【目的】微管蛋白是植物細胞骨架的重要組成部分,在植物細胞分裂與生長、細胞形態(tài)維持、細胞內物質運輸和細胞壁的生物合成等過程中均發(fā)揮著重要作用。為全面了解毛竹微管蛋白的分子特征,開展了毛竹微管蛋白全基因組鑒定與分析,并初步研究了Pe TUA3基因的功能,以期為揭示微管蛋白在毛竹生長發(fā)育過程的作用提供參考依據。【方法】采用生物信息學的方法開展毛竹中微管蛋白基因的全基因組分析,利用轉錄組數據和實時熒光定量PCR技術分別分析微管蛋白基因的組織表達模式及其隨筍高度增加的表達變化,通過在擬南芥中異位表達及表型觀察初步研究Pe TUA3基因的功能。【結果】在毛竹基因組中共獲得18條微管蛋白基因序列,編碼蛋白具有完整的保守結構域,蛋白長度為430～634 aa,分子量為48.31～69.89 k Da。在與水稻、擬南芥微管蛋白構建的系統(tǒng)進化樹中,被聚類到2個亞家族（TUA和TUB）,且毛竹各微管蛋白成員與水稻的親緣關系更近,這些基因分別命名為Pe TUA1-Pe TUA6和Pe TUB1-Pe TUB12。亞細胞定位預測顯示PeTUAs均定位在細胞質中,而PeTUBs均定位于細胞核中�；谵D錄組數據的基... 

【文章來源】：林業(yè)科學. 2020,56(07)北大核心EICSCD

【文章頁數】：11 頁

【部分圖文】：

毛竹微管蛋白基因結構與保守結構域

實時熒光定量PCR結果表明，隨著筍高度的增加TUA亞家族6個基因的表達量均呈上調趨勢，而TUB亞家族有8個基因的表達量呈上調趨勢，4個基因的表達為波動變化(圖4)。在上調表達的基因中，PeTUA4、PeTUB3、PeTUB4、PeTUB9和PeTUB105個基因的表達量呈一直上升的趨勢;PeTUA1、PeTUA5、PeTUA6和PeTUB12 4個基因表達趨勢均呈先上升后下降的趨勢，均在1.0 m和2.0 m筍中表達量相對較低，在6.0 m筍中表達量達到最高，之后在8.0 m筍中略微下降;PeTUA2、PeTUB5和PeTUB7的表達量呈現呈先上升后下降，再上升再下降的趨勢。在表達波動變化的基因中，PeTUB1的表達先呈現下調，至4.0 m筍中達到最低，之后在6.0 m筍中表達量迅速上調達到最高，之后在8.0 m筍中又迅速下降，但仍然高于1.0 m筍中的表達量;PeTUB6在2.0 m筍中的表達量迅速上調(約是1.0m筍中的2.8倍)，而在4.0 m筍中又迅速下降(約為1.0 m筍中的0.6倍)，之后又逐漸上升，8.0 m筍中約是1.0 m筍中的2.0倍;PeTUB8和PeTUB11都是呈現先上升后下降的趨勢，分別在4.0 m和2.0 m筍中表達量最高，均是在8.0 m筍中最低(低于1.0 m筍中的表達量)。綜合來看，毛竹各微管蛋白基因在不同高度筍的表達模式存在著明顯差異，表明它們在筍的生長過程中發(fā)揮著不同的作用。圖3 微管蛋白基因在毛竹7個組織中的表達分析

微管蛋白基因在毛竹7個組織中的表達分析

【參考文獻】：
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本文編號：3112080