【目的】竹鞭是散生竹的主莖,對(duì)竹子地下莖的研究對(duì)竹子生長(zhǎng)發(fā)育意義重大。利用多學(xué)科方法,綜合解析竹子地下莖節(jié)間生長(zhǎng)的解剖學(xué)變化及其轉(zhuǎn)錄組特征!痉椒ā坎捎眯螒B(tài)學(xué)觀察結(jié)合石蠟切片、掃描電鏡等方法觀察矢竹(Pseudosasa japonica)地下莖生長(zhǎng)過(guò)程中的形態(tài)學(xué)變化及解剖結(jié)構(gòu)特征;并利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)合生物信息學(xué)分析比較不同生長(zhǎng)階段節(jié)間轉(zhuǎn)錄組特征;差異表達(dá)基因利用MapMan軟件進(jìn)行可視化分析!窘Y(jié)果】矢竹地下莖的生長(zhǎng)主要由竹鞭前端約14個(gè)處于不同生長(zhǎng)發(fā)育階段的節(jié)間生長(zhǎng)引起。解剖學(xué)分析進(jìn)一步表明,長(zhǎng)度小于0.4cm的節(jié)間細(xì)胞具有較強(qiáng)的分裂能力;而1.0 cm長(zhǎng)節(jié)間主要以細(xì)胞伸長(zhǎng)生長(zhǎng)為主。同時(shí)1.0 cm長(zhǎng)節(jié)間基本組織細(xì)胞已具有顯著的長(zhǎng)、短細(xì)胞之分,且其導(dǎo)管細(xì)胞、纖維細(xì)胞等維管組織細(xì)胞較0.4 cm長(zhǎng)節(jié)間的同類細(xì)胞在長(zhǎng)度上更長(zhǎng),發(fā)育更為成熟。除此之外,相比于0.4 cm長(zhǎng)節(jié)間,1.0 cm長(zhǎng)節(jié)間髓組織已明顯破裂,并初步形成了髓腔。通過(guò)比較0.4 cm長(zhǎng)節(jié)間與1.0 cm長(zhǎng)節(jié)間轉(zhuǎn)錄組圖譜發(fā)現(xiàn),差異表達(dá)基因從0.4 cm長(zhǎng)節(jié)間中以細(xì)胞分裂與初生代謝基因表達(dá)為主,向1.0 cm長(zhǎng)節(jié)間中以細(xì)胞壁...
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圖1矢竹地下莖節(jié)間伸長(zhǎng)的形態(tài)學(xué)觀察
Thecellularanalysisfurtherrevealedthatrhizomeinternodecellswereallderivedfromtheshootapicalmeristem(SAM)(Fig.2a,2b).Theobvi....

圖3矢竹地下莖S2節(jié)間和S3節(jié)間差異表達(dá)基因概況
MapMan[8]enrichmentanalysis(Fig.3)furtherrevealedthatgenesrelatedto24of35MapManlevel-1Binsweresignificantlydifferentiallyexp....

圖4矢竹地下莖S2節(jié)間和S3節(jié)間與激素、RNA轉(zhuǎn)錄及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)的差異表達(dá)基因
TheDEGsrelatedtoabscisicacid(ABA),auxin,ethylene,gibberellin(GA)andjasmonate(JA)signaltransductionpathwaysweresignificantlyupregu....

圖6矢竹地下莖S2與S3節(jié)間與主要細(xì)胞過(guò)程相關(guān)的差異表達(dá)基因
Wealsoanalyzedthedownstreamcellularpathway-relatedgenesbetweentheS3andS2internodesandfoundthat620transport-relatedgenesw....
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3955227
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