縊蟶（Sinonovacula constricta）作為我國四大養(yǎng)殖貝類之一,在水產(chǎn)養(yǎng)殖中占據(jù)了重要的經(jīng)濟地位。對縊蟶生長相關基因進行研究,有助于縊蟶的良種選育,是提高縊蟶養(yǎng)殖經(jīng)濟效益的重要途徑。類胰島素相關多肽是類胰島素超家族的重要成員之一,在生物體生長發(fā)育及代謝調(diào)控中發(fā)揮了重要作用。本研究建立了縊蟶發(fā)育轉(zhuǎn)錄組文庫,同時獲得了三個類胰島素相關多肽（insulin-like peptide,ILP）基因。分析了ILPs基因的時空表達特征,初步探討了其在生長發(fā)育過程中的生物學功能。1.縊蟶發(fā)育轉(zhuǎn)錄組特征分析,基因注釋及變態(tài)相關基因分析采用新一代Illumina HiSeq 2000高通量測序技術,首次構建了縊蟶發(fā)育轉(zhuǎn)錄組文庫,包括卵裂期、擔輪幼蟲期、D型期、殼頂幼蟲期、匍匐期和稚貝期,共拼接得到了249795個短片段。長度在201bp到36941bp之間,平均為585bp。其中最長的注釋基因是Nesprin-1（11087個氨基酸）。經(jīng)過對比,在NCBI Nr、COG、Swiss-Prot和KEGG四個程序中分別注釋了21920（8.78%）、8837（3.54%）、14036（5.6... 

【文章來源】：上海海洋大學上海市

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【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

縊蟶發(fā)育轉(zhuǎn)錄組基因片段組裝長度分布圖

表 2-2：縊蟶發(fā)育轉(zhuǎn)錄組拼接基因片段 BLAST 結果Table2-2: BLAST analysis of non-redundant unigenes against public databases.Database Number of annotated unigenes Percentage of annotated unigenesNrCOGSwiss-ProtKEGG21,9208,83714,03615,97895.85%38.64%61.37%69.86%

12圖 2-3：縊蟶八個變態(tài)相關基因發(fā)育時期表達分布圖-3: Comparison of expression values of eight genes in different developmental stagecta. (E: embryos, T: trochophores, V: veliger larvae, U: umbo larvae, C: creeping larvjuveniles) by RNA-Seq and real-time RT-PCR analyses.

【參考文獻】：
期刊論文
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碩士論文
[1]哲羅鮭胰島素樣生長因子Ⅱ原核表達、多克隆抗體的制備及組織表達分析[D]. 吳秀梅.上海海洋大學 2015
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本文編號：2990722