木薯中性/堿性轉(zhuǎn)化酶基因家族的物理定位
發(fā)布時間:2021-10-14 06:49
木薯(Manihot esculenta Crantz)起源于南美洲,是熱帶地區(qū)重要的糧食作物和能源植物。中性/堿性轉(zhuǎn)化酶是木薯淀粉積累過程中的一種關(guān)鍵酶,前人已從木薯中克隆出了中性/堿性轉(zhuǎn)化酶基因家族的11個成員(MeNINV1~10和nINV1),并對其結(jié)構(gòu)進化和表達(dá)情況進行了分析。但將它們在染色體上進行物理定位的報道尚少。本研究以木薯華南6號品種的古銅期嫩葉為材料,制備染色體標(biāo)本,采用熒光原位雜交和原位PCR技術(shù),對木薯中性/堿性轉(zhuǎn)化酶基因家族的10個成員進行了物理定位,明確了它們的分布特點,并闡明了該基因家族與其他功能基因的連鎖關(guān)系。具體結(jié)果如下:(1)對采用木薯華南6號古銅期嫩葉制備染色體標(biāo)本的方法進行了優(yōu)化。研究發(fā)現(xiàn):最適的預(yù)處理方法是使用飽和對二氯苯溶液處理1.5 h,最適的酶解方案是在5%纖維素酶和4%果膠酶的混合液中37℃條件下酶解4.5 h。(2)對熒光原位雜交過程中的漂洗步驟進行了優(yōu)化。結(jié)果表明,雜交后,3次漂洗的時間分別為5 min、5 min和8 min時,標(biāo)本背景最干凈。(3)利用單色熒光原位雜、雙色熒光原位雜交和原位PCR技術(shù),對木薯中性/堿性轉(zhuǎn)化酶基因家...
【文章來源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1間接法HSH技術(shù)的基本原理示意圖??探針與染色體雜交后,經(jīng)過免疫檢測,在目標(biāo)染色體上顯示熒光信號
木薯中性/堿性轉(zhuǎn)化酶基因家族的物理定位流控芯片-熒光原位雜交技術(shù)??控芯片(microfluidicchip)是一種把醫(yī)學(xué)、生物、化學(xué)等分析過程中的應(yīng)、分離、檢測等基本操作單元集成到一塊微米尺度的芯片上,自動完技術(shù)。與微流控芯片技術(shù)相結(jié)合的焚光原位雜交技術(shù)(FISH?on?microc時間內(nèi)完成檢測,而且是自動完成,與傳統(tǒng)的FISH相比,FISHonmicro約70%的試劑,而且可以大大的降低對操作人員的要求。其原理是將整對獨立的兩個部分,兩部分可以獨立的加熱、冷卻、反應(yīng),但兩者間有通。各部分又被分為周圍的裝載室和中間的反應(yīng)室,以常閉閥連接。通過統(tǒng)控制各閥的開關(guān)可以控制試劑在各室間流動,其動力主要是吸入型和泵。其本質(zhì)就是微泵膜轉(zhuǎn)動產(chǎn)生壓力差配合特定的開關(guān)引起試劑定向流應(yīng)有序進行。FISH?on?microchip技術(shù)流程如圖2。??...???--^°
3.1.1.1預(yù)處理時間的優(yōu)化??本研宄采用飽和對二氯苯溶液4°C處理的方法,設(shè)置了】h、1.5h、2h三個梯度??對預(yù)處理的最佳時長進行了摸索(圖3A,?3B,3C)。結(jié)果表明:在其他條件一致的情??況下,預(yù)處理lh的材料所制備的標(biāo)本中,染色體聚縮不完全,形態(tài)不清晰,不利于??染色體計數(shù)、長度測定的分析(圖3A);預(yù)處理1.5?h的材料所制備的標(biāo)本中,大多??中期細(xì)胞的染色體聚縮合適,無拖尾現(xiàn)象,形態(tài)清晰,很適合做核型分析(圖3B);??預(yù)處理2h的材料所制備的標(biāo)本中,雖然染色體的形態(tài)清晰,但聚縮過度,長度大大??減小,著絲粒己不可辨識,不利于核型分析(圖3C)。??綜上所述,研宄認(rèn)為對木薯古銅期嫩葉的預(yù)處理,宜采用飽和對二氯苯溶液4°C??條件下處理1.5?h的方法,這樣獲得的材料,中期細(xì)胞更多,且染色體形態(tài)好,利于??核型分析。??ABC??圖3不同預(yù)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]木薯堿性/中性轉(zhuǎn)化酶MeNINV1基因啟動子的克隆及激素應(yīng)答表達(dá)分析[J]. 王運林,姚遠(yuǎn),耿夢婷,孫沖,尚璐,李瑞梅,符少萍,胡新文,郭建春. 分子植物育種. 2017(02)
[2]不同密度玉米群體子粒轉(zhuǎn)化酶與灌漿強度的關(guān)系[J]. 李光彥,許艷麗,盧霖,王慶燕,董志強. 玉米科學(xué). 2016(04)
[3]木薯蔗糖轉(zhuǎn)運蛋白(SUT)家族基因的染色體物理定位[J]. 李晶晶,王英,高和瓊,李開綿,莊南生. 分子植物育種. 2016(04)
[4]一種穩(wěn)定的人卵母細(xì)胞染色體熒光原位雜交技術(shù)[J]. 李鵬昊,曲婷,黃繼華,韓婷婷,溫子娜,崔淑艷,鐘影. 癌變·畸變·突變. 2016(02)
[5]木薯淀粉合成相關(guān)基因SBE和GBSS的物理定位[J]. 劉平平,王英,高和瓊,李開綿,莊南生. 分子植物育種. 2015(10)
[6]甌柑中性轉(zhuǎn)化酶基因(CrInv1)克隆及序列特征分析[J]. 金微微,陳功楷,郜愛玲. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2015(16)
[7]巴西橡膠樹膠乳轉(zhuǎn)化酶HbNIN基因家族物理定位的研究[J]. 高佳佳,王英,高和瓊,朱穩(wěn),莊南生. 熱帶作物學(xué)報. 2014(09)
[8]13份木薯種質(zhì)資源多樣性分析與系統(tǒng)評價[J]. 謝向譽,陸柳英,曾文丹,張雅媛,李明娟,嚴(yán)華兵. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2014(24)
[9]巴西橡膠樹4個環(huán)鋅指蛋白基因(HbRZF)的物理定位[J]. 官錦燕,王英,高和瓊,莊南生. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2014(03)
[10]熒光原位雜交技術(shù)的研究進展[J]. 何世斌,柴連琴,譚珺雋,沈堯,周萍,馬云峰,李立家. 植物科學(xué)學(xué)報. 2014(02)
博士論文
[1]木薯野生種和栽培種塊根轉(zhuǎn)錄組研究[D]. 宋紅艷.海南大學(xué) 2014
[2]木薯莖稈作為生物質(zhì)能原料的化學(xué)特性研究[D]. 韋茂貴.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]木薯塊根淀粉形態(tài)發(fā)生與積累的酶活性動態(tài)初步研究[D]. 閔義.海南大學(xué) 2010
[4]利用熒光原位雜交技術(shù)(FISH)對中國明對蝦和櫛孔扇貝若干重要基因定位的研究[D]. 郇聘.中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2009
[5]甘蔗親本種特異DNA序列的PCR檢測及原位PCR定位的研究[D]. 王英.華南熱帶農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[6]熒光原位雜交技術(shù)在大白菜染色體基因定位中的應(yīng)用研究[D]. 軒淑欣.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
[7]幾種植物與模式植物基因組的分子細(xì)胞遺傳學(xué)比較分析[D]. 佘朝文.武漢大學(xué) 2005
[8]水稻轉(zhuǎn)化酶基因家族的進化及其在干旱脅迫下的表達(dá)調(diào)控[D]. 紀(jì)雪梅.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2005
[9]果實酸性轉(zhuǎn)化酶研究[D]. 潘秋紅.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
碩士論文
[1]枳堿性/中性轉(zhuǎn)化酶基因PtrA/NINV功能分析[D]. 巴沙爾(BACHAR DAHRO).華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]枳中性轉(zhuǎn)化酶基因PtrNINV克隆及其功能分析[D]. 王菲.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]木薯遺傳圖譜10個標(biāo)記位點的物理定位[D]. 王婧菲.海南大學(xué) 2013
[4]木薯遺傳圖譜9號、17號和18號連鎖群物理定位的研究[D]. 王超.海南大學(xué) 2012
[5]木薯SBEⅡ和MeEFⅠ基因物理定位的研究[D]. 馮耀文.海南大學(xué) 2011
[6]巴西橡膠樹REF、RT和SRPP基因物理定位的研究[D]. 邱海燕.海南大學(xué) 2010
[7]橡膠樹膠乳中性/堿性轉(zhuǎn)化酶基因的克隆及其表達(dá)特性研究[D]. 劉術(shù)金.海南大學(xué) 2010
[8]巴西橡膠樹HbMyb1基因和OPV-10390連鎖標(biāo)記原位PCR定位的研究[D]. 高和瓊.海南大學(xué) 2008
[9]石蒜與忽地笑熒光原位雜交研究[D]. 程曉蕾.南京林業(yè)大學(xué) 2006
[10]原位逆轉(zhuǎn)錄PCR技術(shù)檢測多肽:N-乙酰氨基半乳糖轉(zhuǎn)移酶2(ppGalNAcT2)在腫瘤細(xì)胞及腫瘤組織中的差異表達(dá)[D]. 胡笳.蘇州大學(xué) 2003
本文編號:3435654
【文章來源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1間接法HSH技術(shù)的基本原理示意圖??探針與染色體雜交后,經(jīng)過免疫檢測,在目標(biāo)染色體上顯示熒光信號
木薯中性/堿性轉(zhuǎn)化酶基因家族的物理定位流控芯片-熒光原位雜交技術(shù)??控芯片(microfluidicchip)是一種把醫(yī)學(xué)、生物、化學(xué)等分析過程中的應(yīng)、分離、檢測等基本操作單元集成到一塊微米尺度的芯片上,自動完技術(shù)。與微流控芯片技術(shù)相結(jié)合的焚光原位雜交技術(shù)(FISH?on?microc時間內(nèi)完成檢測,而且是自動完成,與傳統(tǒng)的FISH相比,FISHonmicro約70%的試劑,而且可以大大的降低對操作人員的要求。其原理是將整對獨立的兩個部分,兩部分可以獨立的加熱、冷卻、反應(yīng),但兩者間有通。各部分又被分為周圍的裝載室和中間的反應(yīng)室,以常閉閥連接。通過統(tǒng)控制各閥的開關(guān)可以控制試劑在各室間流動,其動力主要是吸入型和泵。其本質(zhì)就是微泵膜轉(zhuǎn)動產(chǎn)生壓力差配合特定的開關(guān)引起試劑定向流應(yīng)有序進行。FISH?on?microchip技術(shù)流程如圖2。??...???--^°
3.1.1.1預(yù)處理時間的優(yōu)化??本研宄采用飽和對二氯苯溶液4°C處理的方法,設(shè)置了】h、1.5h、2h三個梯度??對預(yù)處理的最佳時長進行了摸索(圖3A,?3B,3C)。結(jié)果表明:在其他條件一致的情??況下,預(yù)處理lh的材料所制備的標(biāo)本中,染色體聚縮不完全,形態(tài)不清晰,不利于??染色體計數(shù)、長度測定的分析(圖3A);預(yù)處理1.5?h的材料所制備的標(biāo)本中,大多??中期細(xì)胞的染色體聚縮合適,無拖尾現(xiàn)象,形態(tài)清晰,很適合做核型分析(圖3B);??預(yù)處理2h的材料所制備的標(biāo)本中,雖然染色體的形態(tài)清晰,但聚縮過度,長度大大??減小,著絲粒己不可辨識,不利于核型分析(圖3C)。??綜上所述,研宄認(rèn)為對木薯古銅期嫩葉的預(yù)處理,宜采用飽和對二氯苯溶液4°C??條件下處理1.5?h的方法,這樣獲得的材料,中期細(xì)胞更多,且染色體形態(tài)好,利于??核型分析。??ABC??圖3不同預(yù)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]木薯堿性/中性轉(zhuǎn)化酶MeNINV1基因啟動子的克隆及激素應(yīng)答表達(dá)分析[J]. 王運林,姚遠(yuǎn),耿夢婷,孫沖,尚璐,李瑞梅,符少萍,胡新文,郭建春. 分子植物育種. 2017(02)
[2]不同密度玉米群體子粒轉(zhuǎn)化酶與灌漿強度的關(guān)系[J]. 李光彥,許艷麗,盧霖,王慶燕,董志強. 玉米科學(xué). 2016(04)
[3]木薯蔗糖轉(zhuǎn)運蛋白(SUT)家族基因的染色體物理定位[J]. 李晶晶,王英,高和瓊,李開綿,莊南生. 分子植物育種. 2016(04)
[4]一種穩(wěn)定的人卵母細(xì)胞染色體熒光原位雜交技術(shù)[J]. 李鵬昊,曲婷,黃繼華,韓婷婷,溫子娜,崔淑艷,鐘影. 癌變·畸變·突變. 2016(02)
[5]木薯淀粉合成相關(guān)基因SBE和GBSS的物理定位[J]. 劉平平,王英,高和瓊,李開綿,莊南生. 分子植物育種. 2015(10)
[6]甌柑中性轉(zhuǎn)化酶基因(CrInv1)克隆及序列特征分析[J]. 金微微,陳功楷,郜愛玲. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2015(16)
[7]巴西橡膠樹膠乳轉(zhuǎn)化酶HbNIN基因家族物理定位的研究[J]. 高佳佳,王英,高和瓊,朱穩(wěn),莊南生. 熱帶作物學(xué)報. 2014(09)
[8]13份木薯種質(zhì)資源多樣性分析與系統(tǒng)評價[J]. 謝向譽,陸柳英,曾文丹,張雅媛,李明娟,嚴(yán)華兵. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2014(24)
[9]巴西橡膠樹4個環(huán)鋅指蛋白基因(HbRZF)的物理定位[J]. 官錦燕,王英,高和瓊,莊南生. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2014(03)
[10]熒光原位雜交技術(shù)的研究進展[J]. 何世斌,柴連琴,譚珺雋,沈堯,周萍,馬云峰,李立家. 植物科學(xué)學(xué)報. 2014(02)
博士論文
[1]木薯野生種和栽培種塊根轉(zhuǎn)錄組研究[D]. 宋紅艷.海南大學(xué) 2014
[2]木薯莖稈作為生物質(zhì)能原料的化學(xué)特性研究[D]. 韋茂貴.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]木薯塊根淀粉形態(tài)發(fā)生與積累的酶活性動態(tài)初步研究[D]. 閔義.海南大學(xué) 2010
[4]利用熒光原位雜交技術(shù)(FISH)對中國明對蝦和櫛孔扇貝若干重要基因定位的研究[D]. 郇聘.中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2009
[5]甘蔗親本種特異DNA序列的PCR檢測及原位PCR定位的研究[D]. 王英.華南熱帶農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[6]熒光原位雜交技術(shù)在大白菜染色體基因定位中的應(yīng)用研究[D]. 軒淑欣.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
[7]幾種植物與模式植物基因組的分子細(xì)胞遺傳學(xué)比較分析[D]. 佘朝文.武漢大學(xué) 2005
[8]水稻轉(zhuǎn)化酶基因家族的進化及其在干旱脅迫下的表達(dá)調(diào)控[D]. 紀(jì)雪梅.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2005
[9]果實酸性轉(zhuǎn)化酶研究[D]. 潘秋紅.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
碩士論文
[1]枳堿性/中性轉(zhuǎn)化酶基因PtrA/NINV功能分析[D]. 巴沙爾(BACHAR DAHRO).華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]枳中性轉(zhuǎn)化酶基因PtrNINV克隆及其功能分析[D]. 王菲.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]木薯遺傳圖譜10個標(biāo)記位點的物理定位[D]. 王婧菲.海南大學(xué) 2013
[4]木薯遺傳圖譜9號、17號和18號連鎖群物理定位的研究[D]. 王超.海南大學(xué) 2012
[5]木薯SBEⅡ和MeEFⅠ基因物理定位的研究[D]. 馮耀文.海南大學(xué) 2011
[6]巴西橡膠樹REF、RT和SRPP基因物理定位的研究[D]. 邱海燕.海南大學(xué) 2010
[7]橡膠樹膠乳中性/堿性轉(zhuǎn)化酶基因的克隆及其表達(dá)特性研究[D]. 劉術(shù)金.海南大學(xué) 2010
[8]巴西橡膠樹HbMyb1基因和OPV-10390連鎖標(biāo)記原位PCR定位的研究[D]. 高和瓊.海南大學(xué) 2008
[9]石蒜與忽地笑熒光原位雜交研究[D]. 程曉蕾.南京林業(yè)大學(xué) 2006
[10]原位逆轉(zhuǎn)錄PCR技術(shù)檢測多肽:N-乙酰氨基半乳糖轉(zhuǎn)移酶2(ppGalNAcT2)在腫瘤細(xì)胞及腫瘤組織中的差異表達(dá)[D]. 胡笳.蘇州大學(xué) 2003
本文編號:3435654
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