馬鈴薯(Solanum tuberosum L.)在許多國(guó)家都是一種重要的主糧和經(jīng)濟(jì)作物。中國(guó)是世界馬鈴薯第一種植大國(guó)和生產(chǎn)大國(guó),在世界馬鈴薯產(chǎn)業(yè)中起到了主導(dǎo)地位。為了解馬鈴薯種質(zhì)資源的遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu),豐富目前匱乏的馬鈴薯基因以促進(jìn)馬鈴薯改良,為了篩選與馬鈴薯塊莖重要表型性狀相關(guān)的SNPs位點(diǎn)及候選基因,同時(shí)為尋找與馬鈴薯生產(chǎn)上的主要病害之一馬鈴薯晚疫病抗性相關(guān)的候選基因,為馬鈴薯種質(zhì)資源的創(chuàng)新利用和新品種選育提供參考依據(jù)。本研究通過(guò)簡(jiǎn)單重復(fù)序列(SSR)標(biāo)記、擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性(AFLP)標(biāo)記技術(shù)和基于SLAF-seq技術(shù)開(kāi)發(fā)出單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點(diǎn),對(duì)收集和保存的包括從世界上8個(gè)國(guó)家和國(guó)際馬鈴薯研究中心(CIP)及國(guó)內(nèi)不同地方的288份馬鈴薯種質(zhì)資源進(jìn)行了系統(tǒng)的遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)研究;對(duì)4個(gè)主要塊莖性狀(芽眼色、芽眼深淺、肉色和皮色)進(jìn)行了全基因組關(guān)聯(lián)分析;進(jìn)行了基于SNP標(biāo)記的馬鈴薯種質(zhì)資源抗晚疫病基因區(qū)域選擇消除分析。本研究取得的主要結(jié)果如下:1.通過(guò)SSR和AFLP標(biāo)記技術(shù)來(lái)評(píng)估這288份馬鈴薯種質(zhì)資源的遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu),從20對(duì)表現(xiàn)多態(tài)性的SSR標(biāo)記中檢測(cè)...

【文章頁(yè)數(shù)】：156 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
縮略語(yǔ)表
第一章 綜述
    1.1 中國(guó)馬鈴薯育種發(fā)展簡(jiǎn)史
    1.2 中國(guó)馬鈴薯種質(zhì)資源研究現(xiàn)狀
    1.3 馬鈴薯種質(zhì)資源的遺傳多樣性研究
        1.3.1 形態(tài)學(xué)標(biāo)記
        1.3.2 細(xì)胞學(xué)標(biāo)記
        1.3.3 生化標(biāo)記
        1.3.4 分子標(biāo)記
        1.3.5 馬鈴薯主要農(nóng)藝性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析
    1.4 本研究的目的意義
第二章 基于SSR和AFLP標(biāo)記的288份馬鈴薯種質(zhì)資源遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)分析
    2.1 材料與方法
        2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.2 方法
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 SSR和AFLP標(biāo)記的多態(tài)性分析比較
        2.2.2 SSR和AFLP標(biāo)記的聚類分析結(jié)果的比較
        2.2.3 綜合兩種分子標(biāo)記的群體結(jié)構(gòu)分析、PCA分析和聚類分析
        2.2.4 綜合兩種分子標(biāo)記結(jié)果進(jìn)行不同地區(qū)馬鈴薯種質(zhì)資源群體間聚類分析
    2.3 討論
第三章 基于SLAF-seq技術(shù)開(kāi)發(fā)的SNP標(biāo)記的馬鈴薯種質(zhì)資源遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)分析
    3.1 材料與方法
        3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.1.2 基因組DNA的提取
        3.1.3 酶切建庫(kù)
        3.1.4 測(cè)序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與質(zhì)量分析
        3.1.5 實(shí)驗(yàn)建庫(kù)評(píng)估
        3.1.6 SLAF標(biāo)簽的獲得和SNP標(biāo)記的開(kāi)發(fā)
        3.1.7 數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)與分析
    3.2 結(jié)果與分析
        3.2.1 酶切方案評(píng)估
        3.2.2 測(cè)序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與質(zhì)量分析
        3.2.3 實(shí)驗(yàn)建庫(kù)評(píng)估
        3.2.4 SLAF標(biāo)簽的獲得和SNP標(biāo)記的開(kāi)發(fā)
        3.2.5 遺傳進(jìn)化分析
    3.3 討論
第四章 基于SNP標(biāo)記的馬鈴薯種質(zhì)資源主要塊莖性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析
    4.1 材料與方法
        4.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        4.1.2 方法
    4.2 結(jié)果與分析
        4.2.1 芽眼色性狀的關(guān)聯(lián)分析
        4.2.2 芽眼深淺性狀的關(guān)聯(lián)分析
        4.2.3 肉色性狀的關(guān)聯(lián)分析
        4.2.4 皮色性狀的關(guān)聯(lián)分析
    4.3 討論
第五章 基于SNP標(biāo)記的馬鈴薯種質(zhì)資源抗晚疫病基因選擇分析
    5.1 材料與方法
        5.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        5.1.2 方法
    5.2 結(jié)果與分析
        5.2.1 抗病性鑒定結(jié)果統(tǒng)計(jì)
        5.2.2 Fst群體選擇清除分析
    5.3 討論
第六章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)介



本文編號(hào)：3780679