蘭科是單子葉植物中最大的科,含有5個亞科,880個屬,約25,000個種。很多蘭科植物具有較高的觀賞和藥用價值。然而關(guān)于蘭科5亞科間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系還未明確,主要的爭論在于其3個單雄蕊類群:樹蘭亞科、蘭亞科和香莢蘭亞科是否為單系類群。此外,有關(guān)蘭科植物葉綠體基因組高變序列的研究仍然較少。因此,本研究測序獲得了細莖石斛（Dendrobium moniliforme）,斑葉蘭（Goodyera schlechtendaliana）,杏黃兜蘭（Paphiopedilum armeniaclum）和香莢蘭（Vanilla aphylla）四個物種的完整葉綠體基因組并結(jié)合已發(fā)表的49個蘭科葉綠體基因組進行了分析。分析結(jié)果表明,四個葉綠體基因組不僅在IR和SC的長度上有差異,而且在ndh基因的剩余長度也不一致�；诒容^分析發(fā)現(xiàn)在兜蘭屬（Paphiopedilum）和香莢蘭屬（Vanilla）屬植物中IR的擴增和ndh基因的丟失有關(guān)。其次,蘭科植物葉綠體基因組的高變區(qū)域具有屬間特異性,經(jīng)過仔細篩選,本研究推薦:5’trnK-rps16,trnS-trnG和rps16-trnQ-trnQ可以作為樹蘭亞科... 

【文章來源】：南京師范大學(xué)江蘇省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：168 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

圖１－２煙草葉綠體基因組圖譜

Ｉ：?＇?１５５，９３９?ｂｐ?ｌ?ＩＩＩ??ｎ?ｉｍ??圖１－２煙草葉綠體基因組圖譜。此圖引自Ｗａｋａｓｕｇｉ?ｅｔ?ａｌ．?（１９９８）。??Ｆｉｇｕｒｅ?１－２?Ｐｌａｓｔｏｍｅ?ｍａｐ?ｏｆ?ｔｏｂａｃｃｏ．?Ａｒｒｏｗｓ?ｂｅｔｗｅｅｎ?ｔｈｅ?ｇｅｎｅ?ｂｏｘｅｓ?ａｎｄ?ｇｅｎｅ?ｎａｍｅｓ?ｓｈｏｗ?ｔｈｏｓｅ??ｏｐｅｒｏｎｓ?ｋｎｏｗｎ?ｔｏ?ｏｃｃｕｒ?ｉｎ?ｔｏｂａｃｃｏ?ｃｐＤＮＡ．??雖然葉綠體基因組圖譜常以環(huán)形表示，但多數(shù)葉綠體基因組在細胞中卻很可??能是以線性或者分叉形式存在的，并隨發(fā)育時期不同而變化（Ｂｅｎｄｉｃｈ２００４）。??１．１．３葉綠體基因組的進化??盡管陸生植物的葉綠體基因組在基因含量和基因組結(jié)構(gòu)方面十分保守，但是??在漫長的進化過程中還是發(fā)生了一些結(jié)構(gòu)上的變化。這些變化主要包含：基因和??內(nèi)含子的丟失，ＩＲ的變化和倒位（ｉｎｖｅｒｓｉｏｎ）等。??１．１．３．１基因和內(nèi)含子的丟失??古細菌藍藻被原始真核細胞俘獲后，很多功能不再重要，因此大多數(shù)基因在??早期的內(nèi)共生過程中已經(jīng)丟失，然而在其不斷進化的歷程中，仍有很多基因丟失??的事件發(fā)生。在裸子植物中屬植物的葉綠體基因組普遍丟失了?〇ｃｃ￡？，??７外／（５

＾?ＩＰｉｎａｉｅｓ?Ｊ??圖１－５基于８１個葉綠體基因?qū)Γ叮磦�種構(gòu)建的ＭＬ樹。??此圖引自?Ｊａｎｓｅｎ?ｅｔ?ａｌ．?（２００７）。??Ｆｉｇｕｒｅ?１－５?ＭＬ?ｔｒｅｅ?ｏｆ?６４?ｔａｘａ?ｂａｓｅｄ?ｏｎ?８１?ｐｌａｓｔｉｄ?ｇｅｎｅ?ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ．??１．２．２葉綠體基因組在物種鑒定方面的研究??葉綠體基因組的結(jié)構(gòu)保守，且基因多是單拷貝基因，易于設(shè)計出通用性高的??引物用于ＤＮＡ序列擴増。因此，葉綠體基因組的片段序列常用于物種鑒定方面??的研宄。然而植物中片段序列的變異度不足，未能篩選出與動物中ＣＯＩ序列類??似的通用條形碼序列，因此經(jīng)常聯(lián)合多個變異度較高的片段進行物種鑒別。這些??高變的片段除了有生命條形碼聯(lián)盟（ＣＢＯＬ）建議的ｍｏ／尺，ＡｃＺ之外（ＣＢＯＬ??Ｐｌａｎｔ?Ｗｏｒｋｉｎｇ?Ｇｒｏｕｐ?２００９），還有一些片段也常被認為具備較髙的序列變異度，??如：／＊／？〇Ｃ７

【參考文獻】：
期刊論文
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