紅麻（Hibiscus cannabinus L.）一年生短日照韌皮纖維作物,對光周期反應較為敏感,開花的早晚是影響紅麻纖維產(chǎn)量高低的關鍵因素之一。發(fā)掘紅麻光周期相關基因,研究光周期誘導開花的作用機制,對于提高紅麻適應性、纖維產(chǎn)量和品質等有著重要的作用。CO（CONSTANS）基因是調控植物光周期開花的關鍵基因,促進或抑制下游基因的表達,實現(xiàn)植物成花轉變的調控。前人已在擬南芥、棉花等植物中鑒定表明COL（CONSTANS-like）基因家族具有典型的保守結構域。然而,紅麻Actin和COL基因家族成員的挖掘和COL基因家族短日誘導開花的表達模式等尚未見報道。因此,本研究以紅麻中福紅2號為材料,對篩選獲得的紅麻Actin內參基因家族和COL基因家族進行蛋白質序列分析、保守結構域預測和基因結構分析等鑒定,利用q RT-PCR技術分析紅麻Actin內參基因及COL功能基因的表達模式,主要研究結果如下:1.紅麻內參基因的選擇與鑒定。本研究從紅麻全基因組數(shù)據(jù)中篩選得到37個Actin基因家族成員,它們分布于01、02、04、05、06、07、08、09、10、11、12、13、14、15、16、... 

【文章來源】：福建農(nóng)林大學福建省

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【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

植物開花調節(jié)網(wǎng)絡簡圖[77]

紅麻CONSTANS-like基因家族的全基因組鑒定及在光周期誘導中的表達分析22AB圖2-1紅麻候選內參基因RT-PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳Fig.2-1KenafcandidatereferencegenesRT-PCRproductsagarosegelelectrophoresisdetectionM為Marker2000DL；A中1-24分別表示HcACT1-HcACT6擴增產(chǎn)物；L表示葉片cDNA的PCR擴增；S表示莖cDNA的PCR擴增；R表示根cDNA的PCR擴增；g1，g2，g3，g4，g5，g6，g7，g8表示分別用HcACT1-HcACT8全長引物以DNA為模板的PCR擴增。1-4表示HcACT1擴增產(chǎn)物；5-8表示HcACT2擴增產(chǎn)物；9-12表示HcACT3擴增產(chǎn)物；13-16表示HcACT4擴增產(chǎn)物；17-20表示HcACT5擴增產(chǎn)物；21-24表示HcACT6擴增產(chǎn)物；B中1-4表示HcACT7擴增產(chǎn)物；5-8表示HcACT8擴增產(chǎn)物表2-6紅麻Actin基因家族4個基因編碼蛋白質的理化性質Table2-6PhysicochemicalpropertyofproteinsencodedbyfourgenesinActingenefamilyofkenaf基因名稱Genename氨基酸數(shù)量Numberofaminoacids相對分子質量Relativemolecularweight理論等電點TheoreticalpI平均親水系數(shù)GrandaverageofhydropathicityACT366875159.826.33-0.268ACT542246826.525.43-0.241ACT742947351.175.61-0.154ACT837741768.895.31-0.175

紅麻CONSTANS-like基因家族的全基因組鑒定及在光周期誘導中的表達分析24ABCD圖2-2紅麻Actin基因家族4個基因編碼蛋白質的三級結構Fig.2-2TertiarystructureofproteinsencodedbyfourgenesinActingenefamilyofkenef圖中A-D依次是HcACT3，HcACT5，HcACT7和HcACT8基因2.4.4紅麻Actin基因家族編碼蛋白保守結構域及基因結構分析紅麻Actin基因家族37個基因編碼蛋白質的保守結構域motif結構較為相似（見圖2-3），相似度較高的序列距離較近，分為一大類，特別注意的是HcACT18、HcACT16、HcACT26、HcACT20、HcACT3和HcACT25基因編碼的蛋白質氨基酸保守序列少于其它Actin基因，推測是物種在漫長的進化演變中，基因在復制和重組等過程中丟失的結果。將選取的紅麻4條Actin基因與模式植物擬南芥和棉花Actin基因進行系統(tǒng)發(fā)育分析，構建系統(tǒng)進化樹。預測Actin基因保守序列區(qū)域（motif基序和domain結構），由圖可知，從紅麻中挖掘出來的Actin基因與模式植物棉花和擬南芥的motif和domain保守結構域較為相似，有的甚至相似度一致。紅麻Actin基因家族的37個基因含有4-28個編碼序列（CDS）（見圖2-3），紅麻HcACT16基因中CDS數(shù)量最多，37個紅麻Actin基因均表現(xiàn)為序列中內含子數(shù)目較多，兩側大多為UTR區(qū)域。


本文編號：3138400