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生菜連作及生菜-菠菜輪作對土壤細菌群落結(jié)構(gòu)的影響

發(fā)布時間:2021-06-21 14:45
  以生菜連作和生菜-菠菜輪作不同次數(shù)的土壤樣品為材料,研究比較生菜不同種植方式下土壤細菌群落的差異。采集0-20 cm深度土壤樣品,分別提取樣品總DNA,采用高通量測序技術(shù)分析生菜種植前后土壤樣品中細菌多樣性。測序結(jié)果經(jīng)過質(zhì)控過濾,共獲得有效序列46 865條,對相似水平為97%的OTU進行生物信息統(tǒng)計分析,共得到OTU 21 692個。Heatmap圖和群落組成分析顯示,樣品共檢測到細菌40個門,89個綱,190個目,371個科,693個屬,其中變形菌門、厚壁菌門和放線菌門在連作過程中占比逐漸下降,而在輪作過程中較為穩(wěn)定。另外,壤霉菌屬、節(jié)細菌屬、黃桿菌屬、溶桿菌屬及微細菌屬等有益菌屬逐漸成為輪作土壤樣品中的優(yōu)勢菌屬。主成分分析結(jié)果表明,輪作和連作土壤樣品差異明顯。生菜在連續(xù)種植第5次后,產(chǎn)量和過氧化氫酶活性分別下降了24.1%和20.7%,出現(xiàn)連作障礙,而輪作生菜產(chǎn)量和過氧化氫酶活性較連作分別提高了49.6%和10.5%。菠菜-生菜輪作土壤中細菌類群具有豐富的多樣性,隨著輪作的增加有上升的趨勢,可在一定程度上緩解生菜連作過程中出現(xiàn)的問題。 

【文章來源】:生物技術(shù)通報. 2019,35(08)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:10 頁

【部分圖文】:

生菜連作及生菜-菠菜輪作對土壤細菌群落結(jié)構(gòu)的影響


各土壤樣品在門分類水平上細菌類群比較

比較圖,土壤樣品,細菌群落,土壤細菌


2019,35(8)21洪潔等:生菜連作及生菜-菠菜輪作對土壤細菌群落結(jié)構(gòu)的影響示,分析表明連作與輪作土壤細菌群落存在顯著差異(R=0.3542,P=0.04)。圖2各土壤樣品在屬分類水平上細菌類群比較圖3土壤樣品中細菌多樣性的相關(guān)性分析壤樣品細菌群落多樣性的20.98%,主成分2(PC2)可解釋土壤樣品細菌群落的17.49%,兩者總計可解釋樣品的38.47%。其中輪作土壤樣品主要集中在PC1和PC2的負值區(qū)域,連作土壤樣品大部分集中在PC1的負值區(qū)域和PC2的正值區(qū)域。這樣的結(jié)果與ANOSIM統(tǒng)計分析的結(jié)果相類似,如圖5所圖4基于OTU水平的PCA分析2.4LEfSe多級物種差異分析組間樣品菌群差異性分析結(jié)果見圖6。與輪作土壤樣品相比較,連作有21個菌屬發(fā)生改變,包括g_norank_p_Latescibacteria、g_norank_f_BIrii41、g_norank_c_Ardenticatenia、g_11_24、

芽孢桿菌屬,菌屬,相對豐度,貧養(yǎng)


生物技術(shù)通報BiotechnologyBulletin222019,Vol.35,No.8g_Panacagrimonas、g_norank__f_env__OPS_17、g_norank_c__OPB35__soil__group、蛭微菌屬(Bdellovibrio)、g_unclassified_f_FamilyI_o__SubsectionIV、g_unclassified_f__Blastocatellaceae__Subgroup_4_、珊瑚狀放線菌屬(Actinocorallia)、g_norank_f_FamilyI_o_SubsectionIV、g_norank_c_BD7_11、苯基桿菌屬(Phenylobacterium)、g_norank_c_Pla3_lineage、索氏菌屬(Thauera)、g_norank_o_MVP_88、Inquilinus、Tepidanaerobacter和g_norank_o_Lineage_IIb的相對豐度顯著升高;而鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas)、芽胞桿菌目未知菌屬(g_unclassified_o_Bacillales)、類諾卡氏菌科未知菌屬(g_unclassified_f_Nocardioidaceae)、Ilumatobacter、類芽孢桿菌屬(Paenibacillus)、馬杜拉放線菌屬(Actinomadura)、Solirubrobacter、Iamia、中慢生根瘤菌屬(Mesorhizobium)、g_unclassified_f_Phyllobacteriaceae、g_norank_o_Ardenticatenales、Skermanella、Cohnella、特呂珀菌屬(Truepera)、Lautropia、Anaerotruncus、Limnobacter、Haloactinopolyspora、Defluviicoccus、g_norank_f_MNC12、貧養(yǎng)桿菌屬(Modestobacter)、Marinimicrobium、房間芽孢桿菌屬(Domibacillus)、Parafilimonas、丙酸桿菌科未知菌屬(g_unclassified_f_Propionibacteriaceae)和g_norank_f_Euzebyaceae而的相對豐度顯著降低。圖5基于OTU水平的ANOSIM分析圖6LEfSe分析屬水平下LDA值分布柱狀圖

【參考文獻】:
期刊論文
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碩士論文
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本文編號:3240868

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