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利用GWAS解析玉米生理成熟期籽粒脫水性狀的遺傳基礎

發(fā)布時間:2020-06-05 07:36
【摘要】:玉米是我國種植面積最廣的糧食作物,也是我國最重要的經(jīng)濟作物。隨著農(nóng)業(yè)機械化的逐漸普及,玉米種植全程機械化已經(jīng)成為一種普遍的趨勢,我國的大部分地區(qū)已經(jīng)實現(xiàn)了玉米的機械化生產(chǎn)。但是玉米籽粒的含水量作為限制玉米機械化收獲的最主要因素,降低收獲時玉米籽粒的含水量已經(jīng)成為育種家們最為關(guān)注的問題,因此培育出脫水速率快,收獲時含水量低的玉米品種成為目前玉米育種的主要任務。由于玉米籽粒脫水是由多個基因控制,利用傳統(tǒng)的育種方法周期較長,需要經(jīng)過多年的人工選育,前人的研究主要集中于脫水速率的表型性狀的研究,因此利用全基因組關(guān)聯(lián)分析技術(shù)找到控制玉米籽粒脫水的基因具有十分重要的意義。本試驗利用具有廣泛多態(tài)性的522份玉米自交系構(gòu)建自然群體,測量黑層出現(xiàn)時以及收獲時玉米籽粒的含水量,計算生理成熟后玉米籽粒的脫水速率,挖掘控制玉米籽粒脫水速率的候選基因,為快速篩選并獲得生理成熟后籽粒脫水速率快,含水量低的玉米品種提供理論依據(jù)。本研究的主要結(jié)果為:1.玉米籽粒含水量在關(guān)聯(lián)群體的遺傳基礎在遼寧沈撫和海南樂東兩地測量玉米籽粒黑層出現(xiàn)時和收獲時的玉米籽粒含水量的表型數(shù)據(jù),經(jīng)過對含水量的表型數(shù)據(jù)分析可知,玉米籽粒在遼寧沈撫和海南樂東的表型數(shù)據(jù)均呈現(xiàn)正態(tài)分布,這兩個地點的遺傳力分別為0.61和0.62,呈現(xiàn)中等遺傳力。將兩個時期的數(shù)據(jù)進行關(guān)聯(lián)分析作圖,將閾值設為4時,有3個SNP位點被檢測到,分別位于7號染色體上和10號染色體上。共定位到7個有功能注釋基因位點,他們分別為合成代謝、信號轉(zhuǎn)導、氧化還原反應、轉(zhuǎn)錄調(diào)控以及分泌等功能,直接或者間接的作用于玉米籽粒含水量。2.玉米籽粒脫水速率在關(guān)聯(lián)群體的遺傳基礎將測量的兩次玉米籽粒含水量做差除以兩次測量之間相差的時間,計算得到玉米籽粒生理成熟期籽粒脫水速率,并且對脫水速率利用SPSS軟件進行正態(tài)分布檢驗,結(jié)果顯示,玉米籽粒生理成熟期的脫水速率呈現(xiàn)正態(tài)分布的規(guī)律,屬于數(shù)量性狀,廣義遺傳力為0.31。對遼寧玉米籽粒脫水速率進行關(guān)聯(lián)作圖,將閾值設為4時,共檢測到11個SNP,它們分別位于1、7、9、10號染色體上。對海南樂東玉米籽粒脫水速率進行關(guān)聯(lián)作圖,將閾值設為4時,共檢測到4個SNP位點,它們分別位于7、10號染色體上。將兩地的脫水速率進行跨區(qū)域的關(guān)聯(lián)作圖,將閾值設為4時,共有3個SNP位點被找到,他們都位于7號染色體上。脫水速率性狀共定位到46個基因位點,他們分別為合成代謝、信號轉(zhuǎn)導、氧化還原反應、轉(zhuǎn)錄調(diào)控以及分泌等功能,直接或者間接的作用于玉米籽粒脫水速率。
【圖文】:

路線圖,課題,路線,玉米籽粒


第一章 文獻綜述法進行育種難度較大,急需分子育種的手段來對玉米籽粒性狀進行遺傳改良。本課題對 522 個玉米自交系構(gòu)成的關(guān)聯(lián)群體的基因型進行檢測。由于玉米的適合機收的籽粒含水量在 25%~18%之間(柳楓賀等,2013),黑層出現(xiàn)時玉米籽粒含水量在 32%左右(馮鵬,2014),在收獲時玉米籽粒含水量根據(jù)前期測定基本在 24%~17%。所以,本試驗記錄黑層出現(xiàn)日期并以此作為生理成熟期開始,測量黑層出現(xiàn)后籽粒含水量與收獲時玉米收獲期籽粒的含水量,計算生理成熟期玉米籽粒的脫水速率。利用全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)挖掘調(diào)控玉米生理成熟期籽粒脫水速率的候選基因,解析生理成熟期玉米籽粒脫水速率的遺傳基礎。如圖 1-1 為本試驗的技術(shù)路線。

自交系,玉米,群體,黑層


圖 2-1 玉米關(guān)聯(lián)群體自交系組成Figure 2-1 Composition of inbred lines associated with maize方法種植驗所采用的廣泛多態(tài)性 522 份玉米自交系,,2017 年遼寧沈撫地區(qū)(N和海南樂東(N18°45′,E109°10′)種植。每一個環(huán)境自交系采用隨機行長 2 m,行間距 0.6 m。每個家系 2 次重復。每個家系單行種植,每行超過 6 株自交。在授粉前進行掛牌標記,完全遵照田間標準化管測量錄黑層出現(xiàn)時間層出現(xiàn)意味著玉米的生長發(fā)育進入生理成熟期,為了確定玉米生理成觀察并且記錄 522 個家系的黑層出現(xiàn)時間,每個家系超過半數(shù)出現(xiàn)黑熟。從玉米授粉時期開始觀察,玉米籽粒乳線逐漸下降,直到乳線消錄黑層出現(xiàn)日期,每個家系記錄六株。從玉米開始趨向成熟時每天觀察
【學位授予單位】:沈陽農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:S513

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本文編號:2697720

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