大豆擴(kuò)展蛋白GmEXLB1磷高效利用功能解析
發(fā)布時間:2020-12-19 02:59
大豆是重要糧食與油料作物,低磷脅迫嚴(yán)重影響其生長發(fā)育。根系是植物感應(yīng)低磷信號最敏感器官,其構(gòu)型改變是抵御低磷逆境重要途徑。擴(kuò)展蛋白是一類參與植物細(xì)胞伸展、調(diào)節(jié)根系構(gòu)型重要酶類,在抵御多種逆境脅迫中發(fā)揮重要作用。課題組前期從大豆低磷誘導(dǎo)差減文庫中獲得多個擴(kuò)展蛋白基因;诖,本研究利用轉(zhuǎn)錄組測序進(jìn)一步確定擴(kuò)展蛋白候選基因GmEXLB1,克隆、分析基因時空表達(dá)及啟動子,明確基因?qū)Φ土啄婢车捻憫?yīng),并構(gòu)建載體轉(zhuǎn)化擬南芥,研究GmEXLB1磷高效利用生物學(xué)功能,為磷高效分子育種與機(jī)制解析提供功能基因。主要結(jié)果如下:1.結(jié)合低磷誘導(dǎo)差減文庫與轉(zhuǎn)錄組測序遴選出擴(kuò)展蛋白GmEXLB1:利用磷高效大豆低磷誘導(dǎo)差減文庫,結(jié)合低磷處理下的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),篩選出擴(kuò)展蛋白候選基因GmEXLB1,該基因在大豆側(cè)根低磷處理28 d~70 d高效表達(dá),且以處理49 d表達(dá)量最高;克隆基因發(fā)現(xiàn),開放閱讀框744 bp,編碼247個氨基酸殘基,含4個外顯子、3個內(nèi)含子,具有植物擴(kuò)展蛋白特有保守結(jié)構(gòu)域,與其它擴(kuò)展蛋白具有較高同源性。2.結(jié)合基因時空表達(dá)與啟動子分析明確了GmEXLB1對低磷逆境的響應(yīng):利用實時定量分析磷高效種質(zhì)...
【文章來源】:河北農(nóng)業(yè)大學(xué)河北省
【文章頁數(shù)】:51 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
不同低磷處理時間大豆擴(kuò)展蛋白基因轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
圖 2 不同組織部位大豆擴(kuò)展蛋白基因轉(zhuǎn)錄組分析Figure 2Analysis of transcriptome data of soybean expansin genes in different tissues蛋白 GmEXLB1 表達(dá)與生物信息學(xué)分析擴(kuò)展蛋白 GmEXLB1 的克隆述篩選的大豆擴(kuò)展蛋白基因 Glyma.17g147500 為參考序列,設(shè)”低磷處理下 cDNA 為模板,經(jīng) PCR 擴(kuò)增獲得大小約 750bp 目該目的條帶,經(jīng)連接 pMD19-T 載體、測序分析,獲得目的基因 744 bp,將其命名為 GmEXLB1。
以“中黃 15”低磷處理下 cDNA 為模板,經(jīng) PCR 擴(kuò)增獲得大小約 750bp 目的條帶(圖3),回收該目的條帶,經(jīng)連接 pMD19-T 載體、測序分析,獲得目的基因開放閱讀框序列,長度 744 bp,將其命名為 GmEXLB1。
本文編號:2925125
【文章來源】:河北農(nóng)業(yè)大學(xué)河北省
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【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
不同低磷處理時間大豆擴(kuò)展蛋白基因轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
圖 2 不同組織部位大豆擴(kuò)展蛋白基因轉(zhuǎn)錄組分析Figure 2Analysis of transcriptome data of soybean expansin genes in different tissues蛋白 GmEXLB1 表達(dá)與生物信息學(xué)分析擴(kuò)展蛋白 GmEXLB1 的克隆述篩選的大豆擴(kuò)展蛋白基因 Glyma.17g147500 為參考序列,設(shè)”低磷處理下 cDNA 為模板,經(jīng) PCR 擴(kuò)增獲得大小約 750bp 目該目的條帶,經(jīng)連接 pMD19-T 載體、測序分析,獲得目的基因 744 bp,將其命名為 GmEXLB1。
以“中黃 15”低磷處理下 cDNA 為模板,經(jīng) PCR 擴(kuò)增獲得大小約 750bp 目的條帶(圖3),回收該目的條帶,經(jīng)連接 pMD19-T 載體、測序分析,獲得目的基因開放閱讀框序列,長度 744 bp,將其命名為 GmEXLB1。
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