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泡桐屬植物的系統(tǒng)發(fā)育研究

發(fā)布時間:2022-02-26 05:40
  泡桐(Paulownia Sieb.et Zucc)為玄參科唯一落葉喬木,其自然分布區(qū)和栽培區(qū)覆蓋我國各個地區(qū),是一種重要的優(yōu)質(zhì)速生樹材經(jīng)濟林木。由于泡桐多為異花授粉,均可通過種間雜交并產(chǎn)生可育后代,而且可以通過無性繁殖,形成和保留過渡類型,經(jīng)過漫長的種間雜交和反復回交與自然選擇,各個種的基因與基因組合,滲入雜交,使得泡桐屬在植物學分類上屬于困難屬。傳統(tǒng)意義上的形態(tài)學利用表型的重點差異結(jié)構(gòu)將泡桐屬歸入玄參科或紫葳科,而隨后發(fā)展的花粉形態(tài)學在對花粉形態(tài)的比對中發(fā)現(xiàn)顯著差異而將泡桐屬歸入玄參科中,但人們對泡桐屬及其近緣屬之間的進化關(guān)系及其種間進化關(guān)系尚未進行相關(guān)報道。本實驗通過對葉綠體基因組psb E-pet L、trn D-trn T兩條序列及其聯(lián)合序列數(shù)據(jù)集處理,旨在通過對泡桐屬植物種內(nèi)及與其相近科屬的系統(tǒng)發(fā)育學分析,闡明屬內(nèi)進化關(guān)系及系統(tǒng)學地位,為泡桐屬歸科問題提供依據(jù),同時也為更有效的收集種質(zhì)資源和選育良種提供參考依據(jù)。主要實驗結(jié)果如下:(1)提取植物基因組DNA并檢測DNA的濃度與質(zhì)量。通過對改良CTAB法和尿素法的比對和綜合考慮,最終選擇能提取出質(zhì)量較好,適合基因組擴增需求的改... 

【文章來源】:河南農(nóng)業(yè)大學河南省

【文章頁數(shù)】:47 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
致謝
摘要
1 文獻綜述
    1.1 分子系統(tǒng)學
        1.1.1 分子系統(tǒng)學的形成
        1.1.2 分子系統(tǒng)學的研究進展
            1.1.2.1 分子系統(tǒng)發(fā)生學
            1.1.2.2 系統(tǒng)基因組學
            1.1.2.3 群體遺傳學
            1.1.2.4 系統(tǒng)地理學
            1.1.2.5 DNA條形碼
            1.1.2.6 DNA分類學
    1.2 分子系統(tǒng)學的研究方法
        1.2.1 分類群的正確選擇
        1.2.2 目的基因的選擇
        1.2.3 基因序列數(shù)據(jù)的對比
        1.2.4 基因樹的構(gòu)建方法
    1.3 葉綠體基因組
        1.3.1 葉綠體基因組的結(jié)構(gòu)與功能
        1.3.2 葉綠體基因組在植物系統(tǒng)發(fā)育研究中的應用及優(yōu)勢
    1.4 泡桐屬簡介
        1.4.1 泡桐屬資源及特征
        1.4.2 泡桐屬種類
2 引言
3 材料與方法
    3.1 材料與試劑
        3.1.1 實驗材料
        3.1.2 實驗所用試劑
            3.1.2.1 提取植物基因組DNA所用試劑
            3.1.2.2 反應體系所用試劑及所需儀器
    3.2 試驗方法
        3.2.1 植物基因組DNA的提取
        3.2.2 模板DNA質(zhì)量檢測及濃度檢測
            3.2.2.1 DNA的質(zhì)量檢測
            3.2.2.2 DNA的濃度檢測
        3.2.3 cpDNA分子發(fā)育系統(tǒng)PCR體系的建立及優(yōu)化
        3.2.4 PCR體系和擴增引物的篩選
            3.2.4.1 PCR體系和反應程序
            3.2.4.2 PCR反應體系優(yōu)化及引物篩選
    3.3 數(shù)據(jù)處理與分析
        3.3.1 序列編輯與比對
        3.3.2 數(shù)據(jù)特征分析
4 結(jié)果與分析
    4.1 植物總DNA的檢測結(jié)果
    4.2 PCR反應體系的優(yōu)化
        4.2.1 PCR反應體系單因子試驗
            4.2.1.1 不同DNA模板濃度對PCR體系的影響
            4.2.1.2 不同引物濃度對PCR體系的影響
            4.2.1.3 不同退火溫度對PCR體系的影響
        4.2.2 PR引物的篩選
    4.3 PCR擴增和序列的測定
    4.4 測序結(jié)果和分析
        4.4.1 序列分析
        4.4.2 序列特點
            4.4.2.1 petL-psbE序列
            4.4.2.2 trnD-trnT序列
            4.4.2.3 petL-psbE和trnD-trnT結(jié)合序列
        4.4.3 系統(tǒng)發(fā)育結(jié)果分析
            4.4.3.1 基于petL-psbE序列數(shù)據(jù)集構(gòu)建的最大簡約樹(MP)
            4.4.3.2 基于trnD-trnT序列數(shù)據(jù)集構(gòu)建的最大簡約樹(MP)
            4.4.3.3 基于petL-psbE和trnD-trnT聯(lián)合數(shù)據(jù)集構(gòu)建的最大簡約樹(MP)
5 結(jié)論與討論
    5.1 改良CTAB法及尿素法提取基因組總DNA
    5.2 優(yōu)化建立PCR最佳反應體系
    5.3 泡桐屬植物及其近緣科植物的遺傳距離
    5.4 cpDNA序列信息揭示泡桐屬植物系統(tǒng)進化關(guān)系
參考文獻
英文摘要


【參考文獻】:
期刊論文
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[4]馬褂木遺傳多樣性及系統(tǒng)地理學研究[D]. 惠利省.南京林業(yè)大學 2010
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碩士論文
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[4]美麗桐屬的分子系統(tǒng)學研究[D]. 劉國麗.華東師范大學 2011



本文編號:3644104

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