敦煌地區(qū)不同鹽堿類(lèi)型土壤中未培養(yǎng)細(xì)菌多樣性研究
發(fā)布時(shí)間:2022-01-23 05:51
本研究利用分子生態(tài)學(xué)方法,應(yīng)用Illumina Hi Seq 2500高通量測(cè)序技術(shù)和構(gòu)建土壤細(xì)菌16S r RNA基因克隆文庫(kù)的方法來(lái)分析敦煌地區(qū)不同類(lèi)型鹽堿土壤中細(xì)菌多樣性、群落結(jié)構(gòu)及其與土壤理化性質(zhì)之間的關(guān)系,從而揭示敦煌地區(qū)不同類(lèi)型鹽堿土壤中細(xì)菌群落組成的多樣性。主要研究結(jié)果有:(1)高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)14個(gè)土壤樣品優(yōu)化后的序列進(jìn)行劃分共得到4997個(gè)OTUs。主要分歸于厚壁菌門(mén)(Firmicutes),放線(xiàn)菌門(mén)(Actinobacteria),變形菌門(mén)(Proteobacteria),Deinococcus-Thermus,擬桿菌門(mén)(Bacteroidetes),芽單胞菌門(mén)(Gemmatimonadetes),綠彎菌門(mén)(Chloroflexi),酸桿菌門(mén)(Acidobacteria),浮霉菌門(mén)(Planctomycetes),纖維桿菌門(mén)(Fibrobacteres)等17個(gè)菌門(mén)以及未知類(lèi)群?寺∥膸(kù)構(gòu)建的9個(gè)土壤樣品中共得到厚壁菌門(mén)(Firmicutes)、放線(xiàn)菌門(mén)(Actinobacteria)、擬桿菌門(mén)(Bacteroidetes)、浮霉菌門(mén)(Planctomycetes)...
【文章來(lái)源】:西北師范大學(xué)甘肅省
【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
樣品平均序列度(bp)和樣品優(yōu)化序列
22圖3-2 樣品的 釋性曲線(xiàn)Fig.3-2 Rarefaction curves of the samples3.2.3 土壤細(xì)菌群落組成特征3.2.3.1 水平上 菌類(lèi)群 成圖 3-3 中顯示了豐度較高的細(xì)菌門(mén)類(lèi),每一個(gè)柱狀圖是一個(gè)樣品的物種分布組成,而每種顏色的面積代表了一個(gè)物種的相對(duì)豐度。14 個(gè)土壤樣品的 1229404條序列分隸屬于細(xì)菌類(lèi)群的 17 個(gè)門(mén)和未知菌門(mén),主要包括細(xì)菌域的變形菌門(mén)(Proteobacteria),浮霉菌門(mén)(Planctomycetes),芽單胞菌門(mén)(Gemmatimonadetes),厚壁菌門(mén)(Firmicutes),纖維桿菌門(mén)(Fibrobacteres)
23圖3-3 菌群落相對(duì) 度在 水平上的分布統(tǒng)計(jì)Fig.3-3 Relative abundances in different phyla of bacterial community圖3-4 基于 水平上的熱圖分Fig.3-4 Based on the level of phyla heatmap圖3-4熱圖可以清晰的展現(xiàn)出在門(mén)水平上,細(xì)菌在各樣品中的不同分布。土壤中占優(yōu)勢(shì)的細(xì)菌菌門(mén)為厚壁菌門(mén)(76.27%),其次是放線(xiàn)菌門(mén)(11.23%)和變形菌門(mén)(5.99%),研究發(fā)現(xiàn)在敦煌地區(qū)的土壤樣品中的這三個(gè)菌門(mén)在14個(gè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]土壤微生物多樣性分析方法的研究進(jìn)展[J]. 金明. 農(nóng)業(yè)技術(shù)與裝備. 2016(04)
[2]內(nèi)蒙古河套灌區(qū)不同鹽堿程度的土壤細(xì)菌群落多樣性[J]. 李新,焦燕,代鋼,楊銘德,溫慧洋. 中國(guó)環(huán)境科學(xué). 2016(01)
[3]河西走廊酒泉地區(qū)鹽堿土未培養(yǎng)放線(xiàn)菌多樣性[J]. 李海云,牛世全,孔維寶,閻薇如,耿暉,韓彩虹,達(dá)文燕,張愛(ài)梅,朱學(xué)泰. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2015(09)
[4]河西走廊石羊河下游地區(qū)鹽堿土中放線(xiàn)菌多樣性——以民勤縣為例[J]. 李海云,牛世全,孔維寶,朱學(xué)泰,張愛(ài)梅,達(dá)文燕,韓彩虹,閻薇如,耿暉. 中國(guó)環(huán)境科學(xué). 2015(06)
[5]土壤微生物多樣性研究的新進(jìn)展[J]. 李旭東,徐莉娜,薛林貴. 廣州化工. 2014(20)
[6]柴達(dá)木盆地達(dá)布遜鹽湖微生物多樣性研究[J]. 趙婉雨,楊漸,董海良,吳耿,王尚,孫永娟,賴(lài)忠平,蔣宏忱. 地球與環(huán)境. 2013(04)
[7]三峽庫(kù)區(qū)小江流域消落區(qū)土壤微生物多樣性[J]. 邱權(quán),陳雯莉. 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(03)
[8]微生物分子生態(tài)學(xué)發(fā)展歷史及研究現(xiàn)狀[J]. 李曉然,呂毅,宮路路,柳陳堅(jiān). 中國(guó)微生態(tài)學(xué)雜志. 2012(04)
[9]高通量測(cè)序技術(shù)及其在生命科學(xué)中的應(yīng)用[J]. 李慶崗,陶立. 畜牧與飼料科學(xué). 2012(02)
[10]土壤微生物多樣性及其研究方法綜述[J]. 蔡晨秋,唐麗,龍春林. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(28)
博士論文
[1]庫(kù)姆塔格沙漠東緣風(fēng)沙活動(dòng)及羽毛狀沙丘剖面特征[D]. 王永勝.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2014
[2]莠去津?qū)ν寥牢⑸锶郝浣Y(jié)構(gòu)及分子多樣性的影響[D]. 王軍.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
碩士論文
[1]石油污染物質(zhì)輸入對(duì)濱海濕地根際微生物群落結(jié)構(gòu)的影響研究[D]. 孫會(huì)梅.中國(guó)海洋大學(xué) 2013
[2]庫(kù)姆塔格沙漠土壤微生物多樣性研究[D]. 許璐.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2013
[3]新一代高通量測(cè)序技術(shù)研究土壤微生物群落結(jié)構(gòu)對(duì)環(huán)境條件的響應(yīng)[D]. 張彩霞.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]敦煌盆地地下水?dāng)?shù)值模擬及可視化與管理[D]. 桑學(xué)鋒.蘭州大學(xué) 2006
本文編號(hào):3603731
【文章來(lái)源】:西北師范大學(xué)甘肅省
【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
樣品平均序列度(bp)和樣品優(yōu)化序列
22圖3-2 樣品的 釋性曲線(xiàn)Fig.3-2 Rarefaction curves of the samples3.2.3 土壤細(xì)菌群落組成特征3.2.3.1 水平上 菌類(lèi)群 成圖 3-3 中顯示了豐度較高的細(xì)菌門(mén)類(lèi),每一個(gè)柱狀圖是一個(gè)樣品的物種分布組成,而每種顏色的面積代表了一個(gè)物種的相對(duì)豐度。14 個(gè)土壤樣品的 1229404條序列分隸屬于細(xì)菌類(lèi)群的 17 個(gè)門(mén)和未知菌門(mén),主要包括細(xì)菌域的變形菌門(mén)(Proteobacteria),浮霉菌門(mén)(Planctomycetes),芽單胞菌門(mén)(Gemmatimonadetes),厚壁菌門(mén)(Firmicutes),纖維桿菌門(mén)(Fibrobacteres)
23圖3-3 菌群落相對(duì) 度在 水平上的分布統(tǒng)計(jì)Fig.3-3 Relative abundances in different phyla of bacterial community圖3-4 基于 水平上的熱圖分Fig.3-4 Based on the level of phyla heatmap圖3-4熱圖可以清晰的展現(xiàn)出在門(mén)水平上,細(xì)菌在各樣品中的不同分布。土壤中占優(yōu)勢(shì)的細(xì)菌菌門(mén)為厚壁菌門(mén)(76.27%),其次是放線(xiàn)菌門(mén)(11.23%)和變形菌門(mén)(5.99%),研究發(fā)現(xiàn)在敦煌地區(qū)的土壤樣品中的這三個(gè)菌門(mén)在14個(gè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]土壤微生物多樣性分析方法的研究進(jìn)展[J]. 金明. 農(nóng)業(yè)技術(shù)與裝備. 2016(04)
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[3]河西走廊酒泉地區(qū)鹽堿土未培養(yǎng)放線(xiàn)菌多樣性[J]. 李海云,牛世全,孔維寶,閻薇如,耿暉,韓彩虹,達(dá)文燕,張愛(ài)梅,朱學(xué)泰. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2015(09)
[4]河西走廊石羊河下游地區(qū)鹽堿土中放線(xiàn)菌多樣性——以民勤縣為例[J]. 李海云,牛世全,孔維寶,朱學(xué)泰,張愛(ài)梅,達(dá)文燕,韓彩虹,閻薇如,耿暉. 中國(guó)環(huán)境科學(xué). 2015(06)
[5]土壤微生物多樣性研究的新進(jìn)展[J]. 李旭東,徐莉娜,薛林貴. 廣州化工. 2014(20)
[6]柴達(dá)木盆地達(dá)布遜鹽湖微生物多樣性研究[J]. 趙婉雨,楊漸,董海良,吳耿,王尚,孫永娟,賴(lài)忠平,蔣宏忱. 地球與環(huán)境. 2013(04)
[7]三峽庫(kù)區(qū)小江流域消落區(qū)土壤微生物多樣性[J]. 邱權(quán),陳雯莉. 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(03)
[8]微生物分子生態(tài)學(xué)發(fā)展歷史及研究現(xiàn)狀[J]. 李曉然,呂毅,宮路路,柳陳堅(jiān). 中國(guó)微生態(tài)學(xué)雜志. 2012(04)
[9]高通量測(cè)序技術(shù)及其在生命科學(xué)中的應(yīng)用[J]. 李慶崗,陶立. 畜牧與飼料科學(xué). 2012(02)
[10]土壤微生物多樣性及其研究方法綜述[J]. 蔡晨秋,唐麗,龍春林. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(28)
博士論文
[1]庫(kù)姆塔格沙漠東緣風(fēng)沙活動(dòng)及羽毛狀沙丘剖面特征[D]. 王永勝.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2014
[2]莠去津?qū)ν寥牢⑸锶郝浣Y(jié)構(gòu)及分子多樣性的影響[D]. 王軍.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
碩士論文
[1]石油污染物質(zhì)輸入對(duì)濱海濕地根際微生物群落結(jié)構(gòu)的影響研究[D]. 孫會(huì)梅.中國(guó)海洋大學(xué) 2013
[2]庫(kù)姆塔格沙漠土壤微生物多樣性研究[D]. 許璐.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2013
[3]新一代高通量測(cè)序技術(shù)研究土壤微生物群落結(jié)構(gòu)對(duì)環(huán)境條件的響應(yīng)[D]. 張彩霞.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]敦煌盆地地下水?dāng)?shù)值模擬及可視化與管理[D]. 桑學(xué)鋒.蘭州大學(xué) 2006
本文編號(hào):3603731
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