麥類作物基因組結(jié)構(gòu)解析與多倍化過程重構(gòu)
發(fā)布時間:2024-04-03 01:51
小麥與其它禾本科植物在進(jìn)化中經(jīng)歷了反復(fù)的多倍化事件,而小麥作為六倍體由祖先的A,B,D基因組雜交構(gòu)成,結(jié)構(gòu)與構(gòu)成經(jīng)歷了復(fù)雜的變化。目前沒有一個研究清晰的展示小麥與古多倍化事件相關(guān)聯(lián)的基因組結(jié)構(gòu)變化過程,解析與其他禾本科植物基因組同源進(jìn)化關(guān)系。準(zhǔn)確解析這一復(fù)雜的基因組,將有助于更好了解其基因組構(gòu)成和功能進(jìn)化。課題在先前對8個禾本科植物的研究基礎(chǔ)上,著重對麥類作物,尤其是小麥進(jìn)行分析,構(gòu)建了三個外類群植物(水稻、二穗短柄草、菠蘿)和四個麥類作物(粗山羊草、烏拉爾圖小麥、小麥、大麥)之間與多倍化相關(guān)聯(lián)的全基因組共線性比對列表,獲得了禾本科植物共同祖先物種全基因組加倍及各物種分化過程中所產(chǎn)生的旁系和直系同源染色體片段,并進(jìn)行區(qū)分確定由不同加倍事件產(chǎn)生的基因組內(nèi)的重復(fù)基因,在小麥中由禾本科共同祖先全基因組加倍產(chǎn)生的有共線性支持的基因共有142個。在與其他物種相比,其三個子基因組之間和各個子基因組內(nèi)存在的同源共線性基因要少得多。子基因組A、B、D中分別存在48、78、30個旁系同源共線性片段,包含有217,225和89個同源共線性基因。這表明小麥子基因組間發(fā)生了部分同源的重組,表明發(fā)生基因丟失,基...
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
本文編號:3946534
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圖1課題涉及物種的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系
圖1課題涉及物種的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系Fig.1Phylogeneticrelationshipsofselectedspeciesinthisproject2.2研究方法
圖2水稻和二穗短柄草基因組間同源性點(diǎn)陣圖
圖2水稻和二穗短柄草基因組間同源性點(diǎn)陣圖Fig.2ThehomologydotplotbetweenthegenomeofO.sativaandB.distachyon注:圖中展示的是水稻和二穗短柄草基因組同源共線信息。橫軸由左向右依次排列的是水稻基因組的....
圖3水稻和大麥基因組間同源性點(diǎn)陣圖
圖3水稻和大麥基因組間同源性點(diǎn)陣圖Fig.3ThehomologydotplotbetweenthegenomeofO.sativaandH.vulgare在圖3中,以水稻作為參考基因組與麥類作物中的大麥(2n=14)進(jìn)行基因組間同源性的比較分析,兩者....
圖4粗山羊草和小麥基因組間同源性點(diǎn)陣圖
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