發(fā)布時間：2023-07-25 02:28

　　馬鞭草(Verbena officinalis Linn.),多年生草本植物,為馬鞭草科(Verbenaceae)馬鞭草屬(Verbena)植物。馬鞭草在我國是一種歷史悠久的傳統(tǒng)藥用植物,其研究主要都集中在藥理作用、化學成分等方面,關于其譜系結構、遺傳格局方面的研究幾乎沒有。本研究基于三種分子標記(cpDNA、nrDNA、SSR),以細葉美女櫻(Verbenatenera)為外類群,對我國22個馬鞭草居群進行親緣地理學和遺傳結構的分析,以此來說明馬鞭草在我國的遺傳多樣性水平、歷史動態(tài)、分布格局等方面的特征。1.親緣地理學分析利用cpDNA序列、ITS序列分析馬鞭草在我國的演化歷程。從通用葉綠體引物中篩選出2對引物(trnL-trnF、psbD-trnT)進行分析。trnL-trnF序列在國內居群中產生2種單倍型,其變異位點百分率為0.11%,單倍型多態(tài)性Hd=0.087,核苷酸多態(tài)性π=0.00010;psbD-trnT在國內的居群中僅占有3種單倍型,其變異位點百分率為1.8%,單倍型多態(tài)性Hd= 0.345,核苷酸多態(tài)性π=0.00046;ITS序列產生2種單倍型,其變異位點百分率為...

【文章頁數(shù)】：71 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第1章 引言
    1.1 馬鞭草植物概述
        1.1.1 馬鞭草的生物學和生態(tài)學特征
        1.1.2 馬鞭草的國內外研究進展
    1.2 馬鞭草研究中存在的問題
    1.3 譜系地理學
        1.3.1 譜系地理學概念及研究內容
        1.3.2 譜系地理學相關理論
    1.4 本實驗使用的分子標記
        1.4.1 葉綠體DNA分子標記
        1.4.2 核基因ITS分子標記
        1.4.3 簡單重復序列分子標記(SSR)
    1.5 轉錄組測序技術
    1.6 研究內容和意義
        1.6.1 研究內容
        1.6.2 研究意義
第2章 親緣地理學分析
    2.1 實驗材料和方法
        2.1.1 樣本材料的采集
        2.1.2 實驗儀器和主要試劑
    2.2 實驗方法
        2.2.1 基因組DNA的提取
        2.2.2 cpDNA引物篩選
        2.2.3 ITS序列引物信息
        2.2.4 數(shù)據(jù)處理與分析
    2.3 實驗結果與分析
        2.3.1 引物篩選結果
        2.3.2 葉綠體序列分析
        2.3.3 ITS序列分析
        2.3.4 聯(lián)合數(shù)據(jù)分析
    2.4 討論
        2.4.1 引物篩選結果
        2.4.2 ITS和cpDNA進化特點分析
        2.4.3 馬鞭草單倍型親緣關系
        2.4.4 馬鞭草居群歷史動態(tài)
    2.5 本章小結
第3章 馬鞭草轉錄組測序和SSR位點分析
    3.1 實驗材料來源
    3.2 實驗方法
        3.2.1 轉錄組測序方法
        3.2.2 SSR位點搜索
    3.3 結果與分析
        3.3.1 馬鞭草轉錄組RNA提取結果
        3.3.2 馬鞭草轉錄組原始數(shù)據(jù)質控
        3.3.3 馬鞭草SSR位點類型與特點
        3.3.4 馬鞭草轉錄組SSR重復次數(shù)
    3.4 討論
    3.5 本章小結
第4章 基于SSR的馬鞭草的群體遺傳多樣性
    4.1 實驗材料與方法
        4.1.1 實驗材料
        4.1.2 實驗方法
    4.2 SSR數(shù)據(jù)的讀取以及統(tǒng)計分析
    4.3 實驗結果與分析
        4.3.1 SSR引物篩選結果與位點分析
        4.3.2 馬鞭草群體的哈迪—溫伯格平衡檢測和遺傳多樣性分析
        4.3.3 馬鞭草主成分分析
        4.3.4 群體聚類分析
        4.3.5 群體的Structure結構分析
        4.3.6 遺傳分化分析與分子方差分析
        4.3.7 IBD分析
        4.3.8 瓶頸效應檢測
    4.4 討論
        4.4.1 馬鞭草遺傳多樣性
        4.4.2 馬鞭草居群雜合子過�，F(xiàn)象
        4.4.3 馬鞭草遺傳結構與遺傳分化
        4.4.4 馬鞭草瓶頸效應的驗證
        4.4.5 關于馬鞭草為外來植物的推測
    4.5 本章小結
第5章 結論與展望
    5.1 結論
    5.2 展望
致謝
參考文獻
附錄A 常用的20對cpDNA引物序列及退火溫度
附錄B 部分馬鞭草cpDNA測序結果
附錄C 馬鞭草圖片
攻讀碩士學位期間的研究成果



本文編號：3836990