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硬刺松潘裸鯉亞種與種的線粒體基因組、遺傳多樣性及其繁殖生物學(xué)的初步研究

發(fā)布時(shí)間:2020-03-29 21:04
【摘要】:硬刺松潘裸鯉(Gymnocypris potaninif firmispinatus)為松潘裸鯉(G. potanini)指名亞種,均隸屬于鯉形目、鯉科、裂腹魚(yú)亞科、裸鯉屬,為我國(guó)特有種。2014年2月至2015年9月,在雅礱江一級(jí)支流安寧河和岷江上游分別采集到1244尾硬刺松潘裸鯉和13尾松潘裸鯉樣品,對(duì)2個(gè)物種的線粒體基因組(mtDNA)和遺傳多樣性進(jìn)行了分析,并初步研究了硬刺松潘裸鯉的繁殖生物學(xué)特征。主要研究結(jié)果如下:1.硬刺松潘裸鯉和松潘裸鯉mtDNA序列全長(zhǎng)分別為16680bp和16749bp,呈環(huán)狀,與已報(bào)道的裸鯉屬魚(yú)類相似。與已公布的大多數(shù)魚(yú)類mtDNA的組成與排列類似,硬刺松潘裸鯉和松潘裸鯉mtDNA包括13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因,22個(gè)tRNA基因,兩個(gè)rRNA基因和一個(gè)D-loop控制區(qū)。硬刺松潘裸鯉和松潘裸鯉1ntDNA分別編碼3790個(gè)和3800個(gè)氨基酸。除col起始密碼子為GTG外,其它基因起始密碼子均以ATG; coII, nd4和cytb以T為終止密碼子,其它各基因都均是以TAA或TAG為終止密碼子。硬刺松潘裸鯉和松潘裸鯉mtDNA包括22個(gè)tRNA基因和2個(gè)rRNA基因。tRNA基因序列大小為68-76bp,呈典型的四葉式二級(jí)結(jié)構(gòu),除松潘裸鯉tRNA-Phe比硬刺松潘裸鯉多1對(duì)GC堿基外,其它的tRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)均完全相同。它們的rrnL基因大小均為1681bp,rrnL都在tRNA-Val和tRNA-LeuUUR之間;rrnS基因大小分別為957bp和958bp,在tRNA-Phe和tRNA-Val.之間。基于線粒體DNA氨基酸序列構(gòu)建的ME、ML、NJ和UPGMA4種進(jìn)化樹(shù)分析表明,裸鯉屬魚(yú)類系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系較近,硬刺松潘裸鯉和松潘裸鯉聚為一支,有較近的親緣關(guān)系。2.基于cytb、col基因和D-loop控制區(qū)的遺傳結(jié)構(gòu)及多樣性分析表明,安寧河5個(gè)硬刺松潘裸鯉群體和岷江2個(gè)松潘裸鯉群體基因A+T的平均含量均高于C+G含量,表現(xiàn)出明顯的反G偏倚。cytb、coI基因和D-loop控制區(qū)變異位點(diǎn)分別有43個(gè)、28個(gè)和18個(gè),變異位點(diǎn)轉(zhuǎn)換率均大于顛換率。所有群體中cytb、coI基因和D-loop控制區(qū)分別發(fā)現(xiàn)21個(gè)、13個(gè)和6個(gè)單倍型,cytb基因單倍型數(shù)量最多;赾ytb和coI的序列分析表明,硬刺松潘裸鯉單倍型多樣性和核苷酸多樣性指數(shù)均高于松潘裸鯉,而基于D-loop控制區(qū)序列的單倍型多樣性和核苷酸多樣指數(shù)性則呈相反趨勢(shì)。遺傳距離分析表明,硬刺松潘裸鯉和松潘裸鯉間的遺傳距離大于各種內(nèi)群體間遺傳距離,但小于裸鯉屬種間的遺傳距離。同時(shí),基于cytb、col基因和D-loop控制區(qū)系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析表明,硬刺松潘裸鯉和松潘裸鯉系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系較近,均能為硬刺松潘裸鯉是松潘裸鯉的亞種提供了證據(jù)。3.安寧河硬刺松潘裸鯉樣品體長(zhǎng)范圍為3.6cm~18.8cm (7.86±1.52cm),全長(zhǎng)(Total length, TL)與體重(Bodv weight, BW)呈顯著冪函數(shù)相關(guān),關(guān)系式為:BW=0.0025TL3.3943(n=1244):全長(zhǎng)與日齡(Daily age,D)呈線性相關(guān),關(guān)系式為T(mén)L=0.7574+0.03184D(n=280);體重與日齡呈線性相關(guān),關(guān)系式為BW=-0.03901+5.4383D(n=280)。對(duì)7尾硬刺松潘裸鯉Ⅳ期卵巢統(tǒng)計(jì)分析表明,其絕對(duì)繁殖力為1224粒~1656粒(1467.77±121.88粒),相對(duì)繁殖力為29.66粒/g~44.35粒/g(33.06±9.11粒/g)。對(duì)2014年2月和4月性腺進(jìn)行組織切片,結(jié)果表明硬刺松潘裸鯉為卵巢Ⅲ期,Ⅰ期、Ⅱ期卵母細(xì)胞仍占有一定的比例;Ⅳ期卵巢,也存在Ⅲ期卵母細(xì)胞,由此推測(cè)其繁殖方式為分批同步產(chǎn)卵。硬刺松潘裸鯉受精卵淡黃色、沉性、微粘性,卵徑為(3.01±0.24)mm。在水溫(12.4+0.7)℃的孵化條件下,胚胎期歷經(jīng)卵裂期、囊胚期、原腸胚期、神經(jīng)胚期、胚孔封閉期、器官形成期、出膜前期7個(gè)時(shí)期,歷時(shí)269.5h。初孵仔魚(yú)全長(zhǎng)(8.41±0.24)mm。出膜后第15天(14.9±0.86℃)和18天(12.1士0.18℃)卵黃吸收完全。12.1±0.18℃培養(yǎng)條件下,硬刺松潘裸鯉仔魚(yú)卵黃吸收完全,背鰭、臀鰭和尾鰭的叉形分別出現(xiàn)于出膜后27天、40天和62天;經(jīng)過(guò)113天的培育,仔魚(yú)基本具備成魚(yú)的形態(tài)特征。輪紋統(tǒng)計(jì)結(jié)果表明,硬刺松潘裸鯉耳石幼魚(yú)輪紋沉積具有日周期性,即每日形成一輪日輪,結(jié)合野外樣品采集時(shí)間、微耳石日輪數(shù)據(jù)和石輪紋沉積規(guī)律推算,2月、4月和9月采集的硬刺松潘裸鯉幼魚(yú)的孵化期分別為4月~9月、5月~12月,12月~次年4月,高峰期分別為2月、6月~7月和9月~11月,由此還可以看出硬刺松潘裸鯉為多次產(chǎn)卵。
【圖文】:

魚(yú)類,編碼基因,線粒體,蛋白質(zhì)


逡逑排列與大多數(shù)脊椎動(dòng)物的排列基本相同P6’373,如圖1-1所示PW。然而少數(shù)種類逡逑也表現(xiàn)出自身的特異性,如Ckilson邋(2006)研究發(fā)現(xiàn)格陵蘭廌(G化沁sogac)逡逑mtDNA中缺失一個(gè)WV/l-/Vo的編碼基卸381;裘氏鱷頭冰魚(yú)(C&aw/woce如o/ms逡逑gwmw)最多存在兩個(gè)n抓基因及兩個(gè)控制區(qū)此外,,研究發(fā)現(xiàn)逡逑TQX叔澹茫牛酰潁穡瑁幔潁鰨沐澹穡澹歟澹悖幔睿錚椋洌澹螅┖屠ㄎ臇蚱擎攏ǎ櫻幔悖悖錚穡瑁悖睿睿澹歟幔觶澹睿猓澹潁紓椋┑膩義希恚簦模危僚帕星傻湫偷那勺刀锎嬖誚洗蟛畋穡祝。辶x希殄澹義希隋義賢跡保庇憷嘞吡L寤桑斫峁故疽鈺#ǜ煞,2014)辶x希疲椋紓保卞澹希潁紓幔睿椋幔簦椋錚鑠澹錚駑澹媯椋螅楨澹恚簦模危鈴澹紓澹睿錚恚邋義希玻玻鋇鞍字時(shí)嗦牖蟈義嫌憷啵恚簦模危林斜嗦氳模保掣齙鞍字時(shí)嗲苫蛑校蠖嗍竅吡L逋妥喲菟義閑璧拿稈腔。諒T┗蚍直鶚牽危粒模韌尋泵傅模犯鲅腔海恚峰澹ǎ危粒模韌褗嗣稿義涎莾21)、nc/2邋(NADl"jAVt^WW2)、化/3邋(NADH脫'々l鵬化巧3)、逡逑(NADH脫娝雌亞褲4)、nt/5邋(NADI"j&^rtl;HR^5)、m/6,邋cyA邋(細(xì)胞色逡逑素b),細(xì)胞色素c氧化酶亞基:CO/邋(細(xì)胞色襲Vl化鵬化巧I)、cW/邋(細(xì)胞色逡逑索甸化酶亞巧2;、CO//7邋(細(xì)胞色桌句化賄化化3)邋W及2個(gè)ATP介成酶亞基逡逑(如尸6;M7PS)腳。逡逑5逡逑

基因,鏈編碼,堿基配對(duì),一級(jí)結(jié)構(gòu)


心《、基因由L鏈編碼,剩下的tRNA基因由H鏈編碼^氣其中魚(yú)類mtDNA逡逑大多數(shù)tRNA都能通過(guò)自身折疊而形成部分堿基配對(duì)的典型的四葉式二級(jí)結(jié)構(gòu)逡逑(圖1-2)。tRNA基因的一級(jí)結(jié)構(gòu)變異較大,具有較大的差異,但是其二級(jí)結(jié)逡逑構(gòu)卻高度保守ws’49l。逡逑6逡逑
【學(xué)位授予單位】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:S917.4

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