半滑舌鰨（Cynoglossus semilaevis）,是一種在我國(guó)沿海地區(qū)均有分布的棲息于底層的魚類,具有生長(zhǎng)快、營(yíng)養(yǎng)豐富等優(yōu)點(diǎn),已成為珍貴的養(yǎng)殖魚類之一。近年來,隨著養(yǎng)殖規(guī)模的擴(kuò)大,水體環(huán)境的惡化,半滑舌鰨養(yǎng)殖業(yè)面臨著一系列嚴(yán)重的細(xì)菌病害威脅。水體環(huán)境中存在大量病原體可誘發(fā)其養(yǎng)殖過程中疾病頻發(fā),帶來了巨大的經(jīng)濟(jì)損失,嚴(yán)重制約了其養(yǎng)殖業(yè)的進(jìn)一步健康發(fā)展。因此,為了改變這一困境,對(duì)半滑舌鰨免疫相關(guān)基因及其免疫機(jī)制的探究迫在眉睫。其中腫瘤壞死因子家族（tumor necrosis factor superfamily）與其受體家族作為免疫系統(tǒng)中的重要成員,在半滑舌鰨免疫及炎癥反應(yīng)過程中具有重要的作用。本實(shí)驗(yàn)根據(jù)已公布的半滑舌鰨全基因組序列結(jié)果,從半滑舌鰨中克隆得到TNF-α1、TNF-α2和CD40等3個(gè)免疫相關(guān)基因,利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR（qRT-PCR）檢測(cè)了3個(gè)免疫相關(guān)基因在各組織中的表達(dá)模式,分析了哈維氏弧菌（Vibrio harveyi）刺激下三個(gè)免疫基因在3個(gè)主要免疫組織中的表達(dá)規(guī)律,并結(jié)合基因序列及進(jìn)化特征,初步揭示了三個(gè)基因在半滑舌鰨免疫防御系統(tǒng)中的作用。同時(shí),本文還驗(yàn)... 

【文章來源】：上海海洋大學(xué)上海市

【文章頁數(shù)】：68 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

半滑舌鰨TNF-α1和TNF-α2cDNA與基因組比對(duì)Fig.2-2TheTNF-α1andTNF-α2cDNAsequencesanddeducedaminoacidsinCynoglossus.

上海海洋大學(xué)碩士畢業(yè)論文x(2)-[QEKHL]-[LIVMGT]-x-PA [LIVMFY] 位于 119-135），TNF-α2 氨基酸則存在 6 個(gè)蛋白激酶 C 磷酸化位點(diǎn)（分別位于 26-28，30-32，82-84，101-103，143-145，166-168），3 個(gè)酰基化位點(diǎn)（分別位于 93-98，111-116，177-182），和 1 個(gè)TNF 超家族標(biāo)簽（位于 128-144）�？缒ゎA(yù)測(cè)結(jié)果顯示 TNF-α1 和 TNF-α1 氨基酸均具有 1 個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)區(qū)（分別位于 35-54 和 33-52）。不同物種 TNF-α 氨基酸同源分析結(jié)果顯示, TNF-α1 和 TNF-α2 均具有 1 個(gè) TNF-α 轉(zhuǎn)移酶切位點(diǎn)以及 2 個(gè)保守的半胱氨酸殘基（圖 2-3）。同時(shí) TNF-α1 和 TNF-α2 與哺乳類、兩棲類以及硬骨魚類相似性分別為 38%~61%和 35%~68%，兩種 TNF-α 均與硬骨魚類相似性較高。系統(tǒng)進(jìn)化分析與不同物種氨基酸同源分析相一致，結(jié)果顯示半滑舌鰨 TNF-α1 和 TNF-α2 與其他硬骨魚類 TNF-α 聚類為一支，其他物種 TNF-α 與 LT 聚類為一支（圖 2-4）。

圖 2-4 半滑舌鰨與其他物種 TNF-α 進(jìn)化樹Fig.3 Phylogenetic analysis of Cynoglossus semilaevis CD40 with other reported CD40s注 ： Cynoglossus semilaevis: 半 滑 舌 鰨 ; Dicentrarchus labrax 鱸 魚 AAZ20770.1,Oplegnathus fasciatus 條石鯛 ACM69339.1, Epinephelus coioides 點(diǎn)帶石斑 AEH59795.1 andAEH59794.1, Pagrus major 真鯛 AAP76392.1, Sparus aurata 金頭鯛 AJ413189, Larimichthyscrocea 大黃魚 KKF31855.1, Scophthalmus maximus 大菱鲆 ACN41911.1, Paralichthys olivaceus牙鲆 BAA94969.1, Salmo salar 大西洋鮭 ABG91799.1 and ABG91800.1, Danio rerio 斑馬魚AB183467.1, Homo sapiens 人類 EAX03424 and BAA00064.1, Oryctolagus cuniculus 家兔AAA31483.1, Mus musculus 小鼠 AAC82484.1, Rattus norvegicus 褐鼠 AAI07672.1, Equuscaballus 馬 NP001075288.2, Bos Taurus 牛 AAI34756.1, Sus scrofa 野豬 CAN59689.1.2.2.3 TNF-α1 和 TNF-α2 表達(dá)模式分析qRT-PCR 表達(dá)結(jié)果顯示，TNF-α1 和 TNF-α2 在半滑舌鰨各組織中都有表達(dá)，其中 TNF-α1 在肝臟和脾臟中相對(duì)表達(dá)量較高，TNF-α2 在脾臟和腎臟中相對(duì)表

【參考文獻(xiàn)】：
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