馬鈴薯（Solanum tuberosum L.）作為重要的糧食作物,具有產(chǎn)量高、適應性強等特點。馬鈴薯塊莖既是經(jīng)濟器官又是繁殖器官,研究馬鈴薯塊莖形成機理有利于提高馬鈴薯的產(chǎn)量和品質(zhì),對馬鈴薯的生產(chǎn)具有重要的應用及理論的指導意義。光周期響應的CO-FT途徑調(diào)控開花、季節(jié)性生長和儲藏器官形成等多個發(fā)育轉變過程,FT同源基因St SP6A介導環(huán)境光周期信號進而調(diào)控塊莖形成。但St SP6A如何進一步調(diào)節(jié)匍匐莖頂端膨大的機制尚不清楚。基于頂端分生組織中保守的FT-AP1調(diào)控模塊,本研究鑒定了馬鈴薯全基因組中所有的MADS-box基因,明確其基因結構及在不同光周期條件下的表達模式,篩選出可能參與介導St SP6A信號調(diào)控光周期誘導的儲藏器官形成過程的MADS-box轉錄因子,為后續(xù)探究馬鈴薯St SP6A的信號轉導提供基礎。主要實驗結果如下:1)利用plant TFDB數(shù)據(jù)庫,鑒定出馬鈴薯中132個MADS-box轉錄因子,聚類、染色體位置和基因結構分析結果表明,MADS-box轉錄因子聚于兩個亞族:MIKC-type和M-type,M-type進一步分為Mα、Mγ、Mβ三個亞家族;MADS... 

【文章來源】：華中農(nóng)業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：77 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

pGreenⅡ0800載體結構圖

馬鈴薯結薯相關 MADS-box 轉錄因子的鑒定與分析圖 1 pGreenⅡ0800 載體結構圖Fig.1 pGreenⅡ0800 yector structure diagram

T+TD ID 后五位數(shù)字，其基因信息包括了 PGSC 數(shù)據(jù)庫編號、染色體位置、蛋、基因亞族及外顯子個數(shù)（附錄Ⅰ）。基于馬鈴薯系統(tǒng)發(fā)育關系（圖 4a）將 MAD因子分為了兩個亞家族：MIKC-type 與 M-type。在 132 個馬鈴薯 MADS-box中，MIKC-type 蛋白亞族有 36 個 MADS-box 基因，M-type 蛋白亞族有 DS-box 基因，該亞家族 MADS-box 基因個數(shù)幾乎是 MIKC-type 蛋白亞族的 2 Mα 亞家族中有 61 個 MADS-box 基因，Mβ 亞家族有 24 個 MADS-box 基因族有 11 個 MADS-box 基因。馬鈴薯 MADS-box 轉錄因子家族基因編碼蛋白質(zhì)2aa-495aa 之間，平均長度約為 193aa。其中 MIKC-type 蛋白質(zhì)平均長度約為 20ype 蛋白質(zhì)平均長度約為 188aa。為了進一步研究馬鈴薯 MADS-box 轉錄因子家族進化關系及預測其家族的功能asttree 與 itol 軟件，我們將擬南芥（Arabidopsis thaliana）中的 108 個 MADS-馬鈴薯中 132 個 MADS-box 基因構建系統(tǒng)發(fā)育樹（圖 3）。

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3563092