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小麥TaCO9基因的克隆及功能分析

發(fā)布時間:2021-02-28 09:33
  為了明確TaCO9-1A基因在小麥生長發(fā)育中的具體調(diào)控機理,該研究以同源克隆的方法成功獲得了大麥(Hordeum vulgare)光周期基因HvCO9在小麥(Triticum aestivum)中的直系同源基因TaCO9,并對其進行生物信息學分析、亞細胞定位、轉(zhuǎn)錄激活以及表達模式分析;利用農(nóng)桿菌侵染法轉(zhuǎn)化擬南芥,并對過表達株系進行表型分析。結(jié)果表明:(1)TaCO9包含2個外顯子和1個內(nèi)含子,CDS區(qū)全長876 bp,編碼291個氨基酸,蛋白序列含有特有的CCT結(jié)構(gòu)域,且在不同物種間高度保守。(2)生物信息學分析表明,TaCO9基因編碼的蛋白質(zhì)分子量約為30.7 kD,等電點為6.24;TaCO9的啟動子區(qū)含有光響應、激素應答和脅迫應答等多種順式作用元件。(3)亞細胞定位和轉(zhuǎn)錄活性分析表明,TaCO9主要定位于細胞核中,且具有轉(zhuǎn)錄激活活性。(4)qRT-PCR結(jié)果表明,TaCO9基因在各個組織中均有表達,葉片中的表達量最高;在光照14 h條件下TaCO9的表達量顯著高于光照10 h和12 h條件下的表達量,且TaCO9在大粒小麥‘西農(nóng)817’子房與籽粒中的表達量顯著高于‘中國春’。(5... 

【文章來源】:西北植物學報. 2020,40(03)北大核心

【文章頁數(shù)】:10 頁

【部分圖文】:

小麥TaCO9基因的克隆及功能分析


TaCO9基因cDNA序列的克隆(A)及其基因結(jié)構(gòu)(B)

序列,同源序列,順式作用元件,物種


表2 TaCO9基因上游調(diào)控區(qū)順式作用元件Table 2 cis-elements in the upstream regulation region of TaCO9 gene 相關(guān)功能預測Associated putative function 啟動子順式作用元件cis-elements in the promoter region 光響應元件 Light responsiveness element G-Box, G-box, C-box, GT1-motif, Sp1, box4, ATCT-motif, TCCC-motif, GATA-motif, I-box, TCT-motif 生長素反應元件 Auxin responsiveness element AuxRR-core 參與茉莉酸反應的順式作用元件 MeJA-responsiveness CGTCA-motif, TGACG-motif 參與脫落酸反應的順勢作用 Abscisic acid responsiveness ABRE, TGA-element 參與水楊酸反應的順式作用元件 Salicylic acid responsiveness TCA-element 啟動子和增強子區(qū)基本順式作用元件 Promoter and enhancer regions CAAT-box 厭氧誘導所需的順式作用元件 Anoxic specific inducibility GC-motif 低溫響應元件 Low-temperature responsiveness CAAT-box, LTR 玉米醇溶蛋白代謝調(diào)節(jié)元件 Zein metabolism regulation O2-site MYBHv1結(jié)合位點 MYBHv1 binding site CCAAT-box MYB結(jié)合位點參與干旱誘導的順式作用元件 MYB binding site involved in drought-inducibility MBS 與分生組織表達有關(guān)的順式作用元件 Meristem expression CAT-box 轉(zhuǎn)錄起始位點-30區(qū)核心啟動子 Core promoter element around -30 of transcription start TATA-box圖3 TaCO9在不同組織中(A)以及不同光照處理下(B)的表達模式

模式圖,光照,同源序列,模式


TaCO9在不同組織中(A)以及不同光照處理下(B)的表達模式

【參考文獻】:
期刊論文
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[2]小麥光周期基因TaCO9-1A的克隆、功能標記開發(fā)及其與冬春性關(guān)系的研究[J]. 冉從福,邵慧,余靜,寇程,李揚,李立群,李學軍.  農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學報. 2014(12)
[3]葡萄花發(fā)育基因的亞細胞定位和表達分析[J]. 楊光,曹雪,房經(jīng)貴,黃振喜,陶建敏,王晨.  中國農(nóng)業(yè)科學. 2011(03)
[4]Ghd7自然變異是調(diào)控水稻抽穗期和產(chǎn)量潛力的重要因素[J]. 薛為亞,邢永忠,翁小煜,趙毓,唐為江,王磊,周紅菊,余四斌,徐才國,李香花,張啟發(fā).  中國基礎(chǔ)科學. 2009(02)



本文編號:3055661

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