雜種劣勢是在產量、生物量以及其它一些農藝性狀表現(xiàn)與雜種優(yōu)勢相反的一種現(xiàn)象,而在雜種劣勢的相關分子機理研究方面很少受到關注。為了解析雜種劣勢的相關分子機理,本研究旨在利用雜種劣勢相關的3個粳稻品種‘Aranghyangchalbyeo’（CH7）、‘Sanghaehyangheolua’（CH8）和‘Shinseonchalbyeo’（CH9）進行全基因組重測序,分析全基因組序列變異,解析雜種劣勢的遺傳基礎。通過與粳稻品種‘日本晴’參考基因組的比對分析,在CH7、CH8和CH9基因組中分別獲得了574 551個、1 026 428個和792 465個變異位點,包括SNPs和In Dels變異位點。同時,基于基因組的拷貝數(shù)變異（CNVs）檢測,在CH7、CH8和CH9基因組中分別獲得了5 698個、6 872個和6 133個拷貝數(shù)變異位點。此外,本研究也發(fā)現(xiàn)CH7、CH8和CH9基因組的變異位點在水稻的12條染色體上的分布是不均勻的。這些結果明確了相關基因組中的變異位點信息,為進一步研究雜種劣勢的遺傳機理提供了基礎。 

【文章頁數(shù)】：9 頁

【文章目錄】：
1 結果與分析
    1.1 全基因組重測序
    1.2 基因組DNA的多態(tài)性檢測
    1.3 基因組SNP的檢測與分析
    1.4 基因組InDel檢測與分析
    1.5 基因組CNV檢測與分析
    1.6 基因組序列變異在各染色體的分布
2 討論
3 材料與方法
    3.1 試驗材料
    3.2 基因組DNA的提取和文庫構建
    3.3 全基因組DNA重測序
    3.4 測序原始數(shù)據的過濾以及序列回貼
    3.5 基因組的變異檢測和注釋
作者貢獻



本文編號：3692637