【摘要】：目前國內(nèi)的凡納濱對蝦親蝦主要來自于國外。我國是養(yǎng)殖凡納濱對蝦的大國,但因苗種品質(zhì)、養(yǎng)殖不當、資金問題等問題,災害頻發(fā)等因素,養(yǎng)殖效益虧損至今影響著我國凡納濱對蝦產(chǎn)業(yè)體系的健康發(fā)展。為了保護與開發(fā)種質(zhì)資源,獲得具有優(yōu)良性狀的新品種。本文對子一代的群體進行了遺傳背景分析,種質(zhì)資源鑒定,并對一些SSR進行生長相關性檢驗,篩選了一些與生長相關的EST-SSR標記。并對部分分子標記進行了體重相關性檢驗。確定群體母系關系。通過對比不同個體mtDNA控制區(qū)部分序列,獲得(VG2Z,VNZ,OSZ,NSZ)4個群體的母系遺傳關系,依最大似然法的遺傳距離比較不同母本間的變異與進化。211條序列平均長度604bp,共檢測到232個簡約信息位點。14個缺失。358個保守位點.281個突變。232個點突變中,共檢測到14個缺失/插入,28轉(zhuǎn)換,36置換。一共檢測到14個單倍型,其中27個親本,共檢測到14個單倍型。子一代VG1Z84個樣本,共檢測到12個單倍型。親代群體單倍型多樣性指數(shù)0.8950,核苷酸多樣性指數(shù)0.1100,平均核苷酸差異數(shù)K65.1。子一代群體單倍型多樣性指數(shù)0.7980,核苷酸多樣性指數(shù)0.1028,平均核苷酸差異數(shù)K60.6。最大似然法計算遺傳距離,親代(母方)群體內(nèi)遺傳距離0.156,子代群體內(nèi)遺傳距離0.134,兩代群體間遺傳距離0.144。比較親代(母方)與其子代的序列,親代(母方)的Hd、pi、k、PL值大于子一代。說明F1群體的遺傳多樣性減小。27個親代(母方)中有5個親代(母方)共3單倍型未在F1檢測到。子一代群體中檢測到1個新的單倍型Hap_8。Hap_8與Hap_7相比,發(fā)生了2個轉(zhuǎn)換和1個插入,該變異位點發(fā)生在非編碼區(qū),發(fā)生了點突變的個體來自于OS群體的自交后代。輔以繁殖數(shù)據(jù),一對一一共確認了8個母本。以11對微衛(wèi)星對子代9個群體的遺傳多樣性評價。11個SSR在9個子一代群體中共檢測到51個等位基因。等位基因數(shù)30~50,有效等位基因數(shù)Ne 22.09~28.39,觀測雜合度Ho 0.32~0.60,期望雜合度He 0.48~0.63。群體內(nèi)近交系數(shù)fis-0.2~0.37。雜交群體Shannon index指數(shù)0.94,小于自交群體1.13,由高到低依次順序為:自交群體親代群體雜交群體。與自交群體相比,雜交群體的多樣性并沒有提高。VNZ與G2Z群體固定指數(shù)F分別為-0.2,-0.08,為負值。其他群體為正值。顯示了G2Z和VNZ雜合子過量與總?cè)后w水平雜合子缺失的現(xiàn)狀。9個群體在11個SSR總體水平上的PIC范圍0.40~0.59�？傮w呈中高度多態(tài)�？�?cè)后w水平近交系數(shù)Fit由高到低順序為:親代群體雜交群體自交群體。親代群體Na與自交后代相比,OSZ,NSZ,G1Z,G2Z分別小于OSQ,NSQ,G1Q,G2Q群體,顯示親代群體一些稀有等位基因在子代中丟失。V101Z(Na)大于V101Q(Na),這可能發(fā)生了變異或多出的等位基因來源于父本。比較自交群體與親代群體Ne與He,結(jié)果表明自交群體與對應親代群體的遺傳多樣性差異不明顯。以Nei's遺傳距離繪制UPGMA進化樹,結(jié)果表明:9個群體間的遺傳距離0.0685~0.6065。VNZ與OSZ遺傳距離最短,優(yōu)先合為一支。G2G1Z與VG2Z合為一支后與VG1Z、NSZ匯合,之后與VNZ和OSZ合為一支,與G1Z和G2Z融合,最后與V101Z融合。V101Z與其他8個群體的遺傳距離都相對較遠。將多態(tài)性良好的EST-SSR引物的基因型與凡納濱對蝦生長性狀相關聯(lián)。采用一般線性模型與最小二乘關聯(lián)性分析,發(fā)現(xiàn)在VG2Z中,利用一般線性模型和最小二乘方差分析,共獲得4個微衛(wèi)星與生長性狀顯著相關。,其中V-16與飽滿度顯著性相關(P=0.10),LVE66F與體重極顯著性相關(P0.1)。V-6與LVE16F與體重顯著性相關(0.10P0.05)。其他標記與體重和飽滿度無關。通過Duncan多重比對結(jié)果發(fā)現(xiàn)LVE16F、LVE70F、V-6各基因型在VG2Z中與體重不存在線性關系,LVE66F中BD基因型個體的體重顯著大于AB/BB/BF個體的體重。但在其他群體中,LVE66F與體重和飽滿度相關性不顯著(P0.05)。用主體間效應模型檢驗12個微衛(wèi)星標記與體重、飽滿度的相關性,確定LVE16F與LVE70F在4個群體中與體重或飽滿度顯著性相關(P0.05)。對LVE16F與LVE70F進行duncan’s多重平均值分析結(jié)果表明:LVE16F、LVE70F各基因型在VG2Z中與體重不存在線性關系,在VNZ中,LVE70F的AB基因型的個體平均體重顯著大于AA基因型的個體。LVE16F的AA,BB的個體的體重和飽滿度顯著大于CC,BC的個體,AA基因型的個體的體重和飽滿度顯著大于AB基因型的個體。LVE70F和LVE16F在VNZ中與體重和飽滿度存在明顯的線性關系。G2Z中,LVE70F,AB,BB個體體重顯著大于BC,CC。AA,AB,BB個體的體重顯著大于CC,CC基因型個體的飽滿度顯著小于AA,AB,BB個體的飽滿度。LVE16F,AC基因型的個體的體重顯著大于BC基因型體重。V101Z中,LVE70F,AB,BB,AB個體的體重顯著大于BC個體,AA個體的飽滿度顯著大于BC個體。LVE16F中,AC基因型的個體體重與飽滿度顯著大于BC個體。LVE16F與LVE70F的等位基因C為隱性,存在C的個體體重比較小。綜上所述,本文為凡納濱對蝦人工育種群體的種質(zhì)檢測,與生長相關分子標記的選擇提供了一些的理論依據(jù),在生產(chǎn)中具有一定的指導意義。
【學位授予單位】：上海海洋大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2017
【分類號】：S917.4

【相似文獻】

相關期刊論文 前10條

1 游奎,劉鷹,楊紅生,劉石林,俞立東;不同光源及光照時間對凡納濱對蝦生長的影響[J];海洋科學;2005年05期

2 林惠山;戚雋淵;喬燕平;;凡納濱對蝦高產(chǎn)養(yǎng)殖水質(zhì)優(yōu)化技術探討[J];水產(chǎn)科技情報;2006年04期

3 衣萌萌;于赫男;林小濤;許忠能;周小壯;;密度脅迫下凡納濱對蝦的行為與生理變化[J];暨南大學學報(自然科學與醫(yī)學版);2012年01期

4 周歧存,丁q，

本文編號：2615187