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白樺WRKY家族基因克隆及表達分析

發(fā)布時間:2021-03-20 11:29
  WRKY家族基因是近些年來研究較為廣泛的一類植物轉(zhuǎn)錄因子,它在高等植物中存在較廣,在低等植物中很少發(fā)現(xiàn)。WRKY家族成員不僅可以參與植物的多種生物學過程,如代謝調(diào)控、形態(tài)建成、種子萌發(fā)等,在生物和非生物脅迫條件下也會不同程度被誘導,表明了在植物防衛(wèi)反應中WRKY蛋白扮演著不可或缺的角色。本研究克隆白樺WRKY家族基因及其啟動子,研究其表達特性,篩選和抗逆性及材性相關的WRKY家族成員,進行功能研究,為林木分子生物學提供基礎理論,為培育速生、優(yōu)質(zhì)、高抗白樺新品種提供材料。本研究在前期構(gòu)建的白樺轉(zhuǎn)錄組中查找到131條WRKY基因,利用NCBI網(wǎng)站中的blastx程序進行比對分析,最終確定37條具有完整開放讀碼框(ORF)的白樺WRKY基因序列,利用PCR技術(shù)進行擴增,成功克隆得到20條白樺WRKY基因,并對其進行了生物信息學分析。結(jié)果表明它們都含有高度保守的WRKY氨基酸結(jié)構(gòu)域,并且很多都與擬南芥中的AtWRKY遺傳進化關系較近。利用實時熒光定量PCR技術(shù)研究了白樺WRKY家族基因在白樺不同組織及不同非生物脅迫下不同時間點的基因表達模式,結(jié)果表明這些基因在不同組織中的表達是具有特異性的,在... 

【文章來源】:東北林業(yè)大學黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:86 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

白樺WRKY家族基因克隆及表達分析


圖2-1白樺WRKY家族基因保守區(qū)預測??表2-6白樺WRKY家族基因蛋白質(zhì)性質(zhì)??

序列,基因系,白樺,家族


?東北林業(yè)大學碩士學位論文???2.3.2.4白樺WRKY家族基因系統(tǒng)進化分析??此外,還對20條白樺辦基因推導的蛋白序列和71條擬南芥A奶況r基因??的蛋白序列進行了系統(tǒng)進化樹分析(圖2-3)。結(jié)果表明你與的遺傳??進化關系較近;卵/股尺}35與^4/哪尤7¥4的遺傳進化關系較近;你/膽尤725與??/1/W7?AT57的遺傳進化關系較近;辦/^iQ72與的遺傳進化關系較近;??%脈尺與乂爾尺削的遺傳進化關系較近;辦脈燈25與J戯燈27的遺傳進化??關系較近;。A?尤725與淪的遺傳進化關系較近;辦/階?尺}^與淪奶?KF(55的??遺傳進化關系較近;辦/階?尤7(5與A階?/075的遺傳進化關系較近。??__??AtWRKY74?^?H?L—CZZI—:——AtWRKY57??°?5?°??圖2-3白樺WRKY家族基因系統(tǒng)進化分析??-30-??

電泳圖,白樺,野生型,電泳圖


2白樺WRKY家族基因克隆及表達分析??2.3.3白樺WRKY家族基因響應非生物脅迫研究??以未脅迫處理的野生型白樺為對照,對用200?mmol/L?NaCl和300?mmol/L甘露醇??(Mannitol)分別脅迫處理6?h、12?h、24?h和48?h四個不同時間點的20條白樺財夂F??基因的表達量進行分析,結(jié)果見圖2-5。結(jié)果顯示在20條白樺陳火F基因中,只有??辦/的?尺汾基因在兩種脅迫的不同時間點均上調(diào)表達,其余19條白樺基因在各??個時間點均下調(diào)表達。在200?mmol/L?NaCl的脅迫處理中,20條白樺WRKY家族基因??隨著脅迫處理時間的增長,其基因表達量變化的總體表達趨勢是先下降后又有所恢復,??在脅迫處理24?h左右達到其表達量的最低值。在300?mmol/L?Mannitol的脅迫處理中,??20條白樺WRKY家族基因隨著脅迫處理時間的增長,其基因表達量變化的總體表達趨??勢表現(xiàn)為有所恢復而后繼續(xù)下降,在脅迫處理6?h左右表達量最低。除此之外還可以看??出,基因在兩種脅迫處理的各個時間點表達量相對穩(wěn)定,差異不大,且在20??條白樺基因中下調(diào)表達最為明顯。??圖2-4脅迫處理后白樺材料RNA提収檢測電泳圖??注:A:未處理野生型白樺RNA;?B:?200?mmol/L?NaC丨脅迫處理6?h后白樺RNA;?C:?200?mmol/L??NaCl?脅迫處理?12?h?后白樺?RNA;?D:?200?mmol/L?NaCl?脅迫處理?24?h?后白樺?RNA;?E:?200?m.mo.l/L??NaC丨脅迫處理48?h后白樺RNA;?F:?300?mmol/L?Mannito丨脅迫處理6?h后白樺RNA;

【參考文獻】:
期刊論文
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博士論文
[1]小麥基因組中WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族基因鑒定、克隆和TaWRKY10基因的功能分析[D]. 王晨.華中科技大學 2013
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碩士論文
[1]棉花WRKY轉(zhuǎn)錄因子GhWRKY39的分離及功能研究[D]. 史偉娜.山東農(nóng)業(yè)大學 2014
[2]毛竹抗逆相關基因PeZFP和PeMYB基因的克隆及PeZFP基因功能驗證[D]. 楊麗.浙江農(nóng)林大學 2011
[3]轉(zhuǎn)基因白樺中外源基因整合表達穩(wěn)定性與遺傳變異分析[D]. 曾凡鎖.東北林業(yè)大學 2005



本文編號:3090926

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