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MnMats,MnTaiman及一種高變C-型凝集素在日本沼蝦先天免疫中的功能研究

發(fā)布時(shí)間:2020-09-09 18:15
   日本沼蝦(Macrobrachium nipponense)俗稱河蝦或青蝦,是一種重要的淡水養(yǎng)殖蝦類。其適應(yīng)能力強(qiáng),食性雜,繁殖力強(qiáng),廣泛分布于我國(guó)大小水域,是我國(guó)重要的養(yǎng)殖蝦類之一。河蝦肉質(zhì)鮮美,營(yíng)養(yǎng)豐富,在我國(guó)水產(chǎn)品市場(chǎng)廣受歡迎。但隨著現(xiàn)代工業(yè)化進(jìn)程的迅速發(fā)展,各地水域水質(zhì)均受到不同程度破壞,加上養(yǎng)殖業(yè)自身發(fā)展的不健康和不規(guī)范,進(jìn)一步加劇了養(yǎng)殖水域水環(huán)境的惡化,導(dǎo)致包括河蝦在內(nèi)的咸淡水經(jīng)濟(jì)蝦類養(yǎng)殖受多種疾病困擾,而研究河蝦先天免疫防御機(jī)制,可以對(duì)生產(chǎn)實(shí)踐中的疾病防控進(jìn)行有效指導(dǎo)。模式識(shí)別受體和免疫信號(hào)途徑作為無(wú)脊椎動(dòng)物先天免疫系統(tǒng)的重要組成部分,在無(wú)脊椎動(dòng)物對(duì)抗病原微生物感染過(guò)程發(fā)揮重要作用。本論文首先對(duì)日本沼蝦Hippo信號(hào)通路中Mats基因進(jìn)行了研究。Yorkie是Hippo信號(hào)通路的轉(zhuǎn)錄因子,促進(jìn)Cactus基因(Toll信號(hào)通路)的表達(dá)。而Yorkie作為轉(zhuǎn)錄因子,行使功能時(shí),需要與其它蛋白進(jìn)行互作,Taiman是Yokie的一種互作蛋白,在該論文中,我們對(duì)Taiman基因的選擇性剪切以及在免疫防御中的功能進(jìn)行了初步研究。最后,我們對(duì)發(fā)現(xiàn)的一種高變C-型凝集素(在編碼區(qū),通過(guò)含有不同數(shù)目的重復(fù)單元,增加凝集素多樣性)的功能進(jìn)行了初步研究。1.MnMats基因在日本沼蝦先天免疫中的功能在本研究中,我們發(fā)現(xiàn)并命名了MnMats基因,獲得了其cDNA序列,cDNA全長(zhǎng)為1127bp,開(kāi)放閱讀框(ORF)大小為651bp,編碼217個(gè)氨基酸長(zhǎng)度的蛋白,含有一個(gè)Mob1_phocein結(jié)構(gòu)域。我們研究了其在日本沼蝦中的組織分布情況,發(fā)現(xiàn)其在各個(gè)組織中均有分布,肝胰腺中表達(dá)量最大,而血細(xì)胞中最低。我們進(jìn)一步研究了其在金黃色葡萄球菌/副溶血弧菌刺激時(shí)的表達(dá)模式,發(fā)現(xiàn)金黃色葡萄球菌刺激時(shí),除血細(xì)胞和胃以外,各個(gè)組織MnMats均呈上調(diào)趨勢(shì)。而當(dāng)機(jī)體面對(duì)副溶血弧菌刺激時(shí),除胃以外其他組織中MnMats也均上調(diào)。RNAi敲低MnMats后,發(fā)現(xiàn)多種抗菌肽表達(dá)受到了抑制。這些研究結(jié)果表明,作為Hippo信號(hào)通路中的重要組件,MnMats基因可能通過(guò)抑制Cactus基因的表達(dá),促進(jìn)抗菌肽的表達(dá),從而參與了日本沼蝦先天免疫防御。2.MnTaiman基因在日本沼蝦先天免疫中的功能我們?cè)谌毡菊游r中發(fā)現(xiàn)并命名了MnTaiman基因。日本沼蝦Taiman基因存在四種不同的轉(zhuǎn)錄本。其中最長(zhǎng)的轉(zhuǎn)錄本cDNA全長(zhǎng)為6894 bp,開(kāi)放閱讀框(ORF)全長(zhǎng)為4998 bp,編碼長(zhǎng)度為1666個(gè)氨基酸的蛋白。含有一個(gè)PAS結(jié)構(gòu)域、一個(gè)HLH結(jié)構(gòu)域和一個(gè)PAS_11結(jié)構(gòu)域。半定量進(jìn)行組織分布研究時(shí),發(fā)現(xiàn)MnTaiman基因C末端存在選擇性剪切,產(chǎn)生四種不同的剪切本,命名為TaiA、TaiB、TaiC、TaiD。qRT-PCR結(jié)果表明,MnTai-Total(TaiT)、TaiA、TaiB、及TaiD的組織分布相似,在各個(gè)組織中均有分布,并且在肝胰腺中高表達(dá)。但TaiC在胃組織中高表達(dá)。金黃色葡萄球菌/副溶血弧菌刺激下的表達(dá)模式實(shí)驗(yàn),結(jié)果表明,除血細(xì)胞之外,在其他組織中TaiT及四種轉(zhuǎn)錄本呈現(xiàn)不同的表達(dá)模式。在血細(xì)胞中,病原刺激后基因均呈下調(diào)趨勢(shì)。在河蝦血細(xì)胞中,RNA干擾敲低MnTaiman,金葡萄球菌刺激后24h,ALF1表達(dá)顯著增高。MnTaiman敲低后,副溶血弧菌刺激后24h,ALF1表達(dá)也明顯上調(diào)。根據(jù)已有文獻(xiàn),Taiman和Yorkie互作,而Yorkie調(diào)節(jié)Cactus的表達(dá)。所以我們推測(cè),MnTaiman通過(guò)調(diào)控Cactus的表達(dá),負(fù)調(diào)控Toll信號(hào)通路,從而抑制抗菌肽基因的表達(dá)。3.一種高變C-型凝集素功能研究我們?cè)谌毡菊游r中發(fā)現(xiàn)一種C-型凝集素,由于其編碼區(qū)含有不同數(shù)目的重復(fù)單元,因此,我們命名為repeat lectin-MnRlec。該蛋白含有一個(gè)信號(hào)肽、一個(gè)CLECT結(jié)構(gòu)域,在這兩個(gè)結(jié)構(gòu)域之間包含一個(gè)含有不同數(shù)目重復(fù)單元的區(qū)域,該區(qū)域含有的串聯(lián)重復(fù)可以高達(dá)9個(gè),最少含有一個(gè)串聯(lián)重復(fù)。在基因組上,我們也發(fā)現(xiàn)了含有不同數(shù)目重復(fù)單元的序列,因此我們推測(cè),含有不同數(shù)目重復(fù)單元的凝集素,在基因組復(fù)制過(guò)程中,發(fā)生了滑動(dòng)錯(cuò)配,導(dǎo)致基因多樣性的產(chǎn)生。我們表達(dá)和純化了三種分別含有1個(gè)、2個(gè)、3個(gè)串聯(lián)重復(fù)單元的MnRlec蛋白,命名為MnRlec1、MnRlec2、MnRlec3。對(duì)這三種蛋白進(jìn)行細(xì)菌結(jié)合實(shí)驗(yàn),結(jié)果發(fā)現(xiàn)MnRlec1對(duì)副溶血弧菌的結(jié)合呈現(xiàn)出鈣離子依賴的特征,MnRlec2和MnRlec3對(duì)副溶血弧菌的結(jié)合能力減弱。此外,MnRlec1、MnRlec2以及MnRlec3均表現(xiàn)出對(duì)大腸桿菌的結(jié)合能力,且這種結(jié)合不依賴于鈣離子。通過(guò)我們的研究發(fā)現(xiàn),MnRlec隨著重復(fù)單元的增加,結(jié)合副溶血弧菌的能力減弱,這可能是病原和宿主在進(jìn)化過(guò)程中進(jìn)行博弈的結(jié)果。
【學(xué)位單位】:南京師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:S917.4
【部分圖文】:

電泳圖,日本沼蝦,電泳圖,模板


設(shè)計(jì)特異引物,以日本沼蝦的各個(gè)組織 cDNA(血、心、為模板,使用常規(guī) PCR 擴(kuò)增獲得的四種剪切本的電泳圖。ith gene-specific primers, we gain the four different splicing trTaiA-TaiD) using RT-PCR methods. The cDNA from hemocyts, gills, stomach and intestine of M. nipponense were used as an 的四種剪切體(TaiA、TaiB 、TaiC 和 TaiD)模式圖。五個(gè)外顯子的長(zhǎng)度。

模式圖,剪切體,模式圖,日本沼蝦


圖 3.2. 通過(guò)設(shè)計(jì)特異引物,以日本沼蝦的各個(gè)組織 cDNA(血、心、肝、鰓、胃和腸)為模板,使用常規(guī) PCR 擴(kuò)增獲得的四種剪切本的電泳圖。Fig.3.2. With gene-specific primers, we gain the four different splicing transcripts ofMnTaiman (TaiA-TaiD) using RT-PCR methods. The cDNA from hemocytes, heart,hepatopancreas, gills, stomach and intestine of M. nipponense were used as templates.

氨基酸序列,日本沼蝦,氨基酸序列,cDNA序列


atgattgatcaggagatatataaataaaatttgactcagttaaattacaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa圖.4.1. (A) 日本沼蝦 MnRlec 的 cDNA 序列和預(yù)測(cè)的氨基酸序列。圖中灰色陰影部分為 CLEC 結(jié)構(gòu)域,劃線部分為信號(hào)肽(Signal peptide),彩色陰影表示 6 個(gè)短串聯(lián)重復(fù)單元

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