赤擬谷盜(Tribolium castaneum. Herbst)是廣泛分布于世界各地的儲糧害蟲,通過直接取食、糞便污染及加速霉變等方式對儲糧進(jìn)行危害。目前,全球公認(rèn)最優(yōu)良的儲糧熏蒸劑是磷化氫(PH₃)。由于長期以來對磷化氫不科學(xué)的使用,使得赤擬谷盜在全球范圍內(nèi)產(chǎn)生了不同程度的抗性。隨著世界貿(mào)易不斷發(fā)展,其危害范圍越來越廣泛,抗性越來越嚴(yán)重。前人對于磷化氫的研究都是從某一方面出發(fā),缺乏系統(tǒng)性、完整性。mRNA基因表達(dá)譜可在整體水平上研究細(xì)胞中基因轉(zhuǎn)錄的情況及規(guī)律,綜合考慮環(huán)境與基因組相互作用,為磷化氫毒理及抗性機(jī)制的研究提供有效的研究方法,赤擬谷盜全基因組測序的完成,也為從整體水平研究熏蒸劑磷化氫提供了堅實的基礎(chǔ)。為了進(jìn)一步了解磷化氫的毒理機(jī)制和昆蟲的抗性機(jī)制,本研究以赤擬谷盜為研究對象,采用高通量Illumina RNA-seq技術(shù),構(gòu)建了未熏蒸敏感品系(NF S)、未熏蒸抗性品系(NF R)、熏蒸后敏感品系(PF_S20)和熏蒸后抗性品系(PF R20)的數(shù)字基因表達(dá)譜。篩選NF_R vs NF_S、...

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【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖３－１赤擬谷盜總ＲＮＡ瓊脂糖凝膠電泳圖??（ＮＦ＿Ｓ：未熏蒸敏感品系，ＮＦ＿Ｒ：未熏蒸抗性品系，ＰＦ＿Ｓ２０：熏蒸巧敏感品系，ＰＦ＿Ｒ２０：??）??

３．１總ＲＮＡ提取及質(zhì)量鑒定??３丄１總ＲＮＡ瓊脂糖凝膠電泳檢測結(jié)果??圖３－１為電泳檢測結(jié)果圖，從圖中可看出２８Ｓ和１８Ｓ《帶清晰無拖尾，說??明民ＮＡ無降解，１８Ｓ條帶比２８Ｓ條帶清晰，無蛋白質(zhì)污染，總ＲＮＡ質(zhì)量較好。??■??圖３－１赤擬谷盜總ＲＮＡ瓊脂糖凝膠電泳圖??（Ｎ....

圖3一赤擬谷盜4個樣本總RNAAgilent2100檢測結(jié)果

陜陽師范人學(xué)碩＋巧巧論文???３．１．３?Ａｇｉｌｅｎｔ?２１００?Ｂｉｏａｎａｌｙｚｅｒ?檢測結(jié)果??使用Ａｇｉｌｅｎｔ?２１００生物分析儀檢測民ＮＡ的完整性，結(jié)果如圖３－２所示。Ａｇｉｌｅｎｔ??檢測圖譜中，２３?Ｓ左右起峰是由于Ｍａｒｋｅｒ的存在；后面緊緊跟隨的峰，是由于ｓ....

圖3-3原始數(shù)據(jù)過濾圖

３．２．１測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評估??木實驗所用四個樣木分別為ＮＦ＿Ｒ、ＮＦ＿Ｓ、ＰＦ＿Ｒ２０和ＰＦ＿Ｓ２０，共建４個文??庫。經(jīng)過?Ｉｌｌｈｉｍｉｎａ?出ｓ〇ｉ？２０００?測序后，ＮＦ＿Ｒ、ＮＦ＿Ｓ、ＰＦ＿Ｒ２０?和?ＰＦ＿Ｓ２０?分別得??到了?６，６６２，１９２、７，８４９，０１５....

圖３－６四個不同樣本基巧表達(dá)水平盒形圖??Ｅｇｕｒｅ?３－６．?Ｂｏｘ?ｐｌｏｔ?ｏｆ?ｇｅ打ｅ?ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ?ｌｅｖｅｌ?ｏｆ?化ｅ?ｆｏｕｒ?ｓａｍｐｌｅｓ??３．２Ａ２差異表達(dá)基因的篩選??

３．２．４．１基因表達(dá)水平對比??將基因的民ＰＫＭ值轉(zhuǎn)化為ｌｏｇｉ〇（ＲＰＫＭ＋ｌ），樣品名為橫坐標(biāo)，ｌｏｇｉ〇（ＲＰＫＭ＋ｌ）??為縱坐標(biāo)作圖。如圖３－６所示，大多數(shù)轉(zhuǎn)錄本ｌｏｇｉ〇（ＲＰＩＣＭ＋ｌ）值都在０．５－２之間，??也有一些高于或者低于這個水平，這些為離群轉(zhuǎn)錄本，用黑....

本文編號：3969094