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基于轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組學(xué)研究航天誘變決明株系的變異機(jī)制

發(fā)布時(shí)間:2021-03-08 19:42
  決明子是豆科植物決明(Cassia obtusifolia L.)或小決明(Cassia tora L.)的干燥成熟種子,是國(guó)家食品藥品監(jiān)督管理總局規(guī)定的藥食同源的材料之一。決明子具有清肝明目、潤(rùn)腸通便以及降壓調(diào)脂等功效,近年來(lái)受到越來(lái)越多的關(guān)注,同時(shí)也將決明遺傳背景不清、良種缺乏以及分子水平研究滯后等問(wèn)題暴露出來(lái)。本研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)對(duì)航天誘變處理的決明子進(jìn)行多年多點(diǎn)的栽培研究,從大量航天誘變決明株系中篩選出編號(hào)為QC10、QC29和QC46的三個(gè)種子中橙黃決明素含量較高,且產(chǎn)量穩(wěn)定的決明株系。通過(guò)與47份不同產(chǎn)地決明子樣本中質(zhì)量標(biāo)志物含量進(jìn)行對(duì)比,評(píng)價(jià)了航天誘變株系決明子質(zhì)量的優(yōu)劣,同時(shí)對(duì)分布于我國(guó)不同地區(qū)的決明種群遺傳多樣性及種群結(jié)構(gòu)進(jìn)行了研究,明確了決明遺傳水平及種群結(jié)構(gòu)的特點(diǎn)。另一方面,通過(guò)對(duì)航天誘變決明材料進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、蛋白質(zhì)組質(zhì)譜鑒定以及兩組學(xué)聯(lián)合分析的方法深入探討了航天誘變決明株系與對(duì)照株系之間差異形成的機(jī)制,篩選出大量差異表達(dá)基因及差異表達(dá)蛋白。結(jié)合決明中蒽醌類物質(zhì)的代謝途徑,對(duì)關(guān)鍵步驟的差異表達(dá)基因萘甲酸鹽合成酶基因進(jìn)行了克隆及功能驗(yàn)證,初步闡明了航天誘變株系的變異機(jī)制... 

【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:127 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

基于轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組學(xué)研究航天誘變決明株系的變異機(jī)制


本研究的技術(shù)路線

地理分布圖,決明,地理分布,樣本


A:47 份決明樣本的地理分布情況。圖中黑色和藍(lán)色三角分別代表樣本為栽培種或有兩因型。藍(lán)色和黑色方形代表樣本為野生型或是在該地區(qū)收集了栽培種和野生型(圖中的表 2-1)。B:47 份樣本的四個(gè)地理區(qū)域劃分。紅色、淺藍(lán)、藍(lán)色以及黃色分別代表了西區(qū)、北部地區(qū)、西南地區(qū)以及東部地區(qū)。ure 2-1 A: Geographical distribution of the 47 sampled sites in China. The black and blue triangsent cultivar samples and two genotypes of cultivars were collected respectively. The blue and bs represent wild sample and both wild and cultivar samples were collected (Population abbreviaTable 2-1). B: 47 samples were separated into four geographic regions. The red, light blue, blue yellow represent Northwest, Northern, Southwest and Eastern region, respectively. 實(shí)驗(yàn)方法.1 CTAB 法提取 DNA樣本 DNA 提取采用十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)法(Doyle and Doyle 199修改,具體方法如下:液氮預(yù)冷研缽,于 65°C 水浴預(yù)熱 CTAB,2 mL 無(wú)菌離心管置于冰上;

樣本,相似系數(shù),質(zhì)量標(biāo)志,四川


第二章 決明遺傳及質(zhì)量標(biāo)志物含量的多樣性研究 23圖2-2 分別利用 ISSR(A)、SCoT(B)以及 ISSR+SCoT(C)數(shù)據(jù)對(duì) 47 份樣本進(jìn)行 UPGMA聚類分析。Figure 2-2 UPGMA cluster analysis of 47 samples based on ISSR (A), SCoT (B) and combined dataof ISSR and SCoT (C), respectively.SCoT 數(shù)據(jù)產(chǎn)生的 UPGMA 與 ISSR 相似,略有差異。相似系數(shù)在 0.62–1.0 之間,平均值為 0.85。46 份樣本在相似系數(shù)為 0.75 時(shí)分為兩個(gè)分支(圖 2-2B)。在 I-1 中,YHN-XC 與兩份來(lái)自江西的樣本聚在一起,而 HB-XTD 與四份陜西的樣本聚在一起。在 I-2 中,GS-TS 和 NX-YC 首先聚類,然后與 NX-ZW 和 NX-LD 聚在一起,這與 ISSR的系統(tǒng)樹(shù)圖不同。Ⅱ-1、Ⅱ-2 和Ⅱ-3 分別由來(lái)自云南、重慶和四川的樣本組成。Ⅱ-4 包含來(lái)了 4 份廣西以及一份來(lái)自四川的樣本

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[5]地黃連作脅迫響應(yīng)機(jī)制的塊根蛋白質(zhì)組學(xué)分析[J]. 吳林坤,陳軍,吳紅淼,王娟英,秦賢金,張重義,林文雄.  作物學(xué)報(bào). 2016(02)
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博士論文
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[3]UV-B輻射增強(qiáng)對(duì)花生的生理生態(tài)影響及其分子機(jī)制[D]. 杜照奎.西南大學(xué) 2014

碩士論文
[1]航天誘變決明SP3代優(yōu)良株系的篩選[D]. 章明敏.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
[2]航天搭載對(duì)決明SP1、SP2代的誘變效應(yīng)[D]. 毛仁俊.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014



本文編號(hào):3071566

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