天堂国产午夜亚洲专区-少妇人妻综合久久蜜臀-国产成人户外露出视频在线-国产91传媒一区二区三区

全基因組和全轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析解析油菜千粒重自然變異的遺傳機(jī)制

發(fā)布時(shí)間:2021-11-08 13:10
  油菜是我國(guó)重要的油料作物,但隨著低價(jià)進(jìn)口油菜籽對(duì)國(guó)內(nèi)油菜籽市場(chǎng)的沖擊,使得我國(guó)油菜經(jīng)濟(jì)效益難以保證,進(jìn)而導(dǎo)致油菜的產(chǎn)量和種植面積大幅下降。千粒重是影響油菜產(chǎn)量的三要素之一,增加千粒重也是提高油菜產(chǎn)量的主要途徑之一。通過(guò)對(duì)調(diào)控油菜千粒重的SNP位點(diǎn)進(jìn)行定位以及對(duì)千粒重候選基因進(jìn)行預(yù)測(cè)和驗(yàn)證,闡明油菜千粒重遺傳基礎(chǔ)和分子機(jī)制,為改良油菜的千粒重提供理論依據(jù)。本研究通過(guò)對(duì)505份甘藍(lán)型油菜自然群體在武漢(WH2013,WH2014,WH2016,WH2017)、合肥(HF2016,HF2017)和成都(CD2017)7個(gè)環(huán)境的千粒重表型數(shù)據(jù)進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS),以及利用309份甘藍(lán)型油菜開(kāi)花后20天和274份甘藍(lán)型油菜開(kāi)花后40天種子的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和千粒重表型數(shù)據(jù)進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析(TWAS),再結(jié)合轉(zhuǎn)基因技術(shù),實(shí)現(xiàn)了對(duì)千粒重顯著關(guān)聯(lián)位點(diǎn)的定位、千粒重候選基因的預(yù)測(cè)以及候選基因功能初步驗(yàn)證。通過(guò)對(duì)505份甘藍(lán)型油菜自然群體7個(gè)環(huán)境的千粒重?cái)?shù)據(jù)進(jìn)行整理、方差分析和相關(guān)分析,發(fā)現(xiàn)7個(gè)環(huán)境的千粒重平均值在3.33 g-3.71 g之間,群體總千粒重變化范圍在1.43 g-6.38 g之... 

【文章來(lái)源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:98 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

全基因組和全轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析解析油菜千粒重自然變異的遺傳機(jī)制


種子大小的主要控制途徑(Lietal2019)

技術(shù)路線圖,技術(shù)路線,千粒重


華中農(nóng)業(yè)大學(xué)2020屆碩士研究生學(xué)位(畢業(yè))論文182.3技術(shù)路線圖2技術(shù)路線Fig.2Technicalroute2.4試驗(yàn)方法2.4.1田間試驗(yàn)設(shè)計(jì)505份甘藍(lán)型油菜于2012-2013、2013-2014、2015-2016、2016-2017種植于華中農(nóng)業(yè)大學(xué)油菜工程技術(shù)研究中心試驗(yàn)田(代碼WH2013、WH2014、WH2016、WH2017),2016-2017和2017-2018種植于合肥安徽省農(nóng)業(yè)科學(xué)院試驗(yàn)田(代碼HF2017和HF2018),2016-2017種植于成都四川省農(nóng)業(yè)科學(xué)院試驗(yàn)田(代碼CD2017)。每份材料種植2行,每行保留12株材料,株距21cm,行距30cm,田間管理按一般的大田管理進(jìn)行。成熟后,每個(gè)材料選取長(zhǎng)勢(shì)均勻一致的6個(gè)自由授粉單株,整株收獲后掛入掛藏室自然風(fēng)干,整株脫粒,去雜,每個(gè)單株選取800粒左右種子在萬(wàn)深檢測(cè)科技公司的SC-G型考種儀上進(jìn)行千粒重的測(cè)定,該儀器由本實(shí)驗(yàn)室提供,以每個(gè)材料的6個(gè)重復(fù)測(cè)得的平均值作為千粒重值,WH2013和WH2014千粒重?cái)?shù)據(jù)由周永明老師提供,其余千粒重?cái)?shù)據(jù)由本課題采集。

直方圖,千粒重,頻數(shù)分布,直方圖


全基因組和全轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析解析油菜千粒重自然變異的遺傳機(jī)制25圖3各個(gè)環(huán)境中千粒重頻數(shù)分布直方圖及相關(guān)分析a)WH2013、WH2014、WH2016、WH2017、HF2017、HF2018、CD2017千粒重頻數(shù)分布直方圖和相關(guān)性分性;b)經(jīng)過(guò)BLUP分析后武漢、成都、合肥3點(diǎn)千粒重頻數(shù)分布直方圖和相關(guān)性,R2是皮爾遜相關(guān)系數(shù)的平方。Fig.3HistogramofTSWfrequencydistributionandcorrelationanalysisinvariousenvironmentsa)TSWfrequencydistributionhistogramandcorrelationofWH2013,WH2014,WH2016,WH2017,HF2017,HF2018,CD2017;b)AfterBLUPanalysis,thedistributionhistogramandcorrelationofTSWfrequencyinWuhan,ChengduandHefei.R2isthesquareofthePearsoncorrelationcoefficient.對(duì)多年多點(diǎn)的千粒重表型數(shù)據(jù)進(jìn)行表型頻數(shù)分布和皮爾森相關(guān)系數(shù)(R)分析。7個(gè)環(huán)境的千粒重頻數(shù)分布均為正態(tài)分布,兩兩環(huán)境間千粒重表型數(shù)據(jù)存在一定的相關(guān)關(guān)系。WH2013、WH2014、WH2016和WH2017千粒重?cái)?shù)據(jù)間存在WH2013WH2014WH2016WH2017HF2017HF2018CD2017WH4y_blupHF2y_blupCD2017

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中國(guó)油菜種質(zhì)資源研究利用策略與進(jìn)展[J]. 李利霞,陳碧云,閆貴欣,高桂珍,許鯤,謝婷,張付貴,伍曉明.  植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2020(01)
[2]甘藍(lán)型油菜遺傳圖譜構(gòu)建及產(chǎn)量相關(guān)性狀QTL定位研究進(jìn)展[J]. 星曉蓉,柳海東.  青海大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(05)
[3]植物關(guān)聯(lián)分析應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 岳慶春,傅迦得,章辰飛,吳月燕.  江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(18)
[4]GWAS結(jié)合共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析挖掘影響油菜種子硫苷積累的作用位點(diǎn)[J]. 劉蔚,姚敏,康郁,王美,解盼,何昕,劉忠松,官春云,錢偉,華瑋,錢論文.  農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2019(10)
[5]甘藍(lán)型油菜每角粒數(shù)的全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 孫程明,陳鋒,陳松,彭琦,張維,易斌,張潔夫,傅廷棟.  作物學(xué)報(bào). 2020(01)
[6]我國(guó)油菜產(chǎn)業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀、潛力及對(duì)策[J]. 劉成,馮中朝,肖唐華,馬曉敏,周廣生,黃鳳洪,李加納,王漢中.  中國(guó)油料作物學(xué)報(bào). 2019(04)
[7]甘藍(lán)型雜交油菜角果長(zhǎng)度與產(chǎn)量構(gòu)成因素的相關(guān)分析[J]. 戴祥來(lái),向陽(yáng),趙繼獻(xiàn),任廷波,程國(guó)平.  中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2019(20)
[8]甘藍(lán)型油菜角果長(zhǎng)度性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 孫程明,陳松,彭琦,張維,易斌,張潔夫,傅廷棟.  作物學(xué)報(bào). 2019(09)
[9]全基因組關(guān)聯(lián)分析及其擴(kuò)展方法的研究進(jìn)展[J]. 卜李那,趙毅強(qiáng).  農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2019(01)
[10]全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)在作物農(nóng)藝性狀研究中的應(yīng)用[J]. 姜洪真,馬伯軍,錢前,高振宇.  農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2018(07)

博士論文
[1]甘藍(lán)型油菜分枝角度和株高全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 孫程明.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]CRISPR/Cas9系統(tǒng)在植物基因組編輯中的應(yīng)用[D]. 邢慧麗.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[3]甘藍(lán)型油菜粒重候選基因篩選及轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 耿鑫鑫.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[4]水稻種質(zhì)資源重要農(nóng)藝性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 魯清.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[5]油菜種子耐熱性的鑒定及分子機(jī)理研究[D]. 高桂珍.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[6]甘藍(lán)型油菜粒重母體調(diào)控機(jī)理解析[D]. 李娜.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[7]甘藍(lán)型油菜株型與角果相關(guān)性狀的QTL分析[D]. 漆麗萍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[8]甘藍(lán)型油菜轉(zhuǎn)磷脂酶D(PLD)基因在干旱及氮響應(yīng)中的作用及應(yīng)用[D]. 魯少平.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013

碩士論文
[1]基于GWAS和eQTL分析鑒定甘藍(lán)型油菜含油量相關(guān)位點(diǎn)[D]. 周金枝.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]油菜萌發(fā)期耐淹性種質(zhì)資源篩選與遺傳機(jī)制解析[D]. 陳雅慧.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[3]三磷酸核苷酸轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白調(diào)控甘藍(lán)型油菜油脂合成研究[D]. 李曉.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[4]中國(guó)男性非梗阻性無(wú)精子癥的全轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)研究[D]. 姜婷婷.南京醫(yī)科大學(xué) 2018
[5]油菜粒重基因BnC08.JAZ1-1功能的初步解析[D]. 王瑩.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2018
[6]全基因組關(guān)聯(lián)分析挖掘甘藍(lán)型油菜耐旱候選基因[D]. 洪雙.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2018
[7]甘藍(lán)型油菜種子發(fā)育過(guò)程中油脂積累動(dòng)態(tài)及關(guān)鍵基因的表達(dá)差異分析[D]. 文均.西南大學(xué) 2017
[8]甘藍(lán)型油菜pol CMS恢復(fù)基因調(diào)控因子的篩選和溫敏基因的GWAS分析[D]. 栗凱迪.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[9]甘藍(lán)型油菜粒重和角果長(zhǎng)多效性主效QTL-qSWPL.A9-1的精細(xì)定位和細(xì)胞學(xué)機(jī)制解析[D]. 彭偉.湖北大學(xué) 2016
[10]大豆籽粒大小與形狀性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析和DistortedMap軟件包的研制[D]. 耿青春.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014



本文編號(hào):3483762

資料下載
論文發(fā)表

本文鏈接:http://www.sikaile.net/nykjlw/nzwlw/3483762.html


Copyright(c)文論論文網(wǎng)All Rights Reserved | 網(wǎng)站地圖 |

版權(quán)申明:資料由用戶b03c2***提供,本站僅收錄摘要或目錄,作者需要?jiǎng)h除請(qǐng)E-mail郵箱bigeng88@qq.com