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敦煌地區(qū)不同鹽堿類(lèi)型土壤中未培養(yǎng)細(xì)菌多樣性研究

發(fā)布時(shí)間:2022-01-23 05:51
  本研究利用分子生態(tài)學(xué)方法,應(yīng)用Illumina Hi Seq 2500高通量測(cè)序技術(shù)和構(gòu)建土壤細(xì)菌16S r RNA基因克隆文庫(kù)的方法來(lái)分析敦煌地區(qū)不同類(lèi)型鹽堿土壤中細(xì)菌多樣性、群落結(jié)構(gòu)及其與土壤理化性質(zhì)之間的關(guān)系,從而揭示敦煌地區(qū)不同類(lèi)型鹽堿土壤中細(xì)菌群落組成的多樣性。主要研究結(jié)果有:(1)高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)14個(gè)土壤樣品優(yōu)化后的序列進(jìn)行劃分共得到4997個(gè)OTUs。主要分歸于厚壁菌門(mén)(Firmicutes),放線(xiàn)菌門(mén)(Actinobacteria),變形菌門(mén)(Proteobacteria),Deinococcus-Thermus,擬桿菌門(mén)(Bacteroidetes),芽單胞菌門(mén)(Gemmatimonadetes),綠彎菌門(mén)(Chloroflexi),酸桿菌門(mén)(Acidobacteria),浮霉菌門(mén)(Planctomycetes),纖維桿菌門(mén)(Fibrobacteres)等17個(gè)菌門(mén)以及未知類(lèi)群?寺∥膸(kù)構(gòu)建的9個(gè)土壤樣品中共得到厚壁菌門(mén)(Firmicutes)、放線(xiàn)菌門(mén)(Actinobacteria)、擬桿菌門(mén)(Bacteroidetes)、浮霉菌門(mén)(Planctomycetes)... 

【文章來(lái)源】:西北師范大學(xué)甘肅省

【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

敦煌地區(qū)不同鹽堿類(lèi)型土壤中未培養(yǎng)細(xì)菌多樣性研究


樣品平均序列度(bp)和樣品優(yōu)化序列

曲線(xiàn),樣品,曲線(xiàn),細(xì)菌門(mén)


22圖3-2 樣品的 釋性曲線(xiàn)Fig.3-2 Rarefaction curves of the samples3.2.3 土壤細(xì)菌群落組成特征3.2.3.1 水平上 菌類(lèi)群 成圖 3-3 中顯示了豐度較高的細(xì)菌門(mén)類(lèi),每一個(gè)柱狀圖是一個(gè)樣品的物種分布組成,而每種顏色的面積代表了一個(gè)物種的相對(duì)豐度。14 個(gè)土壤樣品的 1229404條序列分隸屬于細(xì)菌類(lèi)群的 17 個(gè)門(mén)和未知菌門(mén),主要包括細(xì)菌域的變形菌門(mén)(Proteobacteria),浮霉菌門(mén)(Planctomycetes),芽單胞菌門(mén)(Gemmatimonadetes),厚壁菌門(mén)(Firmicutes),纖維桿菌門(mén)(Fibrobacteres)

相對(duì)度,菌群,熱圖


23圖3-3 菌群落相對(duì) 度在 水平上的分布統(tǒng)計(jì)Fig.3-3 Relative abundances in different phyla of bacterial community圖3-4 基于 水平上的熱圖分Fig.3-4 Based on the level of phyla heatmap圖3-4熱圖可以清晰的展現(xiàn)出在門(mén)水平上,細(xì)菌在各樣品中的不同分布。土壤中占優(yōu)勢(shì)的細(xì)菌菌門(mén)為厚壁菌門(mén)(76.27%),其次是放線(xiàn)菌門(mén)(11.23%)和變形菌門(mén)(5.99%),研究發(fā)現(xiàn)在敦煌地區(qū)的土壤樣品中的這三個(gè)菌門(mén)在14個(gè)

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[3]新一代高通量測(cè)序技術(shù)研究土壤微生物群落結(jié)構(gòu)對(duì)環(huán)境條件的響應(yīng)[D]. 張彩霞.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
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本文編號(hào):3603731

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