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青藏高原蕨麻的分子譜系地理學研究

發(fā)布時間:2023-03-18 20:05
  蕨麻(Potentilla anserina L.)屬薔薇科(Rosaceae)委陵菜屬(Potentilla L.),多年生草本植物,廣泛分布于青藏高原。本研究以蕨麻為研究對象,利用葉綠體DNA(cpDNA)基因間隔區(qū)trnL-trnF序列和核基因ITS 18S-26A的測序數據,對蕨麻在青藏高原的30個居群(603714個個體)進行分子譜系地理學研究,揭示遺傳變異在居群內和居群間的分布式樣,同時結合群體遺傳學和系統發(fā)生學,分析該物種的遺傳結構與歷史事件之間的關聯,從而揭示物種及物種內不同種群形成現有分布格局的歷史原因和演化過程。主要研究結果如下:(1)蕨麻cpDNA trnL-trnF基因間隔區(qū)共擴增成功603個個體,對位排列后序列長度為727 bp,包含22個變異位點,變異位點百分率為3.03%,603個個體的總體核苷酸多樣性(π)為0.010641。共檢測到40種單倍型,16種共享單倍型廣泛分布于所有居群中,其余單倍型為居群所特有單倍型。cpDNA trnL-trnF片段分析顯示總的遺傳多樣性和居群內的平均遺傳多樣性都很高(HT=0....

【文章頁數】:86 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 文獻綜述
    1.1 譜系地理學簡介
        1.1.1 譜系地理學概念
        1.1.2 譜系地理學的相關理論
        1.1.3 譜系地理學研究中常用的分子標記及分析方法
        1.1.4 植物譜系地理學研究進展
    1.2 青藏高原簡介
    1.3 生態(tài)位模型
    1.4 蕨麻的研究概況
        1.4.1 蕨麻名稱的由來及含義
        1.4.2 蕨麻的生物學特性
        1.4.3 蕨麻國外研究動態(tài)
        1.4.4 蕨麻國內研究動態(tài)
    1.5 研究目的意義及技術路線
        1.5.1 研究目的及意義
        1.5.2 技術路線
第二章 材料與方法
    2.1 實驗材料
    2.2 實驗試劑、溶液配制和實驗儀器
        2.2.1 實驗試劑
        2.2.2 主要實驗儀器
    2.3 研究方法
        2.3.1 總DNA提取
        2.3.2 DNA檢測
        2.3.3 DNA溶液稀釋至統一濃度
        2.3.4 引物篩選
        2.3.5 PCR擴增
        2.3.6 DNA測序
    2.4 數據分析
        2.4.1 序列變異分析及建立單倍型
        2.4.2 重建單倍型系統發(fā)育關系
        2.4.3 群體遺傳結構分析
        2.4.4 種群歷史動態(tài)分析
        2.4.5 生態(tài)位模型檢測
    2.5 本章小結
第三章 研究結果與分析
    3.1 蕨麻cpDNA trnL-trnF片段實驗結果
        3.1.1 單倍型多態(tài)性及分布
        3.1.2 群體遺傳結構分析
        3.1.3 單倍型系統發(fā)育關系
        3.1.4 種群歷史動態(tài)分析
    3.2 蕨麻nrDNA ITS片段實驗結果
        3.2.1 單倍型多態(tài)性及分布
        3.2.2 群體遺傳結構分析
        3.2.3 單倍型系統發(fā)育關系
        3.2.4 種群歷史動態(tài)分析
    3.3 蕨麻生態(tài)位模型檢測
    3.4 本章小結
第四章 討論
    4.1 蕨麻遺傳結構分析
    4.2 蕨麻的居群動態(tài)歷史
    4.3 蕨麻的潛在避難所
第五章 結論與展望
參考文獻
致謝
作者簡歷及攻讀學位期間研究成果



本文編號:3763779

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