【摘要】：本文選用10個微衛(wèi)星位點對克氏原螯蝦的半同胞家系進行分析和親子鑒定,首先用10個微衛(wèi)星位點對隨機選取48個克氏原螯蝦個體進行多態(tài)性檢測,計算出48個個體在10個微衛(wèi)星位點基因座上的平均觀測雜合度0.3455,平均期望雜合度為0.6224,平均香農(nóng)指數(shù)為1.1335,平均多態(tài)信息含量是0.5656,根據(jù)檢測結果,獲得了個體之間的遺傳距離并且繪制了 UPGMA聚類分析圖,結果表明基于克氏原螯蝦的這10個微衛(wèi)星位點的多態(tài)性可以測量出各個個體間的遺傳距離,這10個微衛(wèi)星位點可以應用于克氏原螯蝦遺傳多樣性的分析。在半同胞家系分析中,人工建立半同胞家系,對隨機選取的成年的三個雌蝦和兩個公蝦放入同一個水缸內(nèi)讓其自由交配,三個雌蝦分別抱卵后,從這三個家系中分別取14、14、15個子代及對應的親本進行3個微衛(wèi)星位點的基因型檢測,對檢測結果利用GERUD2.0軟件分析,顯示第一個半同胞家系內(nèi)的子代最少有兩個父本,第二個半同胞家系內(nèi)的子代最少有三個父本,第三個半同胞家系內(nèi)的子代最少有四個父本,證明了克氏原螯蝦的交配方式是一對多進行的,同時也說明在實驗前,雌蝦已經(jīng)和其他雄蝦交配過。在親子鑒定的實驗中,實驗材料為在半同胞家系實驗中的材料,由于一個雌蝦可以和多個雄蝦進行交配,產(chǎn)生的后代可以有多個父本,1號和2號為可疑父本,3號為第一個母本,從4號到17號為3號的子代,18號為第二個母本,19號到32號為18號的子代,33號為第三個母本,34號到48號為33號的子代。利用CERVUS3.0軟件計算這10個微衛(wèi)星位點的觀測雜合度范圍為0.354-0.896,期望雜合度范圍為0.588-0.807,平均期望雜合度為0.7193,多態(tài)信息含量為0.521-0.767,平均多態(tài)信息含量為0.6662,平均每個位點有5.6個等位基因。測量這10個微衛(wèi)星位點親子排除率是:當兩個親本基因型未知時,則測得每一個位點的親本排除率(E-1P)范圍是0.177-0.417;當一個親本基因型已知時,測得另一個親本的排除率(E-2P)范圍是0.325-0.596;測得一對親本組合的雙親排除率(E-PP)是0.487-0.794,則10個微衛(wèi)星位點的第一親本累計非父排除概率是0.97616685,第二親本的累計非父排除概率是0.99869019,雙親的累計排除概率是0.99998479。進一步的模擬分析,當雙親性別知道時,模擬子代選取10000個,候選母本是3,候選父本是2,親本和子代的模擬配對率為100%;在雙親性別未知時,以100%的鑒定率和95%的置信度標準下,這10個微衛(wèi)星位點可在最多有45個親本并且雙親未知的情況下做親子鑒定,已經(jīng)滿足了大多數(shù)的同塘繁育實驗需求。在親權鑒定時,結果顯示兩個可疑父本都不是這43個子代的親生父本,這43個子代都找到了母本,4號到17號這14個子代的母本是3號個體,19號到32號這14個子代的母本18號個體,34號到48號這15個子代的母本是33號個體。測量這48個克氏原螯蝦的遺傳距離,然后根據(jù)遺傳距離繪制了 UPGMA聚類分析圖也證明了這兩個可疑父本不是仔蝦的生父,親權鑒定結果和UPGNA聚類分析圖相符合,表明這10個微衛(wèi)星位點可以應用于克氏原螯蝦的親子鑒定�；讷@得的三個半同胞家系遺傳分析數(shù)據(jù),本文提出了一種有效的鑒別克氏原螯蝦不同家系的分子標記方法,在前述親子鑒定的實驗中我們得出三個半同胞家系的親本沒有任何關系,是完全獨立的三個半同胞家系,我們用遺傳分析軟件Population軟件分析這三個家系個體之間的遺傳距離并構建UPGMA進化樹,通過Population軟件計算出半同胞家系或全同胞家系個體之間的遺傳距離值域是小于0.579289,若兩個個體之間的遺傳距離小于0.579289,我們則考慮這兩個個體是全同胞關系或者半同胞關系,從而避免了個體之間的近親繁殖,從UPGMA進化樹同樣可以看出來自不同家系的個體聚類在不同分枝上,這個有效的區(qū)分不同家系的個體的方法為克氏原螯蝦的選育和防止近親繁殖提供了理論基礎。
【學位授予單位】：南京農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2015
【分類號】：S917.4
【圖文】：

２．２實驗結果與統(tǒng)計分析逡逑２．２．１實驗結果逡逑對４８個克氏原桯郵個體共進行了邋１０個微衛(wèi)星位點的檢測，圖２－１為引物ＰＣ１Ｇ０７逡逑的ＰＡＧＥ電泳圖譜，圖２－２為引物ＰｃｌＧ２７的ＰＡＧＥ電泳圖譜，圖譜顯示，檢測的４８個逡逑克氏原呡邱個體在送１０個微衛(wèi)星位點多態(tài)性豐富，條帶清晰，易于分辨，結果穩(wěn)定。逡逑＿＾滋？邐２ｉ＇－｜邋ka售’瓣屋Ｉ邐Ｊ塞’置S�！言逦Ｉｔ逦、３餐．输－邋４３－邋４４－逦＇X畺躿摹觥危矗卞濉停�，辶x賢跡玻卞澹校悖歟牽埃芬鋃鑰聳顯瓍縈矢鎏澹ǎ危錚玻擔危錚矗福┑睦┰黿峁義希疲椋紓玻卞澹裕瑁邋澹幔恚穡歟椋媯椋悖幔簦椋锎蟈澹猓幔睿溴澹錚駑澹校悖歟牽埃峰澹穡潁椋恚澹蟈澹媯錚蟈澹危錚玻擔危錚矗稿澹椋睿洌椋觶椋洌酰幔歟簀澹錚駑澹鄭錚慊茫悖茫憒蟈義獻ⅲ海灣邐澹停幔潁耄澹潁澹保擔板搴灣澹保埃板宸直鷸稿澹保擔埃猓皰搴灣澹歟希希猓�。辶x希危錚�；ｅ：邋Ｔｈｅ邋冲ｉ：j澹停幔潁耄澹潁邋澹保擔板澹椋簀澹保擔埃猓穡邋澹保埃板澹椋簀澹歟希希猓穡義希常佩澹灣宥�，－？？邋４塞－４７逦４１逦Ｍ．－辶x賢跡玻玻校悖歟牽玻芬鋃鑰聳顯瓩 郵個體（Ｎｏ．２５－Ｎｏ．４８）的擴增結果逡逑Ｆｉｇ．２－２邋Ｔｈｅ邋ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ邋ｂａｎｄ邋ｏｆ邋ＰｃｌＧ２７邋ｐｒｉｍｅｒ邋ｆｏｒ邋Ｎｏ．２５－Ｎｏ．４８邋ｉｎｄｉｖｉｄｕａｌｓ邋ｏｆＰｒｏｃａｍｂｎｉｓ邋ｃｌａｒｋｉｉ逡逑注！邋Ｍ邋為邋Ｍａｒｋｅｒ，邋１００邋和邋１５０邋分別指邋ｌＯＯｂｐ邋和邋１５０ｂｐ。逡逑Ｎｏｔｅ：邋Ｔｈｅ邋Ｍ邋ｉｓ邋Ｍａｒｋｅｒ

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本文編號：2768568