水稻鹽脅迫下組蛋白乙;揎椞卣骷癏ATs相關(guān)基因的功能研究
發(fā)布時(shí)間:2020-12-16 08:32
組蛋白修飾是表觀遺傳調(diào)控的重要方式之一,包括組蛋白乙;⒓谆、磷酸化等多種組蛋白共價(jià)修飾,對(duì)于動(dòng)植物和人類的生長(zhǎng)發(fā)育至關(guān)重要。組蛋白乙;揎検怯山M蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(HATs)和去乙酰化酶(HDACs)共同調(diào)控的一種動(dòng)態(tài)可逆的修飾過(guò)程,能夠參與生物體內(nèi)基因轉(zhuǎn)錄活性的調(diào)控和重塑染色質(zhì)結(jié)構(gòu)狀態(tài)等重要過(guò)程,進(jìn)而影響到動(dòng)植物的生長(zhǎng)發(fā)育。水稻作為單子葉植物的模式生物,一直是科學(xué)家重要的研究材料。然而在水稻發(fā)育過(guò)程中的組蛋白乙;揎椪{(diào)控基因表達(dá)和響應(yīng)逆境脅迫的機(jī)制研究還有待進(jìn)一步完善。因此,本研究主要以組蛋白乙;揎椬鳛檠芯繉(duì)象,全面定性分析水稻葉片全蛋白的乙酰化修飾特征、結(jié)合鹽脅迫處理重點(diǎn)解析組蛋白H4K5ac和H4K8ac修飾在全基因組的分布變化特征以及組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶基因GCN5和p300的功能分析。本研究的主要工作包括:1水稻全蛋白組賴氨酸乙;揎椀亩ㄐ苑治鲭S著蛋白組學(xué)分析技術(shù)的發(fā)展,對(duì)于蛋白功能的確定,翻譯后修飾的鑒定以及蛋白結(jié)構(gòu)的分析研究也越來(lái)越深入。本研究利用LC-MS/MS技術(shù)在水稻葉片中定性出1353個(gè)賴氨酸乙;揎椢稽c(diǎn),涉及866個(gè)蛋白,包括了多個(gè)新的組蛋白乙酰化修飾...
【文章來(lái)源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:129 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖1.3p300/CBP蛋白的結(jié)構(gòu)域組成[65]??Figure?1.3?Domain?structure?
長(zhǎng)三周的幼苗葉片全蛋白組的乙;揎椷M(jìn)行定性分析。通過(guò)利用泛賴氨酸乙;贵w??(anti-pan-Kac)對(duì)水稻根尖細(xì)胞的蛋白免疫熒光試驗(yàn),結(jié)果顯示賴氨酸乙;贵w在細(xì)胞??核里廣泛分布(圖2.1a)。在利用抗體獲得富集多肽后,我們對(duì)所有鑒定的多肽質(zhì)量進(jìn)行誤??差分析,發(fā)現(xiàn)整體誤差分布位于0值附近,并且大多數(shù)的峰值小于0.02Da?(圖2.1b),說(shuō)??明質(zhì)譜數(shù)據(jù)質(zhì)量的準(zhǔn)確度可信。此外,大多數(shù)肽段的長(zhǎng)度集年在8-20個(gè)氨基酸之間(圖??2.1c),與預(yù)測(cè)的胰蛋白酶酶切后片段長(zhǎng)度范圍一致,說(shuō)明多肽樣本制備的質(zhì)量高。定性分??析總計(jì)鑒定到866個(gè)蛋白被乙酰化,包括1353個(gè)賴氨酸乙;揎椢稽c(diǎn),其中多達(dá)54.3%??的多肽是被乙;摹榱朔治鲆阴;揎椢稽c(diǎn)在所有鑒定蛋白上的分布情況,我們統(tǒng)計(jì)??了每個(gè)蛋白上的修飾位點(diǎn)數(shù)目,其中69%的蛋白(594個(gè))只包含了?1個(gè)乙酰化修飾位點(diǎn),??剩余31%的蛋白包含了?2個(gè)或以上的修飾位點(diǎn)(圖2.1d)。我們選擇部分蛋白(H3、H4和??Q0DWZ7)多肽生成質(zhì)譜圖進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)與最終鑒定得到肽段間的修飾位點(diǎn)是匹配的(圖??2.2)。??
飾抗體的特異性結(jié)合。我們檢測(cè)了挑選的4組多肽經(jīng)過(guò)酶聯(lián)免疫后的450nm處的吸光度??〇D45Q值,與陰性對(duì)照的吸光值相比,不同多肽濃度反應(yīng)結(jié)果顯示試驗(yàn)組/對(duì)照組的值均大??于2.1,認(rèn)為試驗(yàn)結(jié)果為陽(yáng)性(圖2.3b)。結(jié)果表明使用的賴氨酸乙酰化修飾的泛抗體能夠??特異結(jié)合多肽上的乙;鶊F(tuán),同時(shí)也驗(yàn)證通過(guò)質(zhì)譜定性鑒定出的乙;亩我彩强尚诺摹??(a)?Protein?Peptide?Sequence???Q6H6C7?CPTM-161?GVTP-(acetyl)K-YSLK???CCTM-161?GVTPKYSLK???Q9LGH8?CPTM-163?IYIF-(acetyl)K-VLK???CCTM-163?IYIFKVLK???Q9LGH8?CPTM-164?LVLPGELA-(acetyl
【參考文獻(xiàn)】:
博士論文
[1]擬南芥組蛋白去乙;富蚣易宸治黾癆tSRT2在鹽脅迫下調(diào)控種子萌發(fā)的分子機(jī)制[D]. 鐘理.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[2]組蛋白乙酰化對(duì)水稻花期、基因表達(dá)以及雜種優(yōu)勢(shì)的表觀調(diào)控機(jī)制[D]. 李晨.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[3]水稻組蛋白去乙酰化酶基因的分離和功能鑒定[D]. 黃利民.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號(hào):2919862
【文章來(lái)源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:129 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖1.3p300/CBP蛋白的結(jié)構(gòu)域組成[65]??Figure?1.3?Domain?structure?
長(zhǎng)三周的幼苗葉片全蛋白組的乙;揎椷M(jìn)行定性分析。通過(guò)利用泛賴氨酸乙;贵w??(anti-pan-Kac)對(duì)水稻根尖細(xì)胞的蛋白免疫熒光試驗(yàn),結(jié)果顯示賴氨酸乙;贵w在細(xì)胞??核里廣泛分布(圖2.1a)。在利用抗體獲得富集多肽后,我們對(duì)所有鑒定的多肽質(zhì)量進(jìn)行誤??差分析,發(fā)現(xiàn)整體誤差分布位于0值附近,并且大多數(shù)的峰值小于0.02Da?(圖2.1b),說(shuō)??明質(zhì)譜數(shù)據(jù)質(zhì)量的準(zhǔn)確度可信。此外,大多數(shù)肽段的長(zhǎng)度集年在8-20個(gè)氨基酸之間(圖??2.1c),與預(yù)測(cè)的胰蛋白酶酶切后片段長(zhǎng)度范圍一致,說(shuō)明多肽樣本制備的質(zhì)量高。定性分??析總計(jì)鑒定到866個(gè)蛋白被乙酰化,包括1353個(gè)賴氨酸乙;揎椢稽c(diǎn),其中多達(dá)54.3%??的多肽是被乙;摹榱朔治鲆阴;揎椢稽c(diǎn)在所有鑒定蛋白上的分布情況,我們統(tǒng)計(jì)??了每個(gè)蛋白上的修飾位點(diǎn)數(shù)目,其中69%的蛋白(594個(gè))只包含了?1個(gè)乙酰化修飾位點(diǎn),??剩余31%的蛋白包含了?2個(gè)或以上的修飾位點(diǎn)(圖2.1d)。我們選擇部分蛋白(H3、H4和??Q0DWZ7)多肽生成質(zhì)譜圖進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)與最終鑒定得到肽段間的修飾位點(diǎn)是匹配的(圖??2.2)。??
飾抗體的特異性結(jié)合。我們檢測(cè)了挑選的4組多肽經(jīng)過(guò)酶聯(lián)免疫后的450nm處的吸光度??〇D45Q值,與陰性對(duì)照的吸光值相比,不同多肽濃度反應(yīng)結(jié)果顯示試驗(yàn)組/對(duì)照組的值均大??于2.1,認(rèn)為試驗(yàn)結(jié)果為陽(yáng)性(圖2.3b)。結(jié)果表明使用的賴氨酸乙酰化修飾的泛抗體能夠??特異結(jié)合多肽上的乙;鶊F(tuán),同時(shí)也驗(yàn)證通過(guò)質(zhì)譜定性鑒定出的乙;亩我彩强尚诺摹??(a)?Protein?Peptide?Sequence???Q6H6C7?CPTM-161?GVTP-(acetyl)K-YSLK???CCTM-161?GVTPKYSLK???Q9LGH8?CPTM-163?IYIF-(acetyl)K-VLK???CCTM-163?IYIFKVLK???Q9LGH8?CPTM-164?LVLPGELA-(acetyl
【參考文獻(xiàn)】:
博士論文
[1]擬南芥組蛋白去乙;富蚣易宸治黾癆tSRT2在鹽脅迫下調(diào)控種子萌發(fā)的分子機(jī)制[D]. 鐘理.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[2]組蛋白乙酰化對(duì)水稻花期、基因表達(dá)以及雜種優(yōu)勢(shì)的表觀調(diào)控機(jī)制[D]. 李晨.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[3]水稻組蛋白去乙酰化酶基因的分離和功能鑒定[D]. 黃利民.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號(hào):2919862
本文鏈接:http://www.sikaile.net/nykjlw/nzwlw/2919862.html
最近更新
教材專著