表觀遺傳修飾是指不涉及基因組DNA序列的改變、能夠引起可遺傳表型變異的遺傳物質(zhì)的改變,主要形式包括:DNA共價修飾、組蛋白修飾、染色質(zhì)重塑和非編碼RNA的調(diào)控。其中,基因組DNA甲基化是一種非常普遍的DNA共價修飾形式,在植物的生長發(fā)育過程中對基因的表達發(fā)揮著重要的調(diào)控作用,其作用機理正在被逐漸揭開。本研究以來自9個不同種源的毛白楊種質(zhì)資源庫432株不同基因型個體、毛白楊10個不同組織或器官以及銀腺楊×毛白楊雜交子F₁代群體552株不同基因型個體為材料,利用MSAP技術(shù)對其基因組DNA甲基化的遺傳變異及其遺傳效應(yīng)進行研究。主要獲得以下結(jié)論:1.毛白楊種質(zhì)資源庫432株不同基因型個體成熟木質(zhì)部基因組DNA總甲基化相對水平(6.22%-22.40%,平均12.60±2.51%)高于未甲基化相對水平(6.19%-15.77%,平均 11.21±1.52%),全甲基化相對水平(3.10%-15.10,平均 6.31 ± 1.79%)高于半甲基化相對水平(2.86%-12.87%,平均6.29± 1.75%)。10個不同組織或器官未甲基化相對水平均值為36.17%,高于其總...

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【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
引言
1 文獻綜述
    1.1 表觀遺傳學(xué)
        1.1.1 表觀遺傳學(xué)的定義
        1.1.2 表觀遺傳修飾模式
    1.2 DNA甲基化共價修飾
        1.2.1 DNA甲基化修飾的機制
        1.2.2 DNA甲基化修飾的生物學(xué)作用
    1.3 植物DNA甲基化研究
        1.3.1 植物DNA甲基化模式產(chǎn)生機制
        1.3.2 植物DNA甲基化的維持機制
    1.4 研究內(nèi)容及技術(shù)路線
2 毛白楊種質(zhì)資源庫基因組DNA甲基化表觀遺傳變異與效應(yīng)分析
    2.1 材料與方法
        2.1.1 植物材料
        2.1.2 表型性狀測定
        2.1.3 基因組DNA提取與檢測
        2.1.4 甲基化敏感擴增多態(tài)性(MSAP)分析
        2.1.5 群體表觀遺傳結(jié)構(gòu)分析
        2.1.6 多態(tài)性MSAP標記與表型性狀的關(guān)聯(lián)分析
        2.1.7 重要關(guān)聯(lián)位點測序分析
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 甲基化敏感擴增多態(tài)性條帶
        2.2.2 甲基化/未甲基化類型及相對水平
        2.2.3 毛白楊基因組遺傳和表觀遺傳多樣性
        2.2.4 毛白楊群體分化和表觀遺傳結(jié)構(gòu)
        2.2.5 毛白楊種質(zhì)資源庫表型性狀變異與相關(guān)性分析
        2.2.6 多態(tài)性MSAP標記與表型性狀關(guān)聯(lián)分析
        2.2.7 候選基因表達和功能分析
        2.2.8 不同甲基化模式對候選基因表達和表型性狀的影響效應(yīng)分析
    2.3 討論
        2.3.1 毛白楊基因組DNA甲基化變異
        2.3.2 基因組DNA甲基化修飾的遺傳效應(yīng)
    2.4 小結(jié)
3 毛白楊不同組織DNA胞嘧啶甲基化變異研究
    3.1 材料與方法
        3.1.1 植物材料
        3.1.2 基因組DNA和RNA提取
        3.1.3 甲基化敏感擴增多態(tài)性(MSAP)分析
        3.1.4 多態(tài)性片段克隆測序
        3.1.5 基因甲基化特異性計算
        3.1.6 Real-Time qRT-PCR
    3.2 結(jié)果與分析
        3.2.1 毛白楊不同組織和器官整體甲基化模式
        3.2.2 甲基化位點的組織或器官特異性和動態(tài)變化
        3.2.3 組織或器官間多態(tài)性片段測序分析
        3.2.4 基因表達與甲基化的相關(guān)性
        3.2.5 維管組織中不同甲基化的木材品質(zhì)相關(guān)基因的表達模式
    3.3 討論
        3.3.1 不同組織和器官類型間DNA胞嘧啶甲基化模式的變異
        3.3.2 基因表達水平受DNA胞嘧啶甲基化影響
        3.3.3 木材品質(zhì)相關(guān)基因的甲基化
    3.4 小結(jié)
4 毛白楊表觀遺傳連鎖圖譜構(gòu)建與表觀QTL分析
    4.1 材料與方法
        4.1.1 植物材料和基因組DNA提取
        4.1.2 表型性狀的測定
        4.1.3 基因組DNA甲基化分析及表觀基因型分型
        4.1.4 多態(tài)性MSAP標記與表型性狀的關(guān)聯(lián)分析
        4.1.5 表觀遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建
        4.1.6 QTL分析
        4.1.7 特異甲基化片段的測序分析
        4.1.8 候選基因成熟木質(zhì)部表達分析(Real-Time qRT-PCR)
    4.2 結(jié)果與分析
        4.2.1 表型性狀的變異與相關(guān)性分析
        4.2.2 甲基化敏感擴增多態(tài)性條帶與甲基化/未甲基化相對水平
        4.2.3 多態(tài)性MSAP標記與表型性狀單標記關(guān)聯(lián)分析
        4.2.4 表觀遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建
        4.2.5 重要表型性狀的表觀QTL(QTL^epi)分析
        4.2.6 候選基因的影響效應(yīng)分析
    4.3 討論
        4.3.1 基因組DNA甲基化相對水平
        4.3.2 表觀遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建和表觀QTL分析
        4.3.3 表觀遺傳修飾的遺傳效應(yīng)
    4.4 小結(jié)
5 研究結(jié)論
附表
參考文獻
個人簡介
導(dǎo)師簡介
致謝



本文編號：3789096