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玉米泛素結(jié)合酶基因家族分析及低氮脅迫下亞家族UBC2的表達分析

發(fā)布時間:2023-04-17 05:32
  泛素結(jié)合酶是泛素/蛋白酶體途徑的重要組成部分,在蛋白質(zhì)的泛素化過程中具有重要作用。本研究利用生物信息學(xué)對玉米泛素E2家族成員進行系統(tǒng)進化及基因結(jié)構(gòu)分析。系統(tǒng)進化分析顯示,玉米泛素結(jié)合酶基因可分為6個亞家族,各亞家族成員數(shù)目差異較大;驍(shù)目最多的亞家族是UBC1,為22個。成員數(shù)最少的是UBC3,僅為5個。以亞家族UBC2為研究對象,發(fā)現(xiàn)UBC2中一共存在4對旁系同源基因,分別是ZmUBC3/ZmUBC70、ZmUBC8/ZmUBC34、ZmUBC31/ZmUBC53以及ZmUBC45/ZmUBC66。對UBC2中成員進行基因結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn),互為旁系同源的基因其基因結(jié)構(gòu)相似。ZmUBC45/ZmUBC66含有外顯子數(shù)量最多,為9個,而ZmUBC31/ZmUBC53外顯子含量最小,僅為4個;蚧蚍治鼋Y(jié)果顯示,ZmUBC3/ZmUBC70含有基序數(shù)量最多(8個),ZmUBC8/ZmUBC34與ZmUBC31/ZmUBC53基序含量最小(均為3個);騿幼幼饔迷治鲲@示,泛素E2基因啟動子元件類型可分為光響應(yīng)、激素響應(yīng)和脅迫響應(yīng)元件、組織表達相關(guān)元件以及周期性調(diào)控相關(guān)元件5大類;...

【文章頁數(shù)】:10 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 實驗材料及處理方法
    1.2 玉米泛素結(jié)合酶基因的基因結(jié)構(gòu)及系統(tǒng)進化分析
    1.3 玉米泛素E2基因家族成員啟動子作用元件分析
    1.4 不同組織器官的表達模式分析
    1.5 低氮脅迫下泛素E2家族基因成員的表達分析
    1.6 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
    2.1 玉米泛素結(jié)合酶蛋白家族的系統(tǒng)進化分析
    2.2 玉米泛素結(jié)合酶家族基因的啟動子作用元件分析
    2.3 玉米E2基因在不同組織的表達分析
    2.4 玉米E2基因在不同氮形態(tài)脅迫下的表達分析
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本文編號:3792671

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