沙生牧草沙鞭的遺傳多樣性研究
發(fā)布時間:2021-09-27 21:24
沙鞭(Psammochloa villosa(Trin.)Bor)是禾本科(Gramineae)、沙鞭屬(Psammochloa)一種多年生草本植物,主要依靠根狀莖繁殖,具有較強的耐旱、耐寒、耐堿以及抗風沙能力,是極端沙地環(huán)境下分布的關鍵或唯一草本物種。它不僅具有重要的生態(tài)價值,而且也是重要的優(yōu)勢牧草,同時也是野生牧草利用、極端環(huán)境植物基因資源最具潛在價值的研究對象之一。據此,本研究在全面野外調查基礎上,綜合利用表型性狀和DNA分子標記對沙生牧草沙鞭的遺傳多樣性及其分布格局進行研究,旨在為沙鞭種質資源的保護和利用提供科學依據。主要研究結果如下:1.通過對沙鞭的表型多樣性研究,發(fā)現(xiàn)沙鞭具有豐富的表型多樣性,居群間變異大于居群內變異。其中,旗葉長寬比變異系數(shù)最大,為32.44%,株系相關性狀變異系數(shù)在20%左右;各表型性狀間的相關系數(shù)范圍為0.0020.875,株系相關性狀(如株高、花序長度、小穗長度等)間差異極顯著;主成分累計貢獻率達73.447%,其中主成分1和4主要反映生殖器官性狀,而主成分2和3主要反映營養(yǎng)器官性狀;依據歐式距離對參試居群進行的聚類分析,結果表...
【文章來源】:青海師范大學青海省
【文章頁數(shù)】:84 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
沙鞭種質資源采集地理分布圖
表 3-2 ITS 片段 PCR 擴增反應體系和擴增程序(25 μL 體系)Table 3-2 Reaction system and amplification procedure of ITS fragment (25 μL)反應體系Reaction system擴增程序Amplification procedureddH2O 17.25 μL 94℃ 5 min×PCR buffer 2.5 μL 94℃50 s4×dNTP 2 μL 54.6℃ 1 minPrimer-F 1 μL 72℃ 1 minPrimer-R 1 μL 72℃ 10 minTaq 酶 0.25 μL 4℃ endDNA 模板 1 μLPCR 擴增反應結束后,取 2 μL 擴增產物用 1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測后,提 DNA 的片段長度和 DNA 降解情況,然后用紫外凝膠成像系統(tǒng)觀察并拍照 3-1)。最后將剩余的 PCR 產物送至北京華大基因測序有限公司進行常規(guī)測測序結果如圖 3-2 所示。36 c
圖 3-2 沙鞭 ITS 片段部分測序峰形圖譜Fig.3-2 The partial sequence picture of ITS fragment of P. villosa 結果和分析.1 ITS 序列的多態(tài)性分析本研究用沙鞭葉片提取基因組 DNA,通過優(yōu)化后的 PCR 反應體系,對 10鞭居群進行擴增,瓊脂糖凝膠電泳后發(fā)現(xiàn)在 ITS 引物條件下,其所有個體均定擴增,片段長度介于750 bp ~1000 bp,共獲得608個個體的沙鞭ITS序列,軟件 MEGA6 對測序數(shù)據進行峰圖比對校正,將兩端切平后,片段總長為 bp。該區(qū)段的平均堿基含量,C>G>A>T,其 G+C 含量約為 62.7%,其中四基中 C 的平均含量最高,為 32.9%;而堿基 T 的平均含量最低,為 17.5%變異大部分在 A 與 G、T 與 C 之間,占總變異位點的 74.81%,故 nrITS 序變異大部分為轉換(Transition),少數(shù)為顛換(Transversion)。詳細信息如
【參考文獻】:
期刊論文
[1]黃草烏與展毛黃草烏葉綠體全基因組結構的比較分析[J]. 李雪佩,孟靜,張琳娜,何俊. 中藥材. 2018(08)
[2]青藏高原特有種—藏扇穗茅葉綠體基因組測序及序列分析[J]. 劉玉萍,呂婷,朱迪,周勇輝,劉濤,蘇旭. 植物研究. 2018(04)
[3]鎖陽ITS序列遺傳多樣性分析[J]. 任夢云,杜樂山,陳彥君,張盾,沈奇,關瀟,張銀東. 植物學報. 2018(03)
[4]基于ITS序列的靈芝遺傳多樣性與群體遺傳分化研究[J]. 劉雪瑩,韓玉立,司靜,李春道,崔寶凱. 菌物學報. 2018(05)
[5]基于AFLP的茶花種質資源遺傳多樣性研究[J]. 楊旭,吳德智,袁偉,胡孝枝. 江蘇農業(yè)科學. 2018(03)
[6]基于ISSR標記的江西野生寒蘭居群遺傳多樣性研究[J]. 江亞雯,孫小琴,羅火林,楊柏云,熊冬金. 園藝學報. 2017(10)
[7]柱花草種質資源表型性狀的多樣性分析[J]. 蔣亞君,申晴,丁西朋,嚴琳玲,劉國道,白昌軍. 草業(yè)科學. 2017(05)
[8]貴州芝麻種質資源主要表型性狀的遺傳多樣性[J]. 魏忠芬,楊勝先,李振動,李慧琳,奉斌,林濤. 貴州農業(yè)科學. 2016(11)
[9]苦玄參40個株系表型性狀遺傳多樣性分析[J]. 謝陽姣,何志鵬,閆國躍,李耀燕,符標芳,白燕遠,馮秋瑜. 廣西植物. 2017(03)
[10]我國北方9份旱生—沙生植物蒙古冰草遺傳多樣性研究[J]. 李曉全,高有漢,劉揚,索培芬,韓冰. 草業(yè)學報. 2016(03)
博士論文
[1]青藏高原特有屬固沙草屬的物種界定與遺傳多樣性研究[D]. 劉玉萍.陜西師范大學 2015
[2]中型狼尾草種質特性及遺傳多樣性研究[D]. 張懷山.甘肅農業(yè)大學 2014
[3]玉米單向異交不親和基因Ga1的遺傳分析及精細定位[D]. 劉旭.山東農業(yè)大學 2013
[4]西藏圓柏復合體的群體遺傳學與物種形成研究[D]. 李忠虎.蘭州大學 2010
[5]厚樸遺傳多樣性研究及指紋圖譜的構建[D]. 鄭志雷.福建農林大學 2010
[6]沙芥屬植物遺傳多樣性及其親緣關系研究[D]. 張鳳蘭.內蒙古農業(yè)大學 2009
[7]用形態(tài)標記和分子標記研究蠟梅栽培種質的遺傳多樣性[D]. 趙凱歌.華中農業(yè)大學 2007
[8]披堿草屬植物遺傳多樣性研究[D]. 嚴學兵.中國農業(yè)大學 2005
碩士論文
[1]羊草葉綠體全基因組分析及分子標記開發(fā)[D]. 楊艷婷.揚州大學 2018
[2]內蒙古入侵植物光梗蒺藜草遺傳多樣性與分子系統(tǒng)地理學研究[D]. 楊新英.內蒙古農業(yè)大學 2018
[3]青藏高原高寒草甸鈍裂銀蓮花居群遺傳多樣性及其與生態(tài)因子的相關研究[D]. 劉志鵬.蘭州理工大學 2017
[4]基于ITS和cpDNA petB-petD序列的寒蘭群體遺傳結構及遺傳多樣性研究[D]. 江亞雯.南昌大學 2017
[5]沙生植物大賴草種質資源遺傳結構及克隆多樣性的研究[D]. 蔡小霞.新疆農業(yè)大學 2016
[6]中國櫻桃地方種質表型性狀遺傳多樣性分析[D]. 劉胤.四川農業(yè)大學 2016
[7]竹節(jié)草種資源遺傳多樣性研究及抗性評價[D]. 張欣怡.海南大學 2016
[8]縉云黃芩(Scutellaria tsinyunensis C.Y.Wu et S.Chow)及近緣種基于ITS和cpDNA序列的遺傳多樣性研究[D]. 徐夢平.西南大學 2016
[9]基于ITS序列的栽培中國櫻桃遺傳多樣性及其群體遺傳結構分析[D]. 何文.四川農業(yè)大學 2014
[10]沙漠超旱生植物紅砂的遺傳多樣性分析[D]. 蘇愿.電子科技大學 2013
本文編號:3410640
【文章來源】:青海師范大學青海省
【文章頁數(shù)】:84 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
沙鞭種質資源采集地理分布圖
表 3-2 ITS 片段 PCR 擴增反應體系和擴增程序(25 μL 體系)Table 3-2 Reaction system and amplification procedure of ITS fragment (25 μL)反應體系Reaction system擴增程序Amplification procedureddH2O 17.25 μL 94℃ 5 min×PCR buffer 2.5 μL 94℃50 s4×dNTP 2 μL 54.6℃ 1 minPrimer-F 1 μL 72℃ 1 minPrimer-R 1 μL 72℃ 10 minTaq 酶 0.25 μL 4℃ endDNA 模板 1 μLPCR 擴增反應結束后,取 2 μL 擴增產物用 1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測后,提 DNA 的片段長度和 DNA 降解情況,然后用紫外凝膠成像系統(tǒng)觀察并拍照 3-1)。最后將剩余的 PCR 產物送至北京華大基因測序有限公司進行常規(guī)測測序結果如圖 3-2 所示。36 c
圖 3-2 沙鞭 ITS 片段部分測序峰形圖譜Fig.3-2 The partial sequence picture of ITS fragment of P. villosa 結果和分析.1 ITS 序列的多態(tài)性分析本研究用沙鞭葉片提取基因組 DNA,通過優(yōu)化后的 PCR 反應體系,對 10鞭居群進行擴增,瓊脂糖凝膠電泳后發(fā)現(xiàn)在 ITS 引物條件下,其所有個體均定擴增,片段長度介于750 bp ~1000 bp,共獲得608個個體的沙鞭ITS序列,軟件 MEGA6 對測序數(shù)據進行峰圖比對校正,將兩端切平后,片段總長為 bp。該區(qū)段的平均堿基含量,C>G>A>T,其 G+C 含量約為 62.7%,其中四基中 C 的平均含量最高,為 32.9%;而堿基 T 的平均含量最低,為 17.5%變異大部分在 A 與 G、T 與 C 之間,占總變異位點的 74.81%,故 nrITS 序變異大部分為轉換(Transition),少數(shù)為顛換(Transversion)。詳細信息如
【參考文獻】:
期刊論文
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[9]苦玄參40個株系表型性狀遺傳多樣性分析[J]. 謝陽姣,何志鵬,閆國躍,李耀燕,符標芳,白燕遠,馮秋瑜. 廣西植物. 2017(03)
[10]我國北方9份旱生—沙生植物蒙古冰草遺傳多樣性研究[J]. 李曉全,高有漢,劉揚,索培芬,韓冰. 草業(yè)學報. 2016(03)
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[1]青藏高原特有屬固沙草屬的物種界定與遺傳多樣性研究[D]. 劉玉萍.陜西師范大學 2015
[2]中型狼尾草種質特性及遺傳多樣性研究[D]. 張懷山.甘肅農業(yè)大學 2014
[3]玉米單向異交不親和基因Ga1的遺傳分析及精細定位[D]. 劉旭.山東農業(yè)大學 2013
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[1]羊草葉綠體全基因組分析及分子標記開發(fā)[D]. 楊艷婷.揚州大學 2018
[2]內蒙古入侵植物光梗蒺藜草遺傳多樣性與分子系統(tǒng)地理學研究[D]. 楊新英.內蒙古農業(yè)大學 2018
[3]青藏高原高寒草甸鈍裂銀蓮花居群遺傳多樣性及其與生態(tài)因子的相關研究[D]. 劉志鵬.蘭州理工大學 2017
[4]基于ITS和cpDNA petB-petD序列的寒蘭群體遺傳結構及遺傳多樣性研究[D]. 江亞雯.南昌大學 2017
[5]沙生植物大賴草種質資源遺傳結構及克隆多樣性的研究[D]. 蔡小霞.新疆農業(yè)大學 2016
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[7]竹節(jié)草種資源遺傳多樣性研究及抗性評價[D]. 張欣怡.海南大學 2016
[8]縉云黃芩(Scutellaria tsinyunensis C.Y.Wu et S.Chow)及近緣種基于ITS和cpDNA序列的遺傳多樣性研究[D]. 徐夢平.西南大學 2016
[9]基于ITS序列的栽培中國櫻桃遺傳多樣性及其群體遺傳結構分析[D]. 何文.四川農業(yè)大學 2014
[10]沙漠超旱生植物紅砂的遺傳多樣性分析[D]. 蘇愿.電子科技大學 2013
本文編號:3410640
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