發(fā)布時間：2021-01-23 03:41

　　卵形鯧鲹（Trachinotus Ovatus）是一種中上層暖水性魚類,生長速度快,肉質鮮美,營養(yǎng)價值高,已成為中國南方地區(qū)主要的海水養(yǎng)殖品種之一。由于暴雨和臺風等極端天氣經(jīng)常導致池塘和海灣中的鹽度急劇下降,嚴重影響卵形鯧鲹的生長和生存。因此,研究卵形鯧鲹在鹽度脅迫下的滲透壓調節(jié)機制是必要的。本研究通過轉錄組測序技術對慢性鹽度脅迫下卵形鯧鲹的鰓進行分析,得到顯著差異表達基因和代謝通路。在急性鹽度脅迫下,本研究首先對血清中的滲透壓、Na+/Cl-離子濃度、皮質醇（COR）和催乳素（PRL）進行測定。其次還對鰓中的Na+/K+-ATPase（NKA）進行測定。最后,從轉錄組數(shù)據(jù)中與鹽度相關顯著差異表達基因篩選出NKAα1、NKCC1a和AQP1a的基因序列,研究它們在急性鹽度脅迫下對卵形鯧鲹滲透調節(jié)的影響。本文的主要結果如下:1.利用轉錄組測序技術構建了與卵形鯧鲹鹽度適應相關的轉錄組數(shù)據(jù)庫,共獲得410,071,902 raw reads。過濾和去除低質量的reads得到高質量的405,814,464reads,將所得的Unigene對比到數(shù)據(jù)庫中,注釋到38,437個Unigene,37... 

【文章來源】：上海海洋大學上海市

【文章頁數(shù)】：105 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

轉錄組測序流程圖

圖 2-2 信息分析流程Figure 2-2 Information analysis process表達注釋得到的 Unigene 序列通過 blastx 與 Nr、Swissprot、KEGG庫進行比對（evalue<1e﹣5視為顯著性），獲得相似性最高白的功能對 Unigene 進行蛋白功能注釋、pathway 注釋、Cology（GO）功能注釋等[56]。表達基因鑒定wtie 2 程序[57]將每個文庫中的高質量 reads 映射到從頭裝對來自比對的映射讀數(shù)進行計數(shù)，然后使用 RSEMV1.2.1M（每千萬堿基對測序的轉錄物序列的片段每千堿基的預

圖 2-3 卵形鯧鲹鰓組織總 RNA 電泳圖r 5000; 1，2，3：對應 SL-1，SL-2 和 SL-3；4，5，6：對應 MS-1，MS-2 和 MS-3；7，89：對應 SN-1，SN-2 和 SN-3Figure 2-3 Electrophoretic pattern of total RNA in Trachinotus ovatus gillser 5000; 1，2，3：Correspondence SL-1，SL-2 and SL-3；4，5，6：Correspondence MS-1MS-2 and MS-3；7，8，9：Correspondence SN-1，SN-2 and SN-3

【參考文獻】：
期刊論文
[1]卵形鯧鲹MHCⅡβ基因的克隆與表達分析[J]. 于文博,朱克誠,郭華陽,張楠,孫瀟瀟,吳娜,張殿昌.  南方水產(chǎn)科學. 2017(04)
[2]刀鱭水通道蛋白1的分子克隆及高鹽作用下的表達分析[J]. 王美垚,楊健,徐跑,徐鋼春,徐東坡,尤洋,劉凱,段金榮,周彥鋒,方弟安,張敏瑩,俞振飛.  中國水產(chǎn)科學. 2017(03)
[3]轉錄組學技術在水產(chǎn)動物研究中的運用[J]. 羅輝,葉華,肖世俊,鄭曙明,王曉清,王志勇.  水產(chǎn)學報. 2015(04)
[4]卵形鯧鲹育種群體遺傳多樣性分析[J]. 孫立元,郭華陽,朱彩艷,馬振華,江世貴,張殿昌.  南方水產(chǎn)科學. 2014(02)
[5]鹽度脅迫及晝夜變化對鯔魚幼魚消化酶活力的影響[J]. 于娜,李加兒,區(qū)又君,范春燕,張建生.  南方水產(chǎn)科學. 2011(06)
[6]薩羅羅非魚NKCC1α基因cDNA克隆及mRNA組織表達差異[J]. 范武江,李思發(fā).  動物學研究. 2010(06)
[7]魚類的非特異性免疫概述[J]. 李新文,呂延玲.  黑龍江水產(chǎn). 2010(02)
[8]半滑舌鰨幼魚消化酶同功酶譜初步研究[J]. 田相利,任曉偉,董雙林,房景輝.  生物技術通報. 2008(S1)
[9]鹽度對施氏鱘幼魚消化酶活力的影響[J]. 莊平,章龍珍,田宏杰,趙峰,宋超.  中國水產(chǎn)科學. 2008(02)
[10]NPA motif在水通道蛋白AQP1表達和轉水功能中的重要性[J]. 姜勇,麻彤輝.  科學通報. 2007(04)

博士論文
[1]黃鱔性別分化相關候選基因的篩選及相關功能研究[D]. 丁煒東.南京農(nóng)業(yè)大學 2016

碩士論文
[1]應用TALEN技術敲除斑馬魚IDH基因及突變體篩選[D]. 熊小杰.南方醫(yī)科大學 2016



本文編號：2994478