施氮影響羊草秋季地下分蘗芽發(fā)生的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究
發(fā)布時(shí)間:2022-01-17 14:31
羊草(Leymus chinensis),賴草屬多年生根莖型禾草,廣泛分布于歐亞草原東部,具有較高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值和生態(tài)價(jià)值。然而,自然條件下,其有性生殖能力弱、種子產(chǎn)量低,限制了羊草人工草地的建植。羊草種子產(chǎn)量低主要與單位面積生殖枝數(shù)量少有關(guān),而生殖枝數(shù)量又與秋季果后營養(yǎng)期地下分蘗芽的形成密切相關(guān)。因此,探究羊草果后營養(yǎng)期地下分蘗芽庫形成的內(nèi)在機(jī)制,就成為解決種子產(chǎn)量低的關(guān)鍵。本研究利用轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法,對(duì)比研究了果后營養(yǎng)期前、后,施氮與不施氮條件下羊草分蘗基部基因的表達(dá)及調(diào)控通路變化,研究結(jié)果發(fā)現(xiàn):(1)果后營養(yǎng)期施氮能明顯增加羊草地下芽的發(fā)生量。施氮條件下,在閾值為q<0.05,且|log2ratio|(|log2比例|)≥1,RPKM(每百萬reads中來自于某基因每千堿基長度的reads數(shù))>0.3條件下,與芽發(fā)生有直接或間接關(guān)聯(lián)的基因上調(diào)18399個(gè),下調(diào)10732個(gè);而當(dāng)閾值為q<0.001且|log2ratio|≥1,RPKM≥1時(shí)...
【文章來源】:東北師范大學(xué)吉林省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:63 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
轉(zhuǎn)錄本序列長度分布
比對(duì)結(jié)果統(tǒng)計(jì)
東北師范大學(xué)碩士學(xué)位論文15圖2.3ORF長度分布Figure2.3ORFlengthdistribution注:Minlength開放閱讀框的最小長度;Maxlength開放閱讀框的最大長度;N50開放閱讀框的N50長度;N90開放閱讀框的N90長度;Mean-length開放閱讀框的平均長度對(duì)比各個(gè)數(shù)據(jù)庫,共注釋了316261個(gè)unigene,注釋比例為100%。其中注釋到NR數(shù)據(jù)庫的unigene比例為56.73%;注釋到NT數(shù)據(jù)庫的unigene比例為44.54%;注釋到GO數(shù)據(jù)庫的unigene比例為33.36%;注釋到KO數(shù)據(jù)庫的unigene比例為15.05%(圖2.4)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]羊草種質(zhì)資源的評(píng)價(jià)與利用[J]. 劉公社,李曉霞,齊冬梅,陳雙燕,程麗琴. 科學(xué)通報(bào). 2016(02)
[2]次生代謝產(chǎn)物與植物抗病防御反應(yīng)[J]. 郭艷玲,張鵬英,郭默然,陳靠山. 植物生理學(xué)報(bào). 2012(05)
[3]高通量測(cè)序技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 王興春,楊致榮,王敏,李瑋,李生才. 中國生物工程雜志. 2012(01)
[4]植物對(duì)氮脅迫的生理適應(yīng)機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 林鄭和,陳榮冰,陳常頌. 湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(23)
[5]呼倫貝爾草原異質(zhì)生境羊草有性生殖及其生物量分配的研究[J]. 周嬋,張卓,郭平,白丹,楊允菲,李建東. 草原與草坪. 2011(05)
[6]活性氮、活性氧及植物激素在種子休眠解除中的作用及相互關(guān)系研究進(jìn)展[J]. 強(qiáng)妮花,惠偉. 植物生理學(xué)報(bào). 2011(07)
[7]松嫩平原兩個(gè)生態(tài)型羊草營養(yǎng)和生殖生長的研究[J]. 周嬋,張卓,呂勇通,楊允菲. 草地學(xué)報(bào). 2011(03)
[8]氮、硫互作對(duì)克隆植物互花米草繁殖和生物量累積與分配的影響[J]. 甘琳,趙暉,清華,肖燕,李敏,胡秋香,安樹青. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2011(07)
[9]植物對(duì)氮素吸收利用的研究進(jìn)展[J]. 吳巍,趙軍. 中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2010(13)
[10]氮素和6-BA對(duì)水稻分蘗芽發(fā)育的影響及其生理機(jī)制[J]. 劉楊,王強(qiáng)盛,丁艷鋒,劉正輝,李剛?cè)A,王紹華. 作物學(xué)報(bào). 2009(10)
博士論文
[1]水稻分蘗芽萌發(fā)與休眠相互轉(zhuǎn)換的激素學(xué)機(jī)制[D]. 劉楊.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[2]氮、水和溫度對(duì)羊草有性生殖及克隆生長的影響[D]. 王俊鋒.東北師范大學(xué) 2010
[3]羊草種群地下芽庫各類型芽變化及與地上植株形成關(guān)系的研究[D]. 張繼濤.東北師范大學(xué) 2009
[4]三種根莖型禾草繁殖特性及其生態(tài)適應(yīng)性研究[D]. 郭金麗.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[5]羊草生殖生物學(xué)研究[D]. 張衛(wèi)東.中國科學(xué)院研究生院(植物研究所) 2004
碩士論文
[1]氮素營養(yǎng)對(duì)水稻分蘗基因表達(dá)特性及根系和抗倒性的影響[D]. 鄭冠龍.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]水稻幼苗對(duì)氮素響應(yīng)的激素生理機(jī)制[D]. 馬丹.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[3]杜仲花粉初生代謝物與次生代謝物的研究[D]. 馬仁萍.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2008
[4]松嫩平原羊草莖頂分生組織分化研究[D]. 張兆軍.東北師范大學(xué) 2006
本文編號(hào):3594899
【文章來源】:東北師范大學(xué)吉林省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:63 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
轉(zhuǎn)錄本序列長度分布
比對(duì)結(jié)果統(tǒng)計(jì)
東北師范大學(xué)碩士學(xué)位論文15圖2.3ORF長度分布Figure2.3ORFlengthdistribution注:Minlength開放閱讀框的最小長度;Maxlength開放閱讀框的最大長度;N50開放閱讀框的N50長度;N90開放閱讀框的N90長度;Mean-length開放閱讀框的平均長度對(duì)比各個(gè)數(shù)據(jù)庫,共注釋了316261個(gè)unigene,注釋比例為100%。其中注釋到NR數(shù)據(jù)庫的unigene比例為56.73%;注釋到NT數(shù)據(jù)庫的unigene比例為44.54%;注釋到GO數(shù)據(jù)庫的unigene比例為33.36%;注釋到KO數(shù)據(jù)庫的unigene比例為15.05%(圖2.4)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]羊草種質(zhì)資源的評(píng)價(jià)與利用[J]. 劉公社,李曉霞,齊冬梅,陳雙燕,程麗琴. 科學(xué)通報(bào). 2016(02)
[2]次生代謝產(chǎn)物與植物抗病防御反應(yīng)[J]. 郭艷玲,張鵬英,郭默然,陳靠山. 植物生理學(xué)報(bào). 2012(05)
[3]高通量測(cè)序技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 王興春,楊致榮,王敏,李瑋,李生才. 中國生物工程雜志. 2012(01)
[4]植物對(duì)氮脅迫的生理適應(yīng)機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 林鄭和,陳榮冰,陳常頌. 湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(23)
[5]呼倫貝爾草原異質(zhì)生境羊草有性生殖及其生物量分配的研究[J]. 周嬋,張卓,郭平,白丹,楊允菲,李建東. 草原與草坪. 2011(05)
[6]活性氮、活性氧及植物激素在種子休眠解除中的作用及相互關(guān)系研究進(jìn)展[J]. 強(qiáng)妮花,惠偉. 植物生理學(xué)報(bào). 2011(07)
[7]松嫩平原兩個(gè)生態(tài)型羊草營養(yǎng)和生殖生長的研究[J]. 周嬋,張卓,呂勇通,楊允菲. 草地學(xué)報(bào). 2011(03)
[8]氮、硫互作對(duì)克隆植物互花米草繁殖和生物量累積與分配的影響[J]. 甘琳,趙暉,清華,肖燕,李敏,胡秋香,安樹青. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2011(07)
[9]植物對(duì)氮素吸收利用的研究進(jìn)展[J]. 吳巍,趙軍. 中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2010(13)
[10]氮素和6-BA對(duì)水稻分蘗芽發(fā)育的影響及其生理機(jī)制[J]. 劉楊,王強(qiáng)盛,丁艷鋒,劉正輝,李剛?cè)A,王紹華. 作物學(xué)報(bào). 2009(10)
博士論文
[1]水稻分蘗芽萌發(fā)與休眠相互轉(zhuǎn)換的激素學(xué)機(jī)制[D]. 劉楊.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[2]氮、水和溫度對(duì)羊草有性生殖及克隆生長的影響[D]. 王俊鋒.東北師范大學(xué) 2010
[3]羊草種群地下芽庫各類型芽變化及與地上植株形成關(guān)系的研究[D]. 張繼濤.東北師范大學(xué) 2009
[4]三種根莖型禾草繁殖特性及其生態(tài)適應(yīng)性研究[D]. 郭金麗.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[5]羊草生殖生物學(xué)研究[D]. 張衛(wèi)東.中國科學(xué)院研究生院(植物研究所) 2004
碩士論文
[1]氮素營養(yǎng)對(duì)水稻分蘗基因表達(dá)特性及根系和抗倒性的影響[D]. 鄭冠龍.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]水稻幼苗對(duì)氮素響應(yīng)的激素生理機(jī)制[D]. 馬丹.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[3]杜仲花粉初生代謝物與次生代謝物的研究[D]. 馬仁萍.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2008
[4]松嫩平原羊草莖頂分生組織分化研究[D]. 張兆軍.東北師范大學(xué) 2006
本文編號(hào):3594899
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