蔗糖轉(zhuǎn)運蛋白（sucrose transporters, SUTs）屬于跨膜轉(zhuǎn)運蛋白,大多數(shù)參與蔗糖的吸收和轉(zhuǎn)運。迄今為止,對高粱蔗糖轉(zhuǎn)運蛋白知之甚少,為進一步研究高粱蔗糖轉(zhuǎn)運蛋白家族（SbSUTs）,本研究利用生物信息學方法對SbSUTs的6個成員（編號SbSUT1～SbSUT6）進行蛋白理化性質(zhì)、基因結(jié)構(gòu)、蛋白結(jié)構(gòu)、同源性及系統(tǒng)進化樹構(gòu)建等分析。結(jié)果表明:SbSUTs是一種無信號肽、定位于質(zhì)膜和葉綠體類囊膜上的疏水性膜蛋白;SbSUTs均具有GPH結(jié)構(gòu)功能域,是高度保守的蛋白;α-螺旋和無規(guī)卷曲是主要的二級結(jié)構(gòu)元件,其三級結(jié)構(gòu)較為相似。本研究為探究SbSUTs蛋白家族在高粱的蔗糖吸收及轉(zhuǎn)運中的功能提供理論依據(jù)。 

【文章來源】：基因組學與應用生物學. 2020,39(02)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：10 頁

【部分圖文】：

SbSUTs的內(nèi)含子與外顯子分析

分析高粱Sb SUTs家族6個成員蛋白基本信息(表3)，高粱Sb SUTs的蛋白質(zhì)理化性分析結(jié)果顯示：蛋白質(zhì)的氨基酸長度在501～595 bp之間，其中SbSUT2氨基酸數(shù)目最多，Sb SUT4氨基酸數(shù)目最少。蛋白質(zhì)的相對分子質(zhì)量最大的是SbSUT2，為63 437.04 Da，最小的是Sb SUT3，為53 207.23 Da。SbSUT1理論等電點最大為8.86,SbSUT2理論等電點最小為6.00。蛋白質(zhì)的消光系數(shù)預在99 640～78 795之間，最大為SbSUT5，最小為SbSUT3。蛋白質(zhì)的不穩(wěn)定系數(shù)在27.49～37.74之間，SbSUT3最大，SbSUT1最小，結(jié)果顯示這6種高粱蔗糖轉(zhuǎn)運蛋白均為穩(wěn)定蛋白。蛋白質(zhì)的脂肪系數(shù)在94.62～107.43之間，平均為102.39,SbSUT6的脂肪系數(shù)最大，SbSUT2的最小。具有相對較高的脂肪系數(shù)，使蛋白在不同環(huán)境中擁有良好的穩(wěn)定性，有益于其功能的正常發(fā)揮。SbSUTs的總平均親水性數(shù)值在0.311～0.607之間，說明SbSUTs屬于疏水性蛋白。1.4 SbSUTs的蛋白結(jié)構(gòu)預測

利用Phyre2預測高粱SbSUTs蛋白的三級結(jié)構(gòu)模型(圖3)，除SbSUT5的預測置信度是99.9%，其他5個成員的預測置信度均為100%。從圖中可以看出，SbSUTs蛋白質(zhì)具有豐富的α-螺旋和無規(guī)卷曲，還有少量的β-折疊和β-轉(zhuǎn)角，與二級結(jié)構(gòu)預測結(jié)果基本一致。1.5 SbSUTs的系統(tǒng)發(fā)育樹分析

【參考文獻】：
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碩士論文
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本文編號：3323841