發(fā)布時間：2020-12-27 10:50

　　雪蓮在我國新疆、青海、甘肅、四川、云南和西藏等省區(qū)的高海拔、寒冷地區(qū)均有分布,主產于新疆的天山、昆侖山等地區(qū),是一種高原多年生珍稀草本植物。雪蓮不僅具有很強的抗寒性和適應惡劣環(huán)境的能力,還演化出一套能在高海拔的冰川上旺盛生長并適應缺氧環(huán)境的形態(tài)通氣結構,以維持其呼吸作用的進行。線粒體能夠維持雪蓮在低溫下生長的能量供給,保證其形態(tài)建成和對生理功能的調控。對其線粒體基因組的組裝與分析,能為從更深層次上去分析其低溫呼吸機制,以及低溫條件下的核質互作,并為逆境脅迫耐受機制等研究打下堅實的基礎。本研究主要內容為:以兩種不同的組裝方法對雪蓮線粒體基因進行組裝,并對組裝結果進行分析,比較分析兩種方法之間的優(yōu)缺點,為下一步分析基因組分析打定基礎。本實驗組裝策略:第一種方法是從測序數(shù)據(jù)中將能與核基因組和葉綠體基因組比對上的reads去除,然后使用剩下的reads進行組裝得到雪蓮線粒體基因組;但由于雪蓮核基因組是未知的,本研究使用與雪蓮同屬菊科且親緣關系較近的向日葵核基因組,代替雪蓮核基因組進行雪蓮線粒體reads的篩選。第二種方法利用三代數(shù)據(jù)讀長較長的特點,與二代數(shù)據(jù)進行混合組裝,然后從中篩選出線粒體c... 

【文章來源】：石河子大學新疆維吾爾自治區(qū) 211工程院校

【文章頁數(shù)】：70 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

RS41蘿卜線粒體環(huán)形基因組GenemapFig1.TheringgenomeofradishRS41向日葵線粒體基因組的主復制環(huán)長度為300945bp，平均GC含量為45％，

illumina邊合成邊測序原理

半導體芯片測序技術Fig3.TheprincipleofIonTorrent隨著測序技術的不斷進步，出現(xiàn)了第三代高通量測序技術，該技術又被稱為單分子測序技術

【參考文獻】：
期刊論文
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[2]蘿卜葉綠體及線粒體基因組測序與組裝[J]. 段乃彬,王俊峰,白靜,謝坤,王效睦.  分子植物育種. 2015(11)
[3]基于Illumina HiSeq 2000測序技術對當歸根的轉錄組特性研究[J]. 楊杰,王金權,丁維俊,李煒弘,劉宏偉.  中草藥. 2015(08)
[4]植物基因組測序的研究進展[J]. 陳勇,柳亦松,曾建國.  生命科學研究. 2014(01)
[5]雪蓮的化學成分與藥理作用研究進展[J]. 王瑛,張本印,陶燕鐸,邵贇,梅麗娟,王啟蘭.  光譜實驗室. 2013(02)
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[7]高通量測序技術在動植物研究領域中的應用[J]. 岳桂東,高強,羅龍海,王軍一,許姣卉,尹燁.  中國科學:生命科學. 2012(02)
[8]轉天山雪蓮冷調節(jié)蛋白基因煙草的獲得及其抗寒性鑒定[J]. 郭新勇,程晨,王重,王恒良,喻娜,王愛英,祝建波.  西北植物學報. 2012(01)
[9]第三代測序技術:單分子即時測序[J]. 劉巖,吳秉銓.  中華病理學雜志. 2011 (10)
[10]新疆雪蓮化學成分的分離與鑒定[J]. 侯朋藝,黃健,孫博航,吳立軍,高慧媛.  沈陽藥科大學學報. 2011(02)

博士論文
[1]蝗蟲微孢子蟲寄生飛蝗的分子基礎[D]. 陳龍欣.中國農業(yè)大學 2017

碩士論文
[1]裙帶菜Undaria pinnatifida線粒體全基因組研究及藻類線粒體基因組比較分析[D]. 李天勇.中國海洋大學 2014



本文編號：2941612