KTM3315A屬于非1B/1R類型的K型小麥雄性不育系,具有粘果山羊草的細(xì)胞質(zhì)背景,含有莫迦小麥1BS染色體上的T型育性恢復(fù)基因Rf3和K型育性恢復(fù)基因rfv1,其育性具有生態(tài)敏感性,屬YM型小麥溫敏細(xì)胞質(zhì)雄性不育系,在小麥兩系雜交育種中具有一定的應(yīng)用潛力,已有學(xué)者對其形態(tài)及生理做出相關(guān)研究,但是其育性轉(zhuǎn)換的分子機(jī)制仍然尚待研究。本實(shí)驗(yàn)的目的在于通過多方面分析驗(yàn)證,初步揭示KTM3315A的育性轉(zhuǎn)換分子機(jī)理,為更有效地利用和改善KTM3315A提供理論依據(jù),也期望為小麥溫敏雄性不育系的研究有所貢獻(xiàn)。本實(shí)驗(yàn)利用在不同溫度條件下的不育系KTM3315A在育性轉(zhuǎn)換關(guān)鍵時(shí)期的花藥進(jìn)行l(wèi)ncRNA測序分析,旨在通過生物信息學(xué)分析差異表達(dá)mRNA,對其進(jìn)行功能富集分析,確定育性轉(zhuǎn)換的候選基因和關(guān)鍵代謝通路;并通過分析lncRNA的測序結(jié)果,對lncRNA的靶基因進(jìn)行預(yù)測,根據(jù)靶基因差異表達(dá)情況進(jìn)行生物信息學(xué)分析,推測lncRNA調(diào)控育性轉(zhuǎn)換的作用機(jī)制;除此之外還對三個(gè)發(fā)育時(shí)期的育性轉(zhuǎn)換相關(guān)基因進(jìn)行了qRT-PCR測定。獲得以下研究結(jié)果:1、完成6個(gè)樣品的長鏈非編碼RNA測序,共獲得72.72Gb... 

【文章來源】：西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：73 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

KTM3315A在不同育性條件下（AF：A-C，AS：D-F）植物花藥和雌蕊外部形態(tài)特征的比較

5A 在不同育性條件下（AF：A-C，AS：D-F）植物花藥和雌蕊外部A，D：單核晚期；B，E：二核期；C，F(xiàn)：三核期 Bar，0.5mmrison of plant anther and pistil external morphological characteristicsunder the different fertility condition (AF: A-C, AS: D-F) uninucleate stage；B,E： binucleate stage；C,F： trinucleate stage

2-3 不同育性條件下（AF：A-E，AS：F-J）的 KTM3315A 的花粉細(xì)胞的 DAPI 染色A，F(xiàn)：四分體; B，G：單核早期; C，H：單核晚期; D，I：二核期; E，J：三核期ig. 2-3 Comparison of DAPI-stained of pollen of KTM3315A under the different fertility co-E, AS: F-J). A，F(xiàn)：tetrad stage；B，G：early uninucleate stage；C，H： later uninucleaD，I：binucleate stage；E，J：trinucleate stage 測序質(zhì)量的評估估測序質(zhì)量主要根據(jù)以下幾個(gè)指標(biāo)：Total Reads：按單端計(jì)算的 Clean Readed Reads：比對到參考基因組上的 Reads 數(shù)目及在 Clean Reads 中占的百分比ed Reads：比對到參考基因組唯一位置的 Reads 數(shù)目及在 Clean Reads 中占C（%）：Clean Data GC 含量，是指總堿基中 G 和 C 兩種堿基的百分比；N中未分辨堿基占的百分比；Q30（%）：質(zhì)量值大于或等于 Q30 的堿基占比。比對效率指比對上的 Reads 占 Clean Reads 的百分比，是數(shù)據(jù)利用率。經(jīng)過測序質(zhì)量控制，共得到 72.72Gb Clean Data，各樣品 Clean Data Gb，Q30 堿基百分比在 95.52%及以上，GC 含量范圍從 53.89 到 55.06，各 與參考基因組的比對效率從 65.85%到 70.51%不等。每個(gè)樣本的數(shù)據(jù)輸出

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博士論文
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本文編號：3212651