土壤鹽漬化一直是困擾農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的一大難題,對于土地資源日趨緊張的今天,如何合理利用鹽漬化土壤成為了當今各國的一個重要課題。運用蛋白質(zhì)組學的研究方法研究植物在鹽脅迫下的應答機制,發(fā)掘參與鹽應答反應的關鍵蛋白,對于全面揭示植物的抗鹽機理有重要的意義。本研究通過基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學同位素標記相對和絕對定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,i TRAQ)技術(shù),以AB SCIEX Triple TOFTM5600液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜儀為研究平臺,分析研究了二倍體和四倍體白花泡桐鹽脅迫處理后的表達差異,為進一步研究相關基因及其編碼的蛋白功能打下基礎,以探究泡桐抗鹽分子機制。在本次質(zhì)譜實驗中共鑒定到2851個蛋白,8590個肽段,其中含7221個Unique肽段,并對這2851個蛋白進行GO(Gene Ontology)COG(Cluster of Ortholog Genes)KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)注釋分析,這些蛋白被注釋到47個GO條目上,屬于24個COG cl...

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【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
致謝
摘要
1 文獻綜述
    1.1 植物鹽脅迫在國內(nèi)外的研究進展
    1.2 植物蛋白質(zhì)組研究
        1.2.1 蛋白質(zhì)組學產(chǎn)生背景和相關概念
        1.2.2 蛋白質(zhì)組學的研究方法
        1.2.3 轉(zhuǎn)錄組學與蛋白質(zhì)組學的關聯(lián)
        1.2.4 植物響應鹽脅迫蛋白質(zhì)組學研究
    1.3 二倍體和四倍體泡桐的研究
        1.3.1 泡桐概述
        1.3.2 泡桐新品種的培育
    1.4 本文研究的目的和意義
2 引言
3 材料與方法
    3.1 試驗材料及鹽處理
    3.2 主要試劑和儀器設備
        3.2.1 主要試劑
        3.2.2 主要儀器設備
    3.3 蛋白質(zhì)提取
    3.4 iTRAQ實驗
        3.4.1 蛋白消化
        3.4.2 iTRAQ標記
        3.4.3 SCX分離
        3.4.4 基于Triple TOF 5600 的LC-ESI-MSMS分析
    3.5 生物信息學分析
        3.5.1 數(shù)據(jù)庫的選擇和搜索
        3.5.2 蛋白質(zhì)鑒定信息統(tǒng)計
        3.5.3 差異蛋白關聯(lián)分析
    3.6 總RNA的提取
    3.7 qRT-PCR驗證
4 結(jié)果與分析
    4.1 樣品蛋白質(zhì)含量
    4.2 蛋白質(zhì)鑒定
        4.2.1 基本鑒定信息
        4.2.2 蛋白組整體分布情況
    4.3 蛋白質(zhì)注釋
        4.3.1 GO分類
        4.3.2 COG分類
        4.3.3 Pathway代謝通路分類
    4.4 差異蛋白統(tǒng)計
        4.4.1 蛋白質(zhì)相對定量
        4.4.2 鹽應答蛋白確定方案分析
        4.4.3 鹽應答蛋白的GO分類
        4.4.4 鹽應答蛋白Pathway分析
    4.5 蛋白質(zhì)組與轉(zhuǎn)錄組的關聯(lián)分析
    4.6 差異表達蛋白的qRT-PCR驗證
5 結(jié)論與討論
參考文獻
ABSTRACT



本文編號：3777987