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剛毛檉柳ThSZF3基因耐鹽功能分析

發(fā)布時(shí)間:2021-04-02 00:53
  鋅指蛋白(ZFP,Zinc Finger Proteins)是植物一大類重要的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子,參與調(diào)控一些重要的生理過(guò)程,如:形態(tài)建成、花粉發(fā)育、脅迫應(yīng)答、胚胎發(fā)育等[1]。在前期研究中發(fā)現(xiàn)剛毛檉柳ThZFP基因可能是耐鹽基因,因此本研究進(jìn)一步對(duì)ThZFP基因的耐鹽功能進(jìn)行了研究,并對(duì)其耐鹽調(diào)控機(jī)制進(jìn)行了初步的分析。本研究從抗旱耐鹽的木本植物剛毛檉柳轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中鑒定了一條鹽脅迫誘導(dǎo)表達(dá)的鋅指蛋白(salt-induciblezincfinger)基因,命名為ThSZF3。ThSZF3基因全長(zhǎng)1176bp,發(fā)現(xiàn)該基因編碼391個(gè)氨基酸,分子量為97.26 kDa,理論等電點(diǎn)為5.00。亞細(xì)胞定位結(jié)果表明ThSZF3蛋白在細(xì)胞核中表達(dá)。構(gòu)建了ThSZF3基因過(guò)表達(dá)載體pROKII-ThSZF3及RNAi載體pFGC5941-ThSZF3,將其與空pROKII載體瞬時(shí)轉(zhuǎn)化到剛毛檉柳中,分別獲得過(guò)表達(dá)(OE)、抑制表達(dá)(RNAi)及對(duì)照(CON)剛毛檉柳轉(zhuǎn)基因植株并對(duì)轉(zhuǎn)基因剛毛檉柳進(jìn)行NaCl脅迫。分析比較了三種轉(zhuǎn)基因剛毛檉柳中的DAB、NBT及Evans Blue染色以及POD、SOD、PRO... 

【文章來(lái)源】:東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:69 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

剛毛檉柳ThSZF3基因耐鹽功能分析


圖2-1?PCR擴(kuò)增mSZFJ基因??送至測(cè)序,測(cè)序結(jié)果4轉(zhuǎn)泌組數(shù)據(jù)序列比對(duì)完全相同,說(shuō)明7762巧基因成功克??’

檉柳,剛毛,疏水結(jié)構(gòu),氨基酸


利用NCBI對(duì)776ZW編碼的氨基酸進(jìn)行保守區(qū)域分析,發(fā)現(xiàn)有典型的zf-CCCH??結(jié)構(gòu)。結(jié)合ExPASy-PROSITE分析顯示,ThSZF3蛋白序列的N-端含有3個(gè)保守的ZFP??結(jié)構(gòu)域,為典型的CCCH類鋅指蛋白,如圖2-4所示:??|?5??1(9?1^0?2^*?2^*?3?*?3|??3J1??Query?■■BBMy?lllllillll??Specific?hits??Super?families?k<-tcc?|??1?100?200?300?400?500?600?700?800?900?1000??rUlef:?1..."—|__,.^..;..*.|..卜—.|..|.叫.4.二?H......|??LJ?S?E?R?S?E?Q?1?勸?wr你■>.似?(?3?9?1?3?3?)??www^??圖2-4剛毛檉柳776ZFJ基因的保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)??2.3.23剛毛檉柳77AZFJ基因的二級(jí)結(jié)構(gòu)分析??根據(jù)蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè),發(fā)現(xiàn)T/6ZFJ二級(jí)結(jié)構(gòu)由無(wú)規(guī)則卷曲,a-螺旋和(3-折疊??組成。其中以無(wú)規(guī)則卷曲為主,占91.3%?(約357個(gè)氨基酸),其次是a-螺旋占5.12%??(約20個(gè)氨基酸)

檉柳,剛毛,氨基酸,無(wú)規(guī)則


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本文編號(hào):3114279

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