印度谷螟PintGOBP2基因的全長(zhǎng)序列克隆及其生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-10-24 17:04
印度谷螟Plodiainterpunctella(Hübner),是一種危害性較嚴(yán)重的倉儲(chǔ)害蟲,在我國廣泛分布。在其感染寄主的過程中,氣味結(jié)合蛋白(OBPs)對(duì)印度谷螟的行為反應(yīng)有重要作用。通過轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)篩選、鑒定獲得印度谷螟OBP基因序列,并命名為PintGOBP2,用DNAMAN對(duì)其進(jìn)行序列分析,BLAST進(jìn)行同源性比較,并使用MEGA6.0構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹。結(jié)果表明:印度谷螟普通氣味結(jié)合蛋白PintGOBP2的編碼基因開放閱讀框全長(zhǎng)426 bp,編碼141個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)分子量為15.48 kDa,等電點(diǎn)為4.39;N末端具有16個(gè)氨基酸殘基組成的信號(hào)肽序列,并含有由6個(gè)半胱氨酸組成的保守片段,屬于ClassicalOBPs亞家族基因。同源比對(duì)結(jié)果表明,PintGOBP2基因編碼蛋白與其他鱗翅目昆蟲GOBP蛋白具有較高的同源性。進(jìn)化樹分析結(jié)果表明,PintGOBP2基因與翅目昆蟲GOBP超家族內(nèi)相關(guān)基因的同源很高。研究結(jié)果為進(jìn)一步分析印度谷螟PintGOBP2蛋白在其嗅覺信號(hào)傳導(dǎo)過程中的生理功能提供了基礎(chǔ)材料。
【文章來源】:糧油食品科技. 2019,27(05)
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 供試?yán)ハx
1.2 印度谷螟總RNA提取及cDNA合成
1.3 PintOBP2全長(zhǎng)cDNA序列克隆
1.4 序列鑒定及進(jìn)化樹分析
2 結(jié)果與分析
2.1 印度谷螟普通氣味結(jié)合蛋白PintGOBP2基因的克隆與序列分析
2.2 PintGOBP2氨基酸多序列比對(duì)及系統(tǒng)進(jìn)化分析
3 結(jié)論與討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]桃蛀螟性信息素結(jié)合蛋白Cpun-PBP1的cDNA克隆、表達(dá)譜及其與配體化合物的結(jié)合特性分析[J]. 賈小儉,郝少東,杜艷麗,張民照,覃曉春,王進(jìn)忠,王海香,冀衛(wèi)榮. 昆蟲學(xué)報(bào). 2015(11)
[2]中國農(nóng)業(yè)昆蟲基因組學(xué)研究概況與展望[J]. 張傳溪. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(17)
[3]苜蓿盲蝽氣味結(jié)合蛋白基因Alin-OBP1的克隆及表達(dá)譜分析[J]. 谷少華,張雪瑩,張永軍,吳孔明,郭予元. 昆蟲學(xué)報(bào). 2010(05)
本文編號(hào):3455646
【文章來源】:糧油食品科技. 2019,27(05)
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 供試?yán)ハx
1.2 印度谷螟總RNA提取及cDNA合成
1.3 PintOBP2全長(zhǎng)cDNA序列克隆
1.4 序列鑒定及進(jìn)化樹分析
2 結(jié)果與分析
2.1 印度谷螟普通氣味結(jié)合蛋白PintGOBP2基因的克隆與序列分析
2.2 PintGOBP2氨基酸多序列比對(duì)及系統(tǒng)進(jìn)化分析
3 結(jié)論與討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]桃蛀螟性信息素結(jié)合蛋白Cpun-PBP1的cDNA克隆、表達(dá)譜及其與配體化合物的結(jié)合特性分析[J]. 賈小儉,郝少東,杜艷麗,張民照,覃曉春,王進(jìn)忠,王海香,冀衛(wèi)榮. 昆蟲學(xué)報(bào). 2015(11)
[2]中國農(nóng)業(yè)昆蟲基因組學(xué)研究概況與展望[J]. 張傳溪. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(17)
[3]苜蓿盲蝽氣味結(jié)合蛋白基因Alin-OBP1的克隆及表達(dá)譜分析[J]. 谷少華,張雪瑩,張永軍,吳孔明,郭予元. 昆蟲學(xué)報(bào). 2010(05)
本文編號(hào):3455646
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