杰,張正,陳霞,劉升平. 漁業(yè)科學(xué)進展. 2012(06)
[2]實時熒光定量PCR快速檢測嗜水氣單胞菌方法的建立[J]. 王蓉,王忠發(fā),王志錚,趙蓓蓓,許欣. 現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2012(13)
[3]金黃色葡萄球菌熒光定量PCR計數(shù)法的建立[J]. 劉志勇,趙雪濤,錢子煜. 職業(yè)與健康. 2012(11)
[4]副溶血弧菌的SYBR Green Ⅰ實時定量PCR檢測方法建立[J]. 張曉君,陳麗,畢可然,秦蕾,秦國民. 食品科學(xué). 2012(08)
[5]遼東灣北部海域表層沉積物氧化還原電位及其主要影響因素[J]. 吳金浩,劉桂英,王年斌,徐雪梅,宋倫. 沉積學(xué)報. 2012(02)
[6]采用實時熒光定量PCR技術(shù)比較提取土壤真菌DNA方法的差異[J]. 王淑芳,馬桂珍,錢媛媛,陳月. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(33)
[7]刺參休眠規(guī)律的研究[J]. 胡凡光,高翔,王志剛,李美真,周文江,麻丹萍,李紹彬,張豫. 漁業(yè)現(xiàn)代化. 2011(02)
[8]牡蠣中副溶血弧菌熒光定量PCR檢測方法的建立及其應(yīng)用[J]. 林強,李寧求,付小哲,劉禮輝,石存斌,吳淑勤. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2011(01)
[9]實時熒光定量PCR技術(shù)研究進展及其應(yīng)用[J]. 陳旭,齊鳳坤,康立功,李景富. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2010(08)
[10]山東省刺參養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀分析與可持續(xù)發(fā)展對策[J]. 李成林,宋愛環(huán),胡煒,張艷萍,趙斌,李翹楚,麻丹萍. 漁業(yè)科學(xué)進展. 2010(04)
碩士論文
[1]刺參養(yǎng)殖池塘異養(yǎng)菌數(shù)量變動及區(qū)系組成的初步研究[D]. 牛宇峰.中國海洋大學(xué) 2009
[2]反硝化作用抑制硫酸鹽還原菌活性的技術(shù)研究[D]. 敖蕾娜日.哈爾濱工業(yè)大學(xué) 2006
本文編號:3141781
【文章來源】:中國海洋大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:76 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
0 前言
1 綜述
1.1 微生物生態(tài)學(xué)和海洋微生物多樣性概述
1.1.1 微生物生態(tài)學(xué)的概念
1.1.2 微生物生態(tài)學(xué)的發(fā)展
1.1.3 微生物生態(tài)學(xué)的研究意義
1.1.4 海洋微生物多樣性
1.2 微生物多樣性的研究方法
1.2.1 傳統(tǒng)的研究方法
1.2.2 現(xiàn)代分子生物學(xué)研究方法
1.3 刺參養(yǎng)殖養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展概況
1.3.1 我國刺參養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀
1.3.2 刺參養(yǎng)殖技術(shù)
1.3.3 影響刺參健康的理化因子
1.3.4 我國刺參養(yǎng)殖業(yè)存在的問題
1.4 刺參養(yǎng)殖常見疾病及主要致病微生物
1.4.1 腐皮綜合癥
1.4.2 育苗期疾病
1.4.3 霉菌病
1.4.4 扁形動物病
1.4.5 纖毛蟲病
1.4.6 其它類生物引發(fā)的疾病
1.5 本論文研究目的、意義及內(nèi)容
1.5.1 研究目的和意義
1.5.2 研究內(nèi)容
2 刺參養(yǎng)殖池塘中理化因子和可培養(yǎng)細菌類群的周年變化研究
2.1 材料與方法
2.1.1 實驗池塘
2.1.2 樣品采集
2.1.3 理化參數(shù)的測定
2.1.4 配制培養(yǎng)基
2.1.5 細菌數(shù)量的測定
2.1.6 數(shù)據(jù)處理
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 刺參養(yǎng)殖池塘水體中理化參數(shù)和可培養(yǎng)細菌的動態(tài)變化規(guī)律
2.2.2 刺參養(yǎng)殖池塘沉積物中理化參數(shù)和可培養(yǎng)細菌的動態(tài)變化規(guī)律
2.3 討論
2.3.1 刺參養(yǎng)殖環(huán)境中理化參數(shù)和微生物群落的季節(jié)變化
2.3.2 微生物數(shù)量與理化參數(shù)間的變化關(guān)系
2.3.3 理化參數(shù)間的變化關(guān)系
3 養(yǎng)殖沉積環(huán)境中氣單胞菌屬細菌的實時熒光定量 PCR 檢測方法的建立
3.1 材料與方法
3.1.1 材料
3.1.2 方法
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 模擬沉積物樣品中 DNA 的提取
3.2.2 PCR 擴增結(jié)果
3.2.3 質(zhì)粒標準曲線和模擬沉積物樣品標準曲線的建立
3.2.4 特異性試驗
3.2.5 靈敏性試驗
3.2.6 重復(fù)性試驗
3.3 討論
4 養(yǎng)殖沉積環(huán)境中副溶血弧菌的實時熒光定量 PCR 檢測方法的建立
4.1 材料與方法
4.1.1 菌種來源
4.1.2 引物選擇
4.1.3 反應(yīng)體系及反應(yīng)條件
4.1.4 方法
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 PCR 擴增結(jié)果
4.2.2 質(zhì)粒標準曲線和模擬沉積物樣品標準曲線的建立
4.2.3 特異性試驗
4.2.4 靈敏性試驗
4.2.5 重復(fù)性試驗
4.3 討論
5 結(jié)論
參考文獻
致謝
個人簡歷
發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
【參考文獻】:
期刊論文
[1]養(yǎng)殖刺參“化板癥”病原菌的分離與鑒定[J]. 王印庚,郭偉麗,榮小軍,李彬,廖梅杰,張正,陳霞,劉升平. 漁業(yè)科學(xué)進展. 2012(06)
[2]實時熒光定量PCR快速檢測嗜水氣單胞菌方法的建立[J]. 王蓉,王忠發(fā),王志錚,趙蓓蓓,許欣. 現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2012(13)
[3]金黃色葡萄球菌熒光定量PCR計數(shù)法的建立[J]. 劉志勇,趙雪濤,錢子煜. 職業(yè)與健康. 2012(11)
[4]副溶血弧菌的SYBR Green Ⅰ實時定量PCR檢測方法建立[J]. 張曉君,陳麗,畢可然,秦蕾,秦國民. 食品科學(xué). 2012(08)
[5]遼東灣北部海域表層沉積物氧化還原電位及其主要影響因素[J]. 吳金浩,劉桂英,王年斌,徐雪梅,宋倫. 沉積學(xué)報. 2012(02)
[6]采用實時熒光定量PCR技術(shù)比較提取土壤真菌DNA方法的差異[J]. 王淑芳,馬桂珍,錢媛媛,陳月. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(33)
[7]刺參休眠規(guī)律的研究[J]. 胡凡光,高翔,王志剛,李美真,周文江,麻丹萍,李紹彬,張豫. 漁業(yè)現(xiàn)代化. 2011(02)
[8]牡蠣中副溶血弧菌熒光定量PCR檢測方法的建立及其應(yīng)用[J]. 林強,李寧求,付小哲,劉禮輝,石存斌,吳淑勤. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2011(01)
[9]實時熒光定量PCR技術(shù)研究進展及其應(yīng)用[J]. 陳旭,齊鳳坤,康立功,李景富. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2010(08)
[10]山東省刺參養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀分析與可持續(xù)發(fā)展對策[J]. 李成林,宋愛環(huán),胡煒,張艷萍,趙斌,李翹楚,麻丹萍. 漁業(yè)科學(xué)進展. 2010(04)
碩士論文
[1]刺參養(yǎng)殖池塘異養(yǎng)菌數(shù)量變動及區(qū)系組成的初步研究[D]. 牛宇峰.中國海洋大學(xué) 2009
[2]反硝化作用抑制硫酸鹽還原菌活性的技術(shù)研究[D]. 敖蕾娜日.哈爾濱工業(yè)大學(xué) 2006
本文編號:3141781
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