聯(lián)合利用Illumina 90K SNP芯片和毛細管高通量SSR檢測技術(shù),構(gòu)建75份育成品種384個SNP和42個SSR位點的指紋圖譜,比較兩種標記在遺傳多樣性、遺傳相似系數(shù)和鑒別能力等方面的特征。結(jié)果顯示,SNP標記揭示的遺傳多樣性指數(shù)明顯低于SSR標記,但能較好地反映品種間的遺傳多樣性;SNP標記揭示的遺傳相似系數(shù)明顯高于SSR標記,但兩者呈極顯著線性相關(guān);384個SNP位點鑒定近等基因系的能力低于42個SSR位點,但去除近等基因系后,僅需8個SNP或4個SSR位點組合即可區(qū)分剩余的74份品種,表明最優(yōu)位點組合具有較高的鑒定效率,在品種鑒定時可先采用少量標記進行初鑒,對于極近似品種可加大標記密度。首次結(jié)合SSR和SNP標記構(gòu)建指紋圖譜,證實了兩者之間的一致性,提出了分子身份鑒定技術(shù)標記數(shù)量的選擇思路,為小麥品種DNA身份鑒定技術(shù)標準制定提供了重要的參考依據(jù)。 

【文章來源】：中國農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報. 2020,22(05)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：9 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗材料
    1.2 基因組DNA提取
    1.3 SNP基因分型
    1.4 SSR基因分型
    1.5 統(tǒng)計分析
2 結(jié)果分析
    2.1 適于指紋圖譜構(gòu)建的SNP位點組合篩選
        2.1.1 SNP位點的篩選
        2.1.2 SNP位點的分布
        2.1.3 SNP位點的多態(tài)性分析
    2.2 SSR和SNP標記指紋圖譜分析
    2.3 基于SNP和SSR標記的遺傳多樣性比較
    2.4 基于SNP和SSR標記的的遺傳相似系數(shù)比較
        2.4.1 遺傳相似系數(shù)比較
        2.4.2 遺傳相似系數(shù)相關(guān)性分析
        2.4.3 聚類分析
    2.5 兩種標記的鑒別能力比較
3 討論


【參考文獻】：
期刊論文
[1]適于陸地棉品種身份鑒定的SNP核心位點篩選與評價[J]. 朱國忠,張芳,付潔,李樂晨,牛二利,郭旺珍.  作物學報. 2018(11)
[2]利用SNP芯片構(gòu)建我國冬油菜參試品種DNA指紋圖譜[J]. 趙仁欣,李森業(yè),郭瑞星,曾新華,文靜,馬朝芝,沈金雄,涂金星,傅廷棟,易斌.  作物學報. 2018(07)
[3]應(yīng)用SNP精準鑒定大豆種質(zhì)及構(gòu)建可掃描身份證[J]. 魏中艷,李慧慧,李駿,Yasir A.Gamar,馬巖松,邱麗娟.  作物學報. 2018(03)
[4]我國玉米品種標準DNA指紋庫構(gòu)建研究及應(yīng)用進展[J]. 趙久然,王鳳格,易紅梅,田紅麗,楊揚.  作物雜志. 2015(02)
[5]河南省近年審定小麥品種基于系譜和SNP標記的遺傳多樣性分析[J]. 曹廷杰,謝菁忠,吳秋紅,陳永興,王振忠,趙虹,王西成,詹克慧,徐如強,王際睿,羅明成,劉志勇.  作物學報. 2015(02)



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