甘薯塊根發(fā)育及非生物脅迫相關(guān)MADS-box基因的篩
發(fā)布時(shí)間:2021-08-31 05:21
甘薯(Ipomoea batatas)是世界上重要的糧食、飼料、蔬菜、工業(yè)原料和新型能源作物。提高甘薯產(chǎn)量已成為當(dāng)前甘薯育種的主要方向之一。MADS-box蛋白是一類重要的轉(zhuǎn)錄因子,在植物生長(zhǎng)發(fā)育及抗逆等過程發(fā)揮著重要功能。我們利用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)及甘薯近緣野生種I.trifida全基因組數(shù)據(jù)在甘薯(Xu22)中篩選并克隆到8個(gè)MADS-box基因;利用實(shí)時(shí)定量RT-PCR對(duì)其在甘薯各組織的表達(dá)特性進(jìn)行了分析;對(duì)甘薯幼苗進(jìn)行了非生物脅迫和激素處理,利用實(shí)時(shí)定量RT-PCR分析了8個(gè)MADS-box基因?qū)Ψ巧锩{迫和激素的響應(yīng),篩選到一個(gè)可能與甘薯塊根發(fā)育和抗逆相關(guān)的MADS-box基因Ib MBP4,利用農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化法在番茄中異源超表達(dá)了該基因,初步分析了Ib MBP4的功能。主要研究結(jié)果如下:(1)通過轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)及I.trifida全基因組數(shù)據(jù)庫(kù)篩選到8個(gè)MADS-box基因,以甘薯栽培種徐薯22葉、莖、根混合c DNA為模板,克隆了8個(gè)MADS-box基因。(2)通過生物信息學(xué)分析了8個(gè)MADS-box蛋白的基本理化性質(zhì)。對(duì)各MADS-box基因進(jìn)行了亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè),發(fā)現(xiàn)這8個(gè)基因都定位于...
【文章來源】:江蘇師范大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:127 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
甘薯各組織總RNA電泳圖
江蘇師范大學(xué)碩士學(xué)位論文20表2-4各組織RNA的濃度測(cè)定Table2-4DeterminationoftheconcentrationofRNAsineachtissue材料名稱(中文)英文縮寫濃度(ng/μL)260/280葉L937.81.99莖S541.61.84纖維根FR640.31.88發(fā)育根1DR1322.11.89發(fā)育根2DR2307.41.86成熟根MR370.11.92從以上結(jié)果我們可以看出,所提取RNA的質(zhì)量良好,28S和18S條帶較亮,5s條帶明顯,且亮度較弱,并且濃度較高,可用于后續(xù)反轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)。2.3.2MADS-box基因的擴(kuò)增根據(jù)已有的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),結(jié)合公布的I.trifida全基因組數(shù)據(jù)庫(kù),應(yīng)用引物設(shè)計(jì)軟件PrimerPremier5,設(shè)計(jì)得到8對(duì)MADS-box引物,以之前反轉(zhuǎn)錄所得徐22各組織(葉、莖、纖維根、發(fā)育根初期、發(fā)育根后期和成熟塊根)混合cDNA為模板,分別對(duì)8個(gè)MADS-box基因進(jìn)行了克攏如圖2-2、2-3和2-4所示,所擴(kuò)增條帶大小與理論片段長(zhǎng)度一致(IbMBP1:450bp,IbMBP2:666bp,IbMBP4:1036bp,IbMBP5:774bp,IbMBP6:648bp,IbMBP7:696bp,IbMBP8:636bp,IbMBP10:597bp),可以用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。圖2-2MADS-box基因PCR電泳圖Figure2-2ThePCRelectrophoresisofMADS-boxgenesM:DL2000Marker,1:IbMBP1,2:IbMBP2,3:IbMBP6,4:IbMBP7,5:IbMBP8,6:IbMBP10M:DL2000Marker,1:IbMBP1,2:IbMBP2,3:IbMBP6,4:IbMBP7,5:IbMBP8,6:IbMBP10
第二章甘薯MADS-box基因的篩選及克隆21圖2-3IbMBP4基因PCR電泳圖Figure2-3ThePCRelectrophoresisofIbMBP4geneM:DL2000Marker,1~5:IbMBP4基因M:DL2000Marker,1~5:IbMBP4gene圖2-4IbMBP5基因PCR電泳圖Figure2-4ThePCRelectrophoresisofIbMBP5geneM:DL2000Marker,1:IbMBP5基因M:DL2000Marker,1:IbMBP5gene2.3.3陽(yáng)性單克隆的篩選將PCR所得條帶經(jīng)過純化加A尾后,與克隆載體pMD19-T連接,轉(zhuǎn)入大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞后,利用菌落PCR對(duì)長(zhǎng)出的單菌落進(jìn)行陽(yáng)性鑒定。如圖2-5至2-11所示,篩選獲得7個(gè)IbMBP1陽(yáng)性克壟7個(gè)IbMBP2陽(yáng)性克壟10個(gè)IbMBP4陽(yáng)性克壟8個(gè)IbMBP5陽(yáng)性克壟3個(gè)IbMBP6陽(yáng)性克壟6個(gè)IbMBP7陽(yáng)性克壟7個(gè)IbMBP8陽(yáng)性克隆和8個(gè)IbMBP10陽(yáng)性克攏圖2-5IbMBP1基因菌落PCRFigure2-5ThebacteriaPCRofIbMBP1geneM:DL2000Marker,1~7:七個(gè)IbMBP1陽(yáng)性克隆M:DL2000Marker,1~7:sevenIbMBP1positiveclones
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]甘薯種植對(duì)蘇北沿海灘涂土壤環(huán)境的影響[J]. 劉沖,王茂文,邢錦城,丁海榮,朱小梅,趙寶泉,董靜,溫祝桂,洪立洲. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2016(11)
[2]甘薯抗旱鑒定及生理響應(yīng)研究[J]. 劉恩良,曹清河,唐君,金平. 新疆農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(06)
[3]我國(guó)薯類基礎(chǔ)研究的動(dòng)態(tài)與展望[J]. 張鵬. 生物技術(shù)通報(bào). 2015(04)
[4]甘薯耐非生物脅迫的分子生物學(xué)研究進(jìn)展[J]. 王福琴,侯夫云,秦楨,李愛賢,董順旭,王慶美,張立明. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2015(01)
[5]甘薯塊根生長(zhǎng)及其淀粉體發(fā)育過程的解剖結(jié)構(gòu)特征[J]. 荊彥平,李棟梁,劉大同,余徐潤(rùn),胡慕蘭,顧蘊(yùn)潔,王忠. 西北植物學(xué)報(bào). 2013(12)
[6]國(guó)內(nèi)外甘薯產(chǎn)業(yè)發(fā)展概況[J]. 馬劍鳳,程金花,汪潔,戴紅君,戴起偉. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(12)
[7]中國(guó)甘薯產(chǎn)業(yè)及產(chǎn)業(yè)技術(shù)的發(fā)展與展望[J]. 馬代夫,李強(qiáng),曹清河,鈕福祥,謝逸萍,唐君,李洪民. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2012(05)
[8]不同類型甘薯品種主要經(jīng)濟(jì)性狀和營(yíng)養(yǎng)成分差異[J]. 劉桂玲,張鵬,鄭建利,楊俊,趙豐玲,田昌庚,史春余. 中國(guó)糧油學(xué)報(bào). 2012(02)
[9]五大類傳統(tǒng)植物激素對(duì)植物響應(yīng)鹽脅迫的調(diào)控[J]. 姚曼紅,劉琳,曾幼玲. 生物技術(shù)通報(bào). 2011(11)
[10]RNAi技術(shù)研究新進(jìn)展[J]. 周紅建,黃松,王雄偉. 生物技術(shù)通報(bào). 2010(12)
碩士論文
[1]番茄SlMADS23-like基因的克隆及功能研究[D]. 封葉.重慶大學(xué) 2016
[2]外源ABA和ZT對(duì)小麥穗花發(fā)育調(diào)控效應(yīng)的研究[D]. 戴曉琴.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2002
[3]中國(guó)甘薯(Ipomoea batatas)品種資源遺傳多樣性及分子鑒定研究[D]. 王士泉.山東師范大學(xué) 2002
本文編號(hào):3374277
【文章來源】:江蘇師范大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:127 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
甘薯各組織總RNA電泳圖
江蘇師范大學(xué)碩士學(xué)位論文20表2-4各組織RNA的濃度測(cè)定Table2-4DeterminationoftheconcentrationofRNAsineachtissue材料名稱(中文)英文縮寫濃度(ng/μL)260/280葉L937.81.99莖S541.61.84纖維根FR640.31.88發(fā)育根1DR1322.11.89發(fā)育根2DR2307.41.86成熟根MR370.11.92從以上結(jié)果我們可以看出,所提取RNA的質(zhì)量良好,28S和18S條帶較亮,5s條帶明顯,且亮度較弱,并且濃度較高,可用于后續(xù)反轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)。2.3.2MADS-box基因的擴(kuò)增根據(jù)已有的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),結(jié)合公布的I.trifida全基因組數(shù)據(jù)庫(kù),應(yīng)用引物設(shè)計(jì)軟件PrimerPremier5,設(shè)計(jì)得到8對(duì)MADS-box引物,以之前反轉(zhuǎn)錄所得徐22各組織(葉、莖、纖維根、發(fā)育根初期、發(fā)育根后期和成熟塊根)混合cDNA為模板,分別對(duì)8個(gè)MADS-box基因進(jìn)行了克攏如圖2-2、2-3和2-4所示,所擴(kuò)增條帶大小與理論片段長(zhǎng)度一致(IbMBP1:450bp,IbMBP2:666bp,IbMBP4:1036bp,IbMBP5:774bp,IbMBP6:648bp,IbMBP7:696bp,IbMBP8:636bp,IbMBP10:597bp),可以用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。圖2-2MADS-box基因PCR電泳圖Figure2-2ThePCRelectrophoresisofMADS-boxgenesM:DL2000Marker,1:IbMBP1,2:IbMBP2,3:IbMBP6,4:IbMBP7,5:IbMBP8,6:IbMBP10M:DL2000Marker,1:IbMBP1,2:IbMBP2,3:IbMBP6,4:IbMBP7,5:IbMBP8,6:IbMBP10
第二章甘薯MADS-box基因的篩選及克隆21圖2-3IbMBP4基因PCR電泳圖Figure2-3ThePCRelectrophoresisofIbMBP4geneM:DL2000Marker,1~5:IbMBP4基因M:DL2000Marker,1~5:IbMBP4gene圖2-4IbMBP5基因PCR電泳圖Figure2-4ThePCRelectrophoresisofIbMBP5geneM:DL2000Marker,1:IbMBP5基因M:DL2000Marker,1:IbMBP5gene2.3.3陽(yáng)性單克隆的篩選將PCR所得條帶經(jīng)過純化加A尾后,與克隆載體pMD19-T連接,轉(zhuǎn)入大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞后,利用菌落PCR對(duì)長(zhǎng)出的單菌落進(jìn)行陽(yáng)性鑒定。如圖2-5至2-11所示,篩選獲得7個(gè)IbMBP1陽(yáng)性克壟7個(gè)IbMBP2陽(yáng)性克壟10個(gè)IbMBP4陽(yáng)性克壟8個(gè)IbMBP5陽(yáng)性克壟3個(gè)IbMBP6陽(yáng)性克壟6個(gè)IbMBP7陽(yáng)性克壟7個(gè)IbMBP8陽(yáng)性克隆和8個(gè)IbMBP10陽(yáng)性克攏圖2-5IbMBP1基因菌落PCRFigure2-5ThebacteriaPCRofIbMBP1geneM:DL2000Marker,1~7:七個(gè)IbMBP1陽(yáng)性克隆M:DL2000Marker,1~7:sevenIbMBP1positiveclones
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]甘薯種植對(duì)蘇北沿海灘涂土壤環(huán)境的影響[J]. 劉沖,王茂文,邢錦城,丁海榮,朱小梅,趙寶泉,董靜,溫祝桂,洪立洲. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2016(11)
[2]甘薯抗旱鑒定及生理響應(yīng)研究[J]. 劉恩良,曹清河,唐君,金平. 新疆農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(06)
[3]我國(guó)薯類基礎(chǔ)研究的動(dòng)態(tài)與展望[J]. 張鵬. 生物技術(shù)通報(bào). 2015(04)
[4]甘薯耐非生物脅迫的分子生物學(xué)研究進(jìn)展[J]. 王福琴,侯夫云,秦楨,李愛賢,董順旭,王慶美,張立明. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2015(01)
[5]甘薯塊根生長(zhǎng)及其淀粉體發(fā)育過程的解剖結(jié)構(gòu)特征[J]. 荊彥平,李棟梁,劉大同,余徐潤(rùn),胡慕蘭,顧蘊(yùn)潔,王忠. 西北植物學(xué)報(bào). 2013(12)
[6]國(guó)內(nèi)外甘薯產(chǎn)業(yè)發(fā)展概況[J]. 馬劍鳳,程金花,汪潔,戴紅君,戴起偉. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(12)
[7]中國(guó)甘薯產(chǎn)業(yè)及產(chǎn)業(yè)技術(shù)的發(fā)展與展望[J]. 馬代夫,李強(qiáng),曹清河,鈕福祥,謝逸萍,唐君,李洪民. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2012(05)
[8]不同類型甘薯品種主要經(jīng)濟(jì)性狀和營(yíng)養(yǎng)成分差異[J]. 劉桂玲,張鵬,鄭建利,楊俊,趙豐玲,田昌庚,史春余. 中國(guó)糧油學(xué)報(bào). 2012(02)
[9]五大類傳統(tǒng)植物激素對(duì)植物響應(yīng)鹽脅迫的調(diào)控[J]. 姚曼紅,劉琳,曾幼玲. 生物技術(shù)通報(bào). 2011(11)
[10]RNAi技術(shù)研究新進(jìn)展[J]. 周紅建,黃松,王雄偉. 生物技術(shù)通報(bào). 2010(12)
碩士論文
[1]番茄SlMADS23-like基因的克隆及功能研究[D]. 封葉.重慶大學(xué) 2016
[2]外源ABA和ZT對(duì)小麥穗花發(fā)育調(diào)控效應(yīng)的研究[D]. 戴曉琴.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2002
[3]中國(guó)甘薯(Ipomoea batatas)品種資源遺傳多樣性及分子鑒定研究[D]. 王士泉.山東師范大學(xué) 2002
本文編號(hào):3374277
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