綠豆是豇豆屬中的主要栽培種作物,也是我國重要的食用豆類。作為小宗作物,綠豆研究基礎(chǔ)薄弱,遺傳圖譜數(shù)量少、密度低,難以有效用于新基因發(fā)掘等深入研究。本課題基于大花葉和冀綠9號變異株雜交衍生的RIL(Recombinant inbred line)群體,利用基因組重測序技術(shù),構(gòu)建了綠豆SNP高密度遺傳連鎖圖譜,并開展了主要表型性狀的QTL分析,主要研究結(jié)果如下:(1)綠豆高密度遺傳圖譜構(gòu)建親本間共檢測到564449個(gè)SNP,將篩選后的SNP劃分為Bin標(biāo)記,構(gòu)建了包含1946個(gè)Bin標(biāo)記(包含21508個(gè)SNP)的高密度遺傳連鎖圖譜,該圖譜總長為1060.17 cM,分為11個(gè)連鎖群(LG),平均圖距為0.54 cM。連鎖群的長度依次是LG 9(168.03 cM)>LG 6(127.99 cM)>LG 1(114.27 cM)>LG 5(113.37 cM)>LG 8(112.09 cM)>LG 7(95.76 cM)>LG 10(87.85cM)>LG 11(85.60 cM)>LG 2(71.90 cM)>LG 3(44.55 c...

【文章頁數(shù)】：69 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
主要符號對照表
第一章 緒論
    1.1 綠豆種植地位及研究意義
    1.2 遺傳連鎖圖譜構(gòu)建原理及步驟
        1.2.1 遺傳連鎖圖譜構(gòu)建原理
        1.2.2 遺傳標(biāo)記種類
        1.2.3 遺傳連鎖圖譜構(gòu)建主要內(nèi)容
    1.3 綠豆遺傳圖譜研究現(xiàn)狀
        1.3.1 綠豆DNA分子標(biāo)記的開發(fā)
        1.3.2 綠豆遺傳圖譜的研究進(jìn)展
    1.4 QTL定位的原理及方法
    1.5 綠豆農(nóng)藝性狀遺傳研究進(jìn)展
    1.6 選題目的意義和研究內(nèi)容
        1.6.1 選題目的與意義
        1.6.2 主要研究內(nèi)容
第二章 材料與方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
    2.2 方法
        2.2.1 DNA文庫構(gòu)建
        2.2.2 綠豆基因組重測序及數(shù)據(jù)處理
        2.2.3 親本之間SNP檢測
        2.2.4 .高密度遺傳圖譜的構(gòu)建
        2.2.5 遺傳作圖操作方法
        2.2.6 農(nóng)藝性狀的考察
        2.2.7 QTL定位方法與步驟
        2.2.8 候選基因篩選及SNP變異分析
第三章 結(jié)果與分析
    3.1 高密度遺傳圖譜構(gòu)建
        3.1.1 測序深度及基因組覆蓋度分析
        3.1.2 分子標(biāo)記的開發(fā)及篩選
        3.1.3 遺傳連鎖圖譜特征分析
    3.2 共線性分析
    3.3 農(nóng)藝性狀表型分布及遺傳分析
        3.3.1 農(nóng)藝性狀分布
        3.3.2 葉形態(tài)表型分析
    3.4 農(nóng)藝性狀QTL定位
        3.4.1 QTL位點(diǎn)分布情況
        3.4.2 葉形態(tài)QTL定位與候選基因SNP變異分析
        3.4.3 株型相關(guān)性狀QTL定位
        3.4.4 豆莢形態(tài)相關(guān)QTL定位
        3.4.5 與籽粒性狀相關(guān)的QTL定位
        3.4.6 初花期相關(guān)QTL定位
        3.4.7 葉片葉綠素含量QTL定位
        3.4.8 幼莖色QTL定位
第四章 討論
    4.1 Bin標(biāo)記應(yīng)用于遺傳作圖的優(yōu)勢
    4.2 高密度遺傳圖譜構(gòu)建
    4.3 農(nóng)藝性狀定位
    4.4 葉緣的遺傳機(jī)理
第五章 結(jié)論
    5.1 綠豆群體基因組重測序及 SNP 標(biāo)記開發(fā)
    5.2 作圖群體的選擇
    5.3 高密度遺傳圖譜構(gòu)建
    5.4 農(nóng)藝性狀表型分析
        5.4.1 葉形態(tài)分析
        5.4.2 農(nóng)藝性狀分布情況
    5.5 農(nóng)藝性狀QTL定位
    5.6 葉緣表型候選基因發(fā)掘及SNP變異分析
參考文獻(xiàn)
附錄A
致謝
作者簡歷



本文編號：3822301