開花時間QTLs在油菜A基因組上的位置以及與之連鎖標(biāo)記的開發(fā)
發(fā)布時間:2021-04-19 06:40
開花時間是熟期指示性狀,開花時間早的油菜早熟。目前,開花時間QTL的定位研究仍處于粗定位,定位出的開花時間QTL(Quantitative trait locus)與標(biāo)記之間的距離較大,在進行標(biāo)記輔助育種時存在偏差。本研究在前期研究的基礎(chǔ)上,對A基因組上定位出的與開花時間QTL連鎖的SSR標(biāo)記進行分離、測序,確定了開花時間QTL所在的染色體;根據(jù)所在染色體的參考基因組,利用同源系列法開發(fā)了與開花時間QTL連鎖的標(biāo)記,并結(jié)合BSA法對QTL所在區(qū)段進行了加密,選出了與開花時間QTL緊密連鎖的標(biāo)記;在DNA水平和RNA水平上對QTL所在區(qū)段內(nèi)的候選基因進行分析。該項研究為進一步進行標(biāo)記輔助育種奠定基礎(chǔ)。論文主要研究結(jié)果如下:(1)利用BSA法對已建圖譜上與開花時間QTL連鎖的85個SSR標(biāo)記進行篩選后發(fā)現(xiàn)有6對引物在親本和極端基因池中能擴增出9個特異性的條帶,經(jīng)標(biāo)記分離、測序后初步確定開花時間QTL FQ10和FQ12在A3染色體上的4785 Kb-11400 Kb的區(qū)間內(nèi)。(2)根據(jù)QTLs所在的A3染色體參考基因組NC027759.2上的2500 Kb-12500...
【文章來源】:青海大學(xué)青海省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:79 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
引物篩選結(jié)果
圖 2.2 125 號引物的電泳結(jié)果Figure 2.2 Electrophoresis results for 125M:100bp DNALadder Marker 1-5:早熟親本 6-10:晚熟11-15:早花基因池 16-20:晚花基因池 Note:M:100bp DNALadder Marker 1-5:Early flowering paren6-10: Late flowering parents15:Early flowering gene pool 16-20:Late flowering gene PCR 及差異片段的測序酰胺凝膠回收產(chǎn)物為模板進行 PCR 擴增,擴增產(chǎn)物行電泳,并將獲得的片段與聚丙烯酰胺上的片段進片段從瓊脂糖凝膠上切下來,進行膠回收。其中部2.3 所示。
圖 2.3 125-1 二次 PCR 的電泳結(jié)果Electrophoresis results for the second:100bp Ladder Marker 1-2:二次 P100bp Ladder Marker 1-2: Secon瓊脂糖凝膠回收試劑盒回收;厥辗志候炞C的結(jié)果如圖 2.4 所示
【參考文獻】:
期刊論文
[1]油菜產(chǎn)業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀及面臨的機遇[J]. 謝慧,譚太龍,羅晴,楊柳,陳光輝. 作物研究. 2018(05)
[2]擬南芥成花調(diào)控途徑的研究進展[J]. 齊仙惠,巫東堂,李改珍,趙軍良,李梅蘭. 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2018(09)
[3]葡萄無核性狀的SSR新分子標(biāo)記開發(fā)及應(yīng)用[J]. 馬亞茹,馮建燦,劉崇懷,樊秀彩,孫海生,姜建福,張穎. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(13)
[4]水稻抗稻瘟病基因Pi47的精細(xì)定位和候選基因分析[J]. 肖湘誼,史學(xué)濤,盛浩聞,劉金靈,肖應(yīng)輝. 作物學(xué)報. 2018(07)
[5]中國小麥條銹病菌CYR32和CYR33的毒性及基因型多樣性[J]. 姚強,王潔榮,孟巖,詹剛明,黃麗麗,康振生. 植物保護學(xué)報. 2018(01)
[6]利用SSR分子標(biāo)記構(gòu)建小麥遺傳圖譜[J]. 張帆,臧明麗. 南方農(nóng)機. 2017(16)
[7]高丹草AFLP分子遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建[J]. 石悅,于肖夏,于卓,楊東升,姜超,張明飛. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2017(10)
[8]花生遺傳圖譜構(gòu)建與QTL定位研究進展(英文)[J]. Addisu Getahun,楊鑫雷,何美敬,崔順立,穆國俊,劉立峰. 花生學(xué)報. 2017(02)
[9]采用AFLP和SSR標(biāo)記對扁蓿豆遺傳多樣性進行比較分析(英文)[J]. 李鴻雁,盧新雄,辛霞,李志勇,李俊,黃帆,劉磊. 華北農(nóng)學(xué)報. 2017(02)
[10]白芝麻籽粒油脂、蛋白質(zhì)及芝麻素含量QTL定位分析[J]. 吳坤,吳文雄,楊敏敏,劉紅艷,郝國存,趙應(yīng)忠. 作物學(xué)報. 2017(07)
博士論文
[1]甘藍型油菜導(dǎo)入系構(gòu)建、重要農(nóng)藝性狀QTL分析和白花基因克隆[D]. 張豹.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]大白菜BAC文庫的構(gòu)建及CO相關(guān)基因BAC克隆的篩選與分析[D]. 馮大領(lǐng).河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[3]甘藍型油菜含油量等重要品質(zhì)性狀的遺傳分析與QTL定位[D]. 郭世星.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]甘藍型油菜基因組中開花期QTL的檢測和分析[D]. 龍艷.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
碩士論文
[1]新型春性甘藍型油菜開花相關(guān)基因的篩選及表達模式研究[D]. 張生萍.青海大學(xué) 2017
[2]甘藍型油菜SNP遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建及品質(zhì)性狀QTL定位[D]. 毛龍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]甘藍型油菜C6染色體上2個FT基因功能的初步解析[D]. 徐靈芝.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]基于粒重差異品系的甘藍型油菜遺傳圖譜的初步構(gòu)建[D]. 鄭云峰.鄭州大學(xué) 2011
[5]甘藍型油菜白花基因的分子標(biāo)記及輔助育種研究[D]. 董育紅.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2005
[6]大白菜遺傳圖譜構(gòu)建及抗TuMV的QTL分析[D]. 王美.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
本文編號:3147042
【文章來源】:青海大學(xué)青海省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:79 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
引物篩選結(jié)果
圖 2.2 125 號引物的電泳結(jié)果Figure 2.2 Electrophoresis results for 125M:100bp DNALadder Marker 1-5:早熟親本 6-10:晚熟11-15:早花基因池 16-20:晚花基因池 Note:M:100bp DNALadder Marker 1-5:Early flowering paren6-10: Late flowering parents15:Early flowering gene pool 16-20:Late flowering gene PCR 及差異片段的測序酰胺凝膠回收產(chǎn)物為模板進行 PCR 擴增,擴增產(chǎn)物行電泳,并將獲得的片段與聚丙烯酰胺上的片段進片段從瓊脂糖凝膠上切下來,進行膠回收。其中部2.3 所示。
圖 2.3 125-1 二次 PCR 的電泳結(jié)果Electrophoresis results for the second:100bp Ladder Marker 1-2:二次 P100bp Ladder Marker 1-2: Secon瓊脂糖凝膠回收試劑盒回收;厥辗志候炞C的結(jié)果如圖 2.4 所示
【參考文獻】:
期刊論文
[1]油菜產(chǎn)業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀及面臨的機遇[J]. 謝慧,譚太龍,羅晴,楊柳,陳光輝. 作物研究. 2018(05)
[2]擬南芥成花調(diào)控途徑的研究進展[J]. 齊仙惠,巫東堂,李改珍,趙軍良,李梅蘭. 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2018(09)
[3]葡萄無核性狀的SSR新分子標(biāo)記開發(fā)及應(yīng)用[J]. 馬亞茹,馮建燦,劉崇懷,樊秀彩,孫海生,姜建福,張穎. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(13)
[4]水稻抗稻瘟病基因Pi47的精細(xì)定位和候選基因分析[J]. 肖湘誼,史學(xué)濤,盛浩聞,劉金靈,肖應(yīng)輝. 作物學(xué)報. 2018(07)
[5]中國小麥條銹病菌CYR32和CYR33的毒性及基因型多樣性[J]. 姚強,王潔榮,孟巖,詹剛明,黃麗麗,康振生. 植物保護學(xué)報. 2018(01)
[6]利用SSR分子標(biāo)記構(gòu)建小麥遺傳圖譜[J]. 張帆,臧明麗. 南方農(nóng)機. 2017(16)
[7]高丹草AFLP分子遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建[J]. 石悅,于肖夏,于卓,楊東升,姜超,張明飛. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2017(10)
[8]花生遺傳圖譜構(gòu)建與QTL定位研究進展(英文)[J]. Addisu Getahun,楊鑫雷,何美敬,崔順立,穆國俊,劉立峰. 花生學(xué)報. 2017(02)
[9]采用AFLP和SSR標(biāo)記對扁蓿豆遺傳多樣性進行比較分析(英文)[J]. 李鴻雁,盧新雄,辛霞,李志勇,李俊,黃帆,劉磊. 華北農(nóng)學(xué)報. 2017(02)
[10]白芝麻籽粒油脂、蛋白質(zhì)及芝麻素含量QTL定位分析[J]. 吳坤,吳文雄,楊敏敏,劉紅艷,郝國存,趙應(yīng)忠. 作物學(xué)報. 2017(07)
博士論文
[1]甘藍型油菜導(dǎo)入系構(gòu)建、重要農(nóng)藝性狀QTL分析和白花基因克隆[D]. 張豹.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]大白菜BAC文庫的構(gòu)建及CO相關(guān)基因BAC克隆的篩選與分析[D]. 馮大領(lǐng).河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[3]甘藍型油菜含油量等重要品質(zhì)性狀的遺傳分析與QTL定位[D]. 郭世星.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]甘藍型油菜基因組中開花期QTL的檢測和分析[D]. 龍艷.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
碩士論文
[1]新型春性甘藍型油菜開花相關(guān)基因的篩選及表達模式研究[D]. 張生萍.青海大學(xué) 2017
[2]甘藍型油菜SNP遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建及品質(zhì)性狀QTL定位[D]. 毛龍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]甘藍型油菜C6染色體上2個FT基因功能的初步解析[D]. 徐靈芝.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]基于粒重差異品系的甘藍型油菜遺傳圖譜的初步構(gòu)建[D]. 鄭云峰.鄭州大學(xué) 2011
[5]甘藍型油菜白花基因的分子標(biāo)記及輔助育種研究[D]. 董育紅.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2005
[6]大白菜遺傳圖譜構(gòu)建及抗TuMV的QTL分析[D]. 王美.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
本文編號:3147042
本文鏈接:http://www.sikaile.net/nykjlw/nzwlw/3147042.html
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