大黃魚(yú)三種補(bǔ)體調(diào)節(jié)因子的鑒定及表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-01-16 06:12
大黃魚(yú)(Larimichthys crocea),隸屬鱸形目、石首魚(yú)科(Sciaenidae),曾廣泛分布于中國(guó)東海、南海以及黃海南部,是我國(guó)特有的地方性魚(yú)類。大黃魚(yú)現(xiàn)已發(fā)展成為我國(guó)海水網(wǎng)箱養(yǎng)殖量最大的魚(yú)種,具有很高的經(jīng)濟(jì)效益。近年來(lái),由弧菌屬細(xì)菌引起的弧菌病呈爆發(fā)趨勢(shì)。該病傳播速度快、死亡率高,對(duì)大黃魚(yú)養(yǎng)殖業(yè)造成了嚴(yán)重沖擊。補(bǔ)體是魚(yú)類免疫系統(tǒng)最重要的組成部分,具有識(shí)別和消除外來(lái)病原體,激活免疫細(xì)胞,調(diào)控獲得性免疫等功能。在免疫組織中,補(bǔ)體調(diào)節(jié)因子大約占據(jù)了補(bǔ)體成分的二分之一,當(dāng)受到外界病原刺激時(shí)會(huì)迅速活化為補(bǔ)體成分,并且進(jìn)一步聚合形成酶復(fù)合物發(fā)揮一系列免疫效應(yīng)。本文以大黃魚(yú)為對(duì)象研究補(bǔ)體調(diào)節(jié)因子CFH、CFHR1、CFHR2在大黃魚(yú)組織中的表達(dá)特異性,并通過(guò)溶藻弧菌侵染大黃魚(yú)實(shí)驗(yàn)研究補(bǔ)體調(diào)節(jié)基因的急相反應(yīng),對(duì)基因序列進(jìn)行了生物信息學(xué)和系統(tǒng)進(jìn)化分析,并對(duì)功能進(jìn)行初步探索。一、從大黃魚(yú)基因數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得三種補(bǔ)體調(diào)節(jié)因子cDNA序列:L.c-cfh cDNA全長(zhǎng)1332bp,編碼443個(gè)氨基酸,多肽相對(duì)分子質(zhì)量為49.96KDa,等電點(diǎn)為6.66,GenBank登錄號(hào)為KP710858;L....
【文章來(lái)源】:浙江海洋大學(xué)浙江省
【文章頁(yè)數(shù)】:73 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
魚(yú)類補(bǔ)體系統(tǒng)的激活途徑(引自王志平)
圖 1-2 RCA 家族主要成員及分類(引自王菲)Fig. 1-2 The RCA family genes and their classify.1.4.2 CFH 及其相關(guān)蛋白的研究進(jìn)展CFH 是 RCA 家族的重要成員,也是替代途徑中最重要的鑒別成分,CFH 能與胞膜結(jié)合形成膜結(jié)合蛋白識(shí)別自身與外源細(xì)胞[53]。它在 C3b 的表面有多個(gè)結(jié)合位點(diǎn)在體液中和細(xì)胞表面都能發(fā)揮作用,能夠有效地抑制 factor B 與 C3b 結(jié)合形成 C3 化酶。它既可以在液相中發(fā)揮作用,還能在細(xì)胞表面調(diào)節(jié)補(bǔ)體的激活。此外在替代徑中還可以促進(jìn) CFI 有效酶解 C3b,進(jìn)一步阻止 C3 轉(zhuǎn)化酶的形成[54]。在人體中,些補(bǔ)體調(diào)節(jié)因子的基因都緊密連鎖在 1 號(hào)染色體的長(zhǎng)臂上(1q32)[55],CFHR1-5 基因位于 CFH 基因下游,相互之間具有很高的同源性,而且它們主要都在肝臟中表達(dá)受到外源病菌侵襲后,魚(yú)類肝臟能快速作出免疫應(yīng)答,大量合成補(bǔ)體調(diào)節(jié)因子 CF
圖 2-1 用于序列擴(kuò)增的肝組織的總 RNA 電泳圖ctrophoresis of extracted total RNA from the liver of L體調(diào)節(jié)因子 CFH(Lc-cfh)基因全長(zhǎng) CDNA 的全基因組數(shù)據(jù)庫(kù),獲得了 L.c-cfh 序列,基因’端的起始密碼子(ATG)和 3’端的終止密碼子k 數(shù)據(jù)庫(kù),數(shù)據(jù)庫(kù)的登錄號(hào)為 KP710858。利讀框進(jìn)行搜索,發(fā)現(xiàn)其 ORF(open reading fra端含有 24 個(gè)氨基酸的信號(hào)肽序列(用紅色下劃 預(yù)測(cè)的多肽的分子量約為 49.96kDa,編碼一,等電點(diǎn)為 6.66。使用 DNAMAN 得到其多肽 2-2 所示,其中含有 100 個(gè)疏水氨基酸 64 個(gè)列存在 1 個(gè)潛在的 N-糖基化位點(diǎn)(Asn237)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]補(bǔ)體系統(tǒng)的進(jìn)化[J]. 余英才,張純,夏循禮,梁永紅. 生命科學(xué). 2012(04)
[2]魚(yú)類補(bǔ)體系統(tǒng)成分及補(bǔ)體特異性和功能的研究進(jìn)展[J]. 王志平,張士璀,王光鋒. 水生生物學(xué)報(bào). 2008(05)
[3]魚(yú)類補(bǔ)體系統(tǒng)的研究進(jìn)展[J]. 張穎,劉洪柏,盧彤巖,范兆廷. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2005(06)
[4]一種含多個(gè)CCP結(jié)構(gòu)域的新型基因的克隆及生物學(xué)特性初探[J]. 韓聚強(qiáng),方言,嚴(yán)景華,焦園園,呂秋軍,黃翠芬,楊曉,葉棋濃. 中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志. 2005(12)
[5]魚(yú)類免疫機(jī)制及其影響因子[J]. 張艷秋,詹勇,許梓榮. 水產(chǎn)養(yǎng)殖. 2005(03)
[6]海水網(wǎng)箱養(yǎng)殖大黃魚(yú)弧菌病的流行病學(xué)研究[J]. 金珊,王國(guó)良,趙青松,鄭天倫,陳寅兒. 水產(chǎn)科學(xué). 2005(01)
[7]三聯(lián)疫苗對(duì)大黃魚(yú)常見(jiàn)細(xì)菌性疾病免疫保護(hù)的實(shí)驗(yàn)研究[J]. 吳志鵬,王三英. 廈門大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2004(01)
[8]大黃魚(yú)庫(kù)道蟲(chóng)病的初步研究[J]. 簡(jiǎn)紀(jì)常,吳灶和. 湛江海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2003(01)
[9]魚(yú)類免疫學(xué)研究進(jìn)展[J]. 唐玫,馬廣智,徐軍. 免疫學(xué)雜志. 2002(S1)
[10]環(huán)境脅迫對(duì)魚(yú)類免疫系統(tǒng)影響的研究概況[J]. 王文博,李愛(ài)華. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2002(04)
本文編號(hào):2980301
【文章來(lái)源】:浙江海洋大學(xué)浙江省
【文章頁(yè)數(shù)】:73 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
魚(yú)類補(bǔ)體系統(tǒng)的激活途徑(引自王志平)
圖 1-2 RCA 家族主要成員及分類(引自王菲)Fig. 1-2 The RCA family genes and their classify.1.4.2 CFH 及其相關(guān)蛋白的研究進(jìn)展CFH 是 RCA 家族的重要成員,也是替代途徑中最重要的鑒別成分,CFH 能與胞膜結(jié)合形成膜結(jié)合蛋白識(shí)別自身與外源細(xì)胞[53]。它在 C3b 的表面有多個(gè)結(jié)合位點(diǎn)在體液中和細(xì)胞表面都能發(fā)揮作用,能夠有效地抑制 factor B 與 C3b 結(jié)合形成 C3 化酶。它既可以在液相中發(fā)揮作用,還能在細(xì)胞表面調(diào)節(jié)補(bǔ)體的激活。此外在替代徑中還可以促進(jìn) CFI 有效酶解 C3b,進(jìn)一步阻止 C3 轉(zhuǎn)化酶的形成[54]。在人體中,些補(bǔ)體調(diào)節(jié)因子的基因都緊密連鎖在 1 號(hào)染色體的長(zhǎng)臂上(1q32)[55],CFHR1-5 基因位于 CFH 基因下游,相互之間具有很高的同源性,而且它們主要都在肝臟中表達(dá)受到外源病菌侵襲后,魚(yú)類肝臟能快速作出免疫應(yīng)答,大量合成補(bǔ)體調(diào)節(jié)因子 CF
圖 2-1 用于序列擴(kuò)增的肝組織的總 RNA 電泳圖ctrophoresis of extracted total RNA from the liver of L體調(diào)節(jié)因子 CFH(Lc-cfh)基因全長(zhǎng) CDNA 的全基因組數(shù)據(jù)庫(kù),獲得了 L.c-cfh 序列,基因’端的起始密碼子(ATG)和 3’端的終止密碼子k 數(shù)據(jù)庫(kù),數(shù)據(jù)庫(kù)的登錄號(hào)為 KP710858。利讀框進(jìn)行搜索,發(fā)現(xiàn)其 ORF(open reading fra端含有 24 個(gè)氨基酸的信號(hào)肽序列(用紅色下劃 預(yù)測(cè)的多肽的分子量約為 49.96kDa,編碼一,等電點(diǎn)為 6.66。使用 DNAMAN 得到其多肽 2-2 所示,其中含有 100 個(gè)疏水氨基酸 64 個(gè)列存在 1 個(gè)潛在的 N-糖基化位點(diǎn)(Asn237)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]補(bǔ)體系統(tǒng)的進(jìn)化[J]. 余英才,張純,夏循禮,梁永紅. 生命科學(xué). 2012(04)
[2]魚(yú)類補(bǔ)體系統(tǒng)成分及補(bǔ)體特異性和功能的研究進(jìn)展[J]. 王志平,張士璀,王光鋒. 水生生物學(xué)報(bào). 2008(05)
[3]魚(yú)類補(bǔ)體系統(tǒng)的研究進(jìn)展[J]. 張穎,劉洪柏,盧彤巖,范兆廷. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2005(06)
[4]一種含多個(gè)CCP結(jié)構(gòu)域的新型基因的克隆及生物學(xué)特性初探[J]. 韓聚強(qiáng),方言,嚴(yán)景華,焦園園,呂秋軍,黃翠芬,楊曉,葉棋濃. 中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志. 2005(12)
[5]魚(yú)類免疫機(jī)制及其影響因子[J]. 張艷秋,詹勇,許梓榮. 水產(chǎn)養(yǎng)殖. 2005(03)
[6]海水網(wǎng)箱養(yǎng)殖大黃魚(yú)弧菌病的流行病學(xué)研究[J]. 金珊,王國(guó)良,趙青松,鄭天倫,陳寅兒. 水產(chǎn)科學(xué). 2005(01)
[7]三聯(lián)疫苗對(duì)大黃魚(yú)常見(jiàn)細(xì)菌性疾病免疫保護(hù)的實(shí)驗(yàn)研究[J]. 吳志鵬,王三英. 廈門大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2004(01)
[8]大黃魚(yú)庫(kù)道蟲(chóng)病的初步研究[J]. 簡(jiǎn)紀(jì)常,吳灶和. 湛江海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2003(01)
[9]魚(yú)類免疫學(xué)研究進(jìn)展[J]. 唐玫,馬廣智,徐軍. 免疫學(xué)雜志. 2002(S1)
[10]環(huán)境脅迫對(duì)魚(yú)類免疫系統(tǒng)影響的研究概況[J]. 王文博,李愛(ài)華. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2002(04)
本文編號(hào):2980301
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