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基于cpDNA與AFLP標(biāo)記的越南槐群體遺傳結(jié)構(gòu)研究

發(fā)布時(shí)間:2021-09-23 07:22
  越南槐(Sophora tonkinensis Gapnep)別名廣豆根、苦豆根、山豆根、柔枝槐,是豆科多年生灌木植物,主要藥效成分是生物堿,具有很高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值,廣西是越南槐的主要產(chǎn)區(qū),目前越南槐的研究主要集中在藥材鑒別和藥理作用方面,對(duì)廣西、貴州、云南等地越南槐種質(zhì)資源遺傳多樣性缺乏系統(tǒng)性研究,導(dǎo)致對(duì)越南槐保育策略的選擇存在盲目性。本研究以越南槐的葉片為材料,利用cpDNA(葉綠體基因組)分子標(biāo)記及擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性(AFLP)技術(shù),對(duì)不同產(chǎn)地的越南槐進(jìn)行遺傳多樣性分析,以期為越南槐親緣關(guān)系研究提供分子生物學(xué)依據(jù),為越南槐遺傳保育奠定基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:1、利用3種略有不同的DNA提取方法分別提取越南槐樣品DNA,對(duì)比獲得的DNA樣品質(zhì)量,結(jié)果表明利用樣品預(yù)處理法提取的越南槐基因組DNA效果最好。2、篩選了 5對(duì)引物用于48份材料進(jìn)行不同cpDNA標(biāo)記的擴(kuò)增。48份材料中擴(kuò)增出cpDNA序列,變異位點(diǎn)為38個(gè)堿基,轉(zhuǎn)換率14.01%,堿基顛換率21.02%,說(shuō)明48份材料之間變異較大。通過(guò)對(duì)單倍型間分化指數(shù)Hd=0.826±0.040可將整個(gè)序列分為18個(gè)單倍型,從單倍型網(wǎng)絡(luò)圖中... 

【文章來(lái)源】:廣西大學(xué)廣西壯族自治區(qū) 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

基于cpDNA與AFLP標(biāo)記的越南槐群體遺傳結(jié)構(gòu)研究


圖3-1瓊脂糖凝膠的電泳檢測(cè)??Fig.?3-1?Detection?result?of?AGE?(agarose?gel?electrophoresis)??

電泳圖,電泳圖,序列,提取法


OD260/280在正常范圍,OD260/230接近2.0,濃度在100-300ng/mL,三者相比樣品預(yù)??處理法提取效果最佳。??用1°/。的瓊脂糖凝膠上樣lmL檢測(cè),部分樣本跑膠檢測(cè)如圖3-1所示,檢測(cè)結(jié)果表??明:酚-氯仿-異戊醇提取法提取的DNA難以分辨主帶,原因可能為提取過(guò)程中酚-氯仿-??異戊醇(25:24:1?)未將蛋白質(zhì)除盡,以及后續(xù)核算中含有殘留的酚類(lèi)物質(zhì)過(guò)多;高PVP??和P-巰基乙醇提取法結(jié)果顯示能提取條帶單一的基因組DNA,提取越南槐DNA產(chǎn)量較??高,但仍存在多糖;樣品預(yù)處理法提取的DNA電泳結(jié)果顯示條帶清晰,單一,亮度高,??提取效果最好。??M?1?2?3?4?5?6?7?S?^???圖3-1瓊脂糖凝膠的電泳檢測(cè)??Fig.?3-1?Detection?result?of?AGE?(agarose?gel?electrophoresis)??注:M:?DL10000DNA?Marker;?1-3號(hào)泳道為酚-氯仿-異戊醇提取法獲得的越南槐DNA;?4-6號(hào)??泳道為高PVP和P-巰基乙醇提取法獲得的DNA:?7-9號(hào)泳道為樣品預(yù)處理法獲得的DNA。??M:?DL10000?DNA?Marker;?l-31ane:?DNA?extracted?by?phenol-chloroform-isoamylalcohol?extraction??method;?4-6?lane:?DNA?extracted?by?high?level?of?PVP?and?p-ME?extraction?method;?7-91ane

電泳圖,電泳圖,序列,提取法


OD260/280在正常范圍,OD260/230接近2.0,濃度在100-300ng/mL,三者相比樣品預(yù)??處理法提取效果最佳。??用1°/。的瓊脂糖凝膠上樣lmL檢測(cè),部分樣本跑膠檢測(cè)如圖3-1所示,檢測(cè)結(jié)果表??明:酚-氯仿-異戊醇提取法提取的DNA難以分辨主帶,原因可能為提取過(guò)程中酚-氯仿-??異戊醇(25:24:1?)未將蛋白質(zhì)除盡,以及后續(xù)核算中含有殘留的酚類(lèi)物質(zhì)過(guò)多;高PVP??和P-巰基乙醇提取法結(jié)果顯示能提取條帶單一的基因組DNA,提取越南槐DNA產(chǎn)量較??高,但仍存在多糖;樣品預(yù)處理法提取的DNA電泳結(jié)果顯示條帶清晰,單一,亮度高,??提取效果最好。??M?1?2?3?4?5?6?7?S?^???圖3-1瓊脂糖凝膠的電泳檢測(cè)??Fig.?3-1?Detection?result?of?AGE?(agarose?gel?electrophoresis)??注:M:?DL10000DNA?Marker;?1-3號(hào)泳道為酚-氯仿-異戊醇提取法獲得的越南槐DNA;?4-6號(hào)??泳道為高PVP和P-巰基乙醇提取法獲得的DNA:?7-9號(hào)泳道為樣品預(yù)處理法獲得的DNA。??M:?DL10000?DNA?Marker;?l-31ane:?DNA?extracted?by?phenol-chloroform-isoamylalcohol?extraction??method;?4-6?lane:?DNA?extracted?by?high?level?of?PVP?and?p-ME?extraction?method;?7-91ane

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[3]基于煙草葉綠體基因組和線粒體基因組SSR標(biāo)記的煙屬植物遺傳多樣性分析[J]. 曾建敏,陳學(xué)軍,吳興富,焦芳嬋,肖炳光,李永平,童治軍.  中國(guó)煙草學(xué)報(bào). 2016(04)
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[5]芒屬植物葉綠體InDel標(biāo)記的開(kāi)發(fā)與應(yīng)用[J]. 薛宏,易自力,肖亮,丁力,彭思佳,蔣建雄.  現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2015(07)
[6]9個(gè)野生中國(guó)櫻桃群體葉綠體DNA trnQ-rps16序列變異及其遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 陳濤,王小蓉,羅華,王春濤,張家志,羅明敏.  遺傳. 2012(11)
[7]梨屬葉綠體非編碼區(qū)trnL-trnF和accD-psaI特征及其在系統(tǒng)發(fā)育研究中的應(yīng)用價(jià)值[J]. 胡春云,鄭小艷,滕元文.  園藝學(xué)報(bào). 2011(12)
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[9]遺傳標(biāo)記的類(lèi)型、作用與水稻遺傳標(biāo)記的研究現(xiàn)狀[J]. 陶紅劍,林璐,蘇巖,黃大年.  中國(guó)稻米. 2011(05)
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博士論文
[1]中國(guó)北方野生杜梨的遺傳多樣性和譜系地理研究[D]. 宗宇.浙江大學(xué) 2014
[2]中國(guó)豆梨與川梨的遺傳多樣性和群體遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 劉晶.浙江大學(xué) 2013

碩士論文
[1]基于SSR標(biāo)記及ITS、cpDNA序列的刺梨遺傳多樣性分析[D]. 張懷山.貴州大學(xué) 2017
[2]基于ITS和cpDNA分子標(biāo)記的江西建蘭野生居群遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 李亞.南昌大學(xué) 2013
[3]基于ITS和cpDNA江西蕙蘭野生居群遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 龔黃莎.南昌大學(xué) 2013
[4]鹿蹄草遺傳多樣性的AFLP與SRAP分析[D]. 王威威.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[5]基于cpDNA單倍型的銀杏群體遺傳與譜系分析[D]. 曾真.浙江大學(xué) 2008
[6]湖北海棠SRAP體系建立及其遺傳多樣性研究[D]. 郭大勇.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[7]柿屬植物DNA提取純化檢測(cè)技術(shù)體系的建立[D]. 易慶平.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006



本文編號(hào):3405287

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