【摘要】：銹赤扁谷盜Cryptolestes ferrugineus和土耳其扁谷盜Cryptolestes turcicus屬鞘翅目Coleoptera扁谷盜科Laemophloeidae,是一類全球性分布第二食性儲(chǔ)糧害蟲,以在粉類和破碎的糧食、谷物中發(fā)生最多。目前,對于兩種扁谷盜研究主要集中于形態(tài)學(xué)、生態(tài)學(xué)和生物學(xué)特性等方面,分子研究數(shù)據(jù)較少,只有COI基因用于系統(tǒng)發(fā)育分析。因此,對扁谷盜線粒體基因組的測序可以豐富現(xiàn)有的線粒體全基因組數(shù)據(jù),為進(jìn)一步進(jìn)行比較基因組學(xué)研宄提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。本文通過長片段PCR(Long-PCR)技術(shù)對繡赤扁谷盜及土耳其扁谷盜線粒體基因組序列進(jìn)行了擴(kuò)增和測序,得到全長并分析其特征。同時(shí)基于繡赤扁谷盜及土耳其扁谷盜在內(nèi)的24種農(nóng)業(yè)昆蟲線粒體基因組數(shù)據(jù),利用不同方法(最大似然法、鄰接法和貝葉斯法)構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育樹,分析它們的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。主要結(jié)論如下:1.銹赤扁谷盜和土耳其扁谷盜線粒體基因組長度分別為15,511bp和15,517bp,注釋得到13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因(PCGs)、16Sr RNA和12Sr RNA基因、22個(gè)t RNA基因和AT富集區(qū)序列。兩種扁谷盜的線粒體基因組序列具有較高的A+T含量,分別為76.4%和76.9%。2.銹赤扁谷盜及土耳其扁谷盜線粒體蛋白質(zhì)編碼基因均以ATN起始編碼,而終止密碼子具有多樣性,有完整的終止子TAA、TAG及不完整的TA或單個(gè)堿基T。3.兩種扁谷盜22個(gè)t RNA長度在60-71 bp之間,AT含量分別約為76.2%和77.2%。在這22個(gè)t RNA基因中,除t RNASer基因二氫尿嘧啶臂(DHU stem)結(jié)構(gòu)有缺失外,其他21個(gè)均可折疊成三葉草二級結(jié)構(gòu)。這些t RNA二級結(jié)構(gòu)中普遍存在堿基錯(cuò)配,銹赤扁谷盜和土耳其扁谷盜線粒體t RNA二級結(jié)構(gòu)分別存在28處和21處。4.銹赤扁谷盜及土耳其扁谷盜線粒體AT富集區(qū)分別為859bp及857 bp,AT含量高達(dá)86.5%和86.0%。在兩種扁谷盜線粒體AT富集區(qū)中存在不同數(shù)量的Poly-T、Poly-A結(jié)構(gòu)以及(TA)n、(AT)n等微衛(wèi)星結(jié)構(gòu)。5.利用線粒體基因組13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因(PCGs)及2個(gè)核糖體RNA,分別使用NJ、ML和BI法構(gòu)建鞘翅目24種常見農(nóng)業(yè)昆蟲的系統(tǒng)發(fā)育樹,3種系統(tǒng)發(fā)育樹均支持扁谷盜科為單系,屬于扁甲總科,與扁甲科具有較近的親緣關(guān)系。
【圖文】：

圖 2-1 銹赤扁谷盜線粒體基因組結(jié)構(gòu)圖Figure 2-1 Gene map of the C. ferrugineus mitogenome*圖中外圈加粗表示 J 鏈基因；內(nèi)圈加粗表示 N 鏈基因表 2-7 銹赤扁谷盜線粒體基因組成Table2-7 Characteristics of the mtDNA of C. ferrugineusPosition CodonIntergnucleStrand From To Size(bp) Start StopJ 1 64 64 nN 73 142 70 -tJ 142 210 69 -J 210 1208 999 ATT TAA -pJ 1207 1272 66 2sN 1297 1359 63 rN 1360 1425 66 -J 1423 2964 1542 ATA TAA -

第 2 章 銹赤扁谷盜及土耳其扁谷盜線�；蚪M序列擴(kuò)增與分析(L)、AUU(I)及 UAU(Y)，共 1064 個(gè)占所有密碼子的 28.8%。RSCU 分析顯同義密碼子中以堿基 A 或堿基 T 結(jié)尾的個(gè)數(shù)，遠(yuǎn)高于其余同義密碼子的出數(shù)。例如，，在編碼苯丙氨酸(Phe)的同義密碼子中，密碼子 UUU 和 UUC 分現(xiàn)了 461 和 100 次，RSCU 為 1.64 和 0.36。
【學(xué)位授予單位】：南昌大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：S379.5

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號：2677748