雜色鮑在高溫和缺氧應激下NF-κB信號通路相關基因的研究
發(fā)布時間:2021-02-26 18:22
雜色鮑(Haliotis diversicolor)屬于腹足綱鮑科(Haliotidae)的單殼海生貝類。是我國東南沿海鮑科中最重要的經濟養(yǎng)殖種類之一。高水溫和缺氧,不僅會造成雜色鮑的大量死亡,同時也會對鮑魚養(yǎng)殖業(yè)的健康發(fā)展產生較大的影響。通常情況下,機體會通過自身的調節(jié)來適應這些不利的環(huán)境條件的變化。由于雜色鮑缺乏獲得性免疫系統(tǒng),因此這一適應的過程在很大程度上就依賴于機體的先天免疫系統(tǒng)。作為參與先天免疫調節(jié)的重要信號通路,NF-κB信號通路也必然在這一過程中發(fā)揮著至關重要的作用。本研究利用SMART-RACE技術,同時依托于簡并引物的擴增以及轉錄組EST數據庫的查找成功克隆獲得4條參與到NF-κB信號通路中的先天免疫調控相關基因:核因子κB抑制因子(NF-kappa-B inhibitor,IκB)、Akirin2、酪氨酸3-加單氧酶/色氨酸5-加單氧酶激活蛋白ζ(Tyrosine 3/Tryptophan 5 monooxygenase activation protein zeta,14-3-3ζ)、腦富集的Ras蛋白同源體(Ras homologenriched in brai...
【文章來源】:集美大學福建省
【文章頁數】:96 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
NF-κB/Rel和IκB蛋白家族(Haydenetal.,2008)
圖 1.2 NF-κB 信號通路的經典途徑的和非經典途徑(Bonizzi 等,2004)。(a) 經典途徑;(b) 非經典途徑。在靜息狀態(tài)下的細胞質中,NF-κB 與其抑制蛋白 IκB 結合,由于核定位信號(NL掩蓋而處于非活性狀態(tài)。在經典途徑中,外界的應激源可以被位于細胞膜上的 Toll體(Toll-Like Receptor,TLR)所識別,此外,這些刺激信號也可以分別由腫瘤壞死 α(Tumor Necrosis Factor α,TNF-α)和白細胞介素-1(Interleukin-1,IL-1)來介導。類型的 TLRs 可以識別不同病原表面的病原體相關的分子模式(Pathogen Associaolecular Patterns,PAMPs),并將它們傳遞給接頭的髓樣細胞分化因子 88(Myeifferentiation Factor 88,MyD88)以及腫瘤壞死因子受體相關因子 6(Tumor Necrosis Faeceptor-Associated Factor 6,TRAF6)[34];對于由 TNF-α 介導的信號傳遞過程,TNF-α與其特異的跨膜受體進行結合,然后外界的刺激信號被傳遞給 TRAF2;與 TNF-α 相似L-1 的介導也是首先要與其特異的受體進行結合,并以此來激活 MyD88,隨后再經 1體連接酶的作用將刺激信號傳遞給 TRAF6。無論是 TRAF2 還是 TRAF6 均可以通過激F-κB 誘導激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase Kinase 14,NIK)的方式來激[66]
但同時也存在著很大的局限性。以上這些研究都是局限在軟體動物在抵御病及鹽度脅迫時,NF-κB 信號通路的部分相關基因的調節(jié)機制。但是眾所周知,海陸地環(huán)境相比更為復雜,不僅病菌的感染,其他的一些應激源,如:水體溫度過溶氧量過低等因素都會對海洋生物的生存產生很大威脅。因此,闡明在不同環(huán)境下 NF-κB 信號通路對海洋軟體動物的免疫調節(jié)機制,不僅可以為我們研究海洋軟免疫相關基因提供重要的信息,還可以為研究海洋軟體動物應對不同環(huán)境因子應機制提供重要的線索。 本研究的內容和目的意義.1 研究的內容)通過篩選雜色鮑 NF-κB信號通路相關的 ESTs,采用生物信息學方法分析 ESTs 數 21 個與其相關的基因。通過對相關文獻的參考繪制出雜色鮑中可能的 NF-κB 信(圖 1.3),并對其中的 14-3-3ζ、Akirin2 和 RHEB 采用 RACE 的方法克隆獲得其A。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]雜色鮑同種移植炎癥因子1的克隆及其在應激下的表達[J]. 黃貽濤,蔡秀紅,張子平,王國棟,鄒志華,王淑紅,王藝磊. 水產學報. 2013(06)
[2]擬穴青蟹14-3-3基因全長cDNA的克隆及組織表達分析[J]. 舒妙安,張龍韜,徐賓朋,胡杭嬌,郭曉令. 水產學報. 2012(08)
[3]溫度對雜色鮑不同群體生長率與存活率的影響[J]. 游偉偉,林煥陽,駱軒,王德祥,林壯炳,柯才煥. 臺灣海峽. 2011(04)
[4]雜色鮑的遺傳育種研究進展[J]. 柯才煥,游偉偉. 廈門大學學報(自然科學版). 2011(02)
[5]中國海洋溢油污染現狀及其生態(tài)影響研究[J]. 王傳遠,賀世杰,李延太,侯西勇,楊翠云. 海洋科學. 2009(06)
[6]雜色鮑對高溫和低鹽耐受力的初步研究[J]. 劉賢德,閆玉華,王志勇,蔡明夷,柯才煥. 集美大學學報(自然科學版). 2008(04)
[7]14-3-3蛋白功能研究進展[J]. 曾妍,鄭志紅,楊磊. 現代腫瘤醫(yī)學. 2008(07)
[8]東海赤潮高發(fā)區(qū)春季溶解氧和pH分布特征及影響因素探討[J]. 石曉勇,王修林,陸茸,孫霞. 海洋與湖沼. 2005(05)
[9]日本對蝦精巢和卵巢全長cDNA文庫的構建[J]. 王藝磊,張子平. 動物學雜志. 2003(02)
[10]水體富營養(yǎng)化及其防治技術研究進展[J]. 錢大富,馬靜穎,洪小平. 青海大學學報(自然科學版). 2002(01)
博士論文
[1]HPD、NLK調控NF-kB通路和TGFβ通路及機制研究[D]. 張力民.中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院 2012
[2]刺參Apostichopus japonicus (Selenka)對溫度脅迫響應分子機理的基礎研究[D]. 趙歡.中國科學院研究生院(海洋研究所) 2011
本文編號:3052982
【文章來源】:集美大學福建省
【文章頁數】:96 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
NF-κB/Rel和IκB蛋白家族(Haydenetal.,2008)
圖 1.2 NF-κB 信號通路的經典途徑的和非經典途徑(Bonizzi 等,2004)。(a) 經典途徑;(b) 非經典途徑。在靜息狀態(tài)下的細胞質中,NF-κB 與其抑制蛋白 IκB 結合,由于核定位信號(NL掩蓋而處于非活性狀態(tài)。在經典途徑中,外界的應激源可以被位于細胞膜上的 Toll體(Toll-Like Receptor,TLR)所識別,此外,這些刺激信號也可以分別由腫瘤壞死 α(Tumor Necrosis Factor α,TNF-α)和白細胞介素-1(Interleukin-1,IL-1)來介導。類型的 TLRs 可以識別不同病原表面的病原體相關的分子模式(Pathogen Associaolecular Patterns,PAMPs),并將它們傳遞給接頭的髓樣細胞分化因子 88(Myeifferentiation Factor 88,MyD88)以及腫瘤壞死因子受體相關因子 6(Tumor Necrosis Faeceptor-Associated Factor 6,TRAF6)[34];對于由 TNF-α 介導的信號傳遞過程,TNF-α與其特異的跨膜受體進行結合,然后外界的刺激信號被傳遞給 TRAF2;與 TNF-α 相似L-1 的介導也是首先要與其特異的受體進行結合,并以此來激活 MyD88,隨后再經 1體連接酶的作用將刺激信號傳遞給 TRAF6。無論是 TRAF2 還是 TRAF6 均可以通過激F-κB 誘導激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase Kinase 14,NIK)的方式來激[66]
但同時也存在著很大的局限性。以上這些研究都是局限在軟體動物在抵御病及鹽度脅迫時,NF-κB 信號通路的部分相關基因的調節(jié)機制。但是眾所周知,海陸地環(huán)境相比更為復雜,不僅病菌的感染,其他的一些應激源,如:水體溫度過溶氧量過低等因素都會對海洋生物的生存產生很大威脅。因此,闡明在不同環(huán)境下 NF-κB 信號通路對海洋軟體動物的免疫調節(jié)機制,不僅可以為我們研究海洋軟免疫相關基因提供重要的信息,還可以為研究海洋軟體動物應對不同環(huán)境因子應機制提供重要的線索。 本研究的內容和目的意義.1 研究的內容)通過篩選雜色鮑 NF-κB信號通路相關的 ESTs,采用生物信息學方法分析 ESTs 數 21 個與其相關的基因。通過對相關文獻的參考繪制出雜色鮑中可能的 NF-κB 信(圖 1.3),并對其中的 14-3-3ζ、Akirin2 和 RHEB 采用 RACE 的方法克隆獲得其A。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]雜色鮑同種移植炎癥因子1的克隆及其在應激下的表達[J]. 黃貽濤,蔡秀紅,張子平,王國棟,鄒志華,王淑紅,王藝磊. 水產學報. 2013(06)
[2]擬穴青蟹14-3-3基因全長cDNA的克隆及組織表達分析[J]. 舒妙安,張龍韜,徐賓朋,胡杭嬌,郭曉令. 水產學報. 2012(08)
[3]溫度對雜色鮑不同群體生長率與存活率的影響[J]. 游偉偉,林煥陽,駱軒,王德祥,林壯炳,柯才煥. 臺灣海峽. 2011(04)
[4]雜色鮑的遺傳育種研究進展[J]. 柯才煥,游偉偉. 廈門大學學報(自然科學版). 2011(02)
[5]中國海洋溢油污染現狀及其生態(tài)影響研究[J]. 王傳遠,賀世杰,李延太,侯西勇,楊翠云. 海洋科學. 2009(06)
[6]雜色鮑對高溫和低鹽耐受力的初步研究[J]. 劉賢德,閆玉華,王志勇,蔡明夷,柯才煥. 集美大學學報(自然科學版). 2008(04)
[7]14-3-3蛋白功能研究進展[J]. 曾妍,鄭志紅,楊磊. 現代腫瘤醫(yī)學. 2008(07)
[8]東海赤潮高發(fā)區(qū)春季溶解氧和pH分布特征及影響因素探討[J]. 石曉勇,王修林,陸茸,孫霞. 海洋與湖沼. 2005(05)
[9]日本對蝦精巢和卵巢全長cDNA文庫的構建[J]. 王藝磊,張子平. 動物學雜志. 2003(02)
[10]水體富營養(yǎng)化及其防治技術研究進展[J]. 錢大富,馬靜穎,洪小平. 青海大學學報(自然科學版). 2002(01)
博士論文
[1]HPD、NLK調控NF-kB通路和TGFβ通路及機制研究[D]. 張力民.中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院 2012
[2]刺參Apostichopus japonicus (Selenka)對溫度脅迫響應分子機理的基礎研究[D]. 趙歡.中國科學院研究生院(海洋研究所) 2011
本文編號:3052982
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