葉綠素是植物形成產量的重要因子。為了探究吐絲期葉綠素的遺傳機理和代謝機制,本研究以榆林、楊凌兩地126份玉米自交系為材料,采用全基因組關聯(lián)分析的方法將簡化基因組測序填充過濾篩選后得到31 561個SNP (Single nucleotide polymorphism)標記,結合葉綠素指數SPAD (Soil and plant analyzer develotrnent)值以及BLUP (Best linear unbiased prediction)值進行分析,共檢測到37個顯著性關聯(lián)SNP標記;在LD (Linkage disequilibrium)衰退有效距離上下150 kb內檢測到201個候選基因,進一步進行GO富集注釋和分析,將葉綠素相關候選基因主要錨定在過氧化氫代謝過程、受體活性、活性氧代謝過程和氮化合物代謝過程的負調控等18個代謝途徑上。本研究進一步探究了葉綠素相關代謝遺傳機理,對高光效育種和提高作物產量有重要意義。

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圖1AM126SPAD值頻率分布

為了更好地分析葉綠素指數的代謝基礎，對37個關聯(lián)位點置信區(qū)間的候選基因進行基因搜索，共得到201個候選基因(表5)。用AgriGOV2.0對所在的201個候選基因進行功能注釋，按照p≤0.05標準，篩選出18個富集程度較好的生物途徑，包括5個分子功能：分子換能器活性、受體活性....

圖2AM126葉綠素指數全基因組關聯(lián)分析曼哈頓和分位數-分位數圖(QQ圖)

前人利用經典遺傳分析法定位了自然條件下不同生育期葉綠素QTL(王愛玉和張春慶,2008;譒imicetal.,2014)、不同處理下葉綠素QTL(Hundetal.,2004;Caietal.,2012)和不同處理下不同部位葉片QTL(Chanetal.,2....

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