基于DNA技術識別樟科木材
發(fā)布時間:2021-01-17 23:02
樟科Lauraceae木材解剖結構相似,傳統(tǒng)形態(tài)解剖學方法很難做出準確鑒定,基于分子標記的樹種鑒定技術準確而且高效。本研究通過增加木粉質量與DNA緩沖液體積比、溫浴時間等改良木質部基因組DNA提取;用改良CTAB-SDS法、CTAB法和試劑盒法提取樟科木質部DNA,篩選了木質部DNA提取方法,初步建立楠屬木材DNA提取技術體系;利用ISSR和RAPD技術對樟科16種192株木質部DNA進行擴增,構建多態(tài)性鑒別圖譜,比較兩分子標記差別;DNA條形碼對葉綠體基因psb A-trnH間隔區(qū)DNA克隆測序,通過序列差異區(qū)別16樹種,構建系統(tǒng)進化樹。具體結果如下:(1)通過增加木粉質量與DNA緩沖液體積比、溫浴時間,改變緩沖液成分等參數(shù),將DNA樣品OD260/280值從1.1-1.5提升到1.8-2.0,提高了DNA純度。(2)3種方法提取的DNA質量差別明顯,改良CTAB-SDS法最適合提取楠屬木質部DNA。DNA濃度:改良CTAB-SDS法最高、試劑盒法最低;DNA純度:改良CTAB-SDS法和CTAB法提取的DNA樣品純度高,OD260/值為1.7-2.0,滿足擴增要求,試劑盒法提取的D...
【文章來源】:南京林業(yè)大學江蘇省
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1臺式冷凍離心機
3、梯度 PCR 擴增儀(9700,圖 2-3):設定 PCR 的程序及其擴增;4、瓊脂糖水平電泳儀(圖 2-4)及全自動凝膠成像儀(Gel X 1650,圖 2-5):檢測分析 PCR 擴增結果及觀察、拍照、保存;5、電熱恒溫水槽及震蕩型恒溫金屬。禾囟囟认聹卦≡噭;6、磁力攪拌器(Wise Stir)及渦旋機:用于混勻試劑;7、電子天平:精度 0.0001g;8、-80℃超低溫冰箱(Kaltis):貯藏實驗材料和試劑;9、高溫高壓滅菌鍋(Hirayama)、制冰機(Sanyo)、微波爐(Midea)、恒溫培養(yǎng)箱(Binder)、搖床(IKAKS 4000)、移液槍(Eppendorf)及槍頭、烘箱、研缽及研棒量筒、玻璃杯、容量瓶。
3、梯度 PCR 擴增儀(9700,圖 2-3):設定 PCR 的程序及其擴增;4、瓊脂糖水平電泳儀(圖 2-4)及全自動凝膠成像儀(Gel X 1650,圖 2-5):檢測分析 PCR 擴增結果及觀察、拍照、保存;5、電熱恒溫水槽及震蕩型恒溫金屬。禾囟囟认聹卦≡噭;6、磁力攪拌器(Wise Stir)及渦旋機:用于混勻試劑;7、電子天平:精度 0.0001g;8、-80℃超低溫冰箱(Kaltis):貯藏實驗材料和試劑;9、高溫高壓滅菌鍋(Hirayama)、制冰機(Sanyo)、微波爐(Midea)、恒溫培養(yǎng)箱(Binder)、搖床(IKAKS 4000)、移液槍(Eppendorf)及槍頭、烘箱、研缽及研棒量筒、玻璃杯、容量瓶。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]3種楠木DNA提取及其ISSR標記鑒別[J]. 王英,駱嘉言,鐘文翰,石江濤,樊帥. 四川農業(yè)大學學報. 2016(04)
[2]太湖洞庭地區(qū)紅桔種質資源基因組提取及ISSR親緣關系分析[J]. 朱沛煌,周坤杰,郭天瑋,儲春榮,季孔庶. 林業(yè)科技開發(fā). 2015(05)
[3]不同產地貓豆遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 邱亞玲,秦民堅,戴軼群,及佳,謝國勇,吳剛,朱艷. 中國實驗方劑學雜志. 2015(06)
[4]華山松針葉基因組DNA不同提取方法比較[J]. 謝冬梅,陳國明,何德,李翠新. 廣西林業(yè)科學. 2014(04)
[5]玉米種質材料遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 祁麗婷,李中青,趙晉峰,李齊霞,李顏芳,王瑞,孫萬榮,王敏,王楓葉. 安徽農業(yè)科學. 2014(34)
[6]降香黃檀木材DNA提取及rDNA-ITS序列條形碼分子鑒定[J]. 余敏,張浩,劉盛全,金青,李大周. 林產化學與工業(yè). 2014(05)
[7]28個果桑品種(系)的遺傳多樣性ISSR分析[J]. 黃蓋群,佟萬紅,危玲,殷浩,何寧佳,劉剛,鄭繼川,姚永權,李永遠. 西南農業(yè)學報. 2014(05)
[8]滇西南地區(qū)樟科17種木材解剖特征研究[J]. 孫瑾,王曉靜,王飛,徐恩光,高振忠. 華南農業(yè)大學學報. 2014(05)
[9]美洲黑楊新無性系的ISSR鑒別及SCAR標記轉化[J]. 李薇,王永進,樊軍鋒. 西北林學院學報. 2014(04)
[10]25份槭屬優(yōu)良種質資源親緣關系的ISSR分析[J]. 林樂靜,林立,祝志勇. 廣西植物. 2015(01)
博士論文
[1]基于DNA條形碼的瀕危木材識別技術研究[D]. 焦立超.中國林業(yè)科學研究院 2015
碩士論文
[1]浙江楠EST-SSR標記開發(fā)及天然種群遺傳多樣性研究[D]. 丁亞軍.浙江農林大學 2014
[2]水杉木材DNA提取及DNA條形碼分析[D]. 楊路路.湖北大學 2011
[3]樟科植物DNA Barcode及香樟系統(tǒng)地理學的初步研究[D]. 高大偉.華東師范大學 2008
本文編號:2983758
【文章來源】:南京林業(yè)大學江蘇省
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1臺式冷凍離心機
3、梯度 PCR 擴增儀(9700,圖 2-3):設定 PCR 的程序及其擴增;4、瓊脂糖水平電泳儀(圖 2-4)及全自動凝膠成像儀(Gel X 1650,圖 2-5):檢測分析 PCR 擴增結果及觀察、拍照、保存;5、電熱恒溫水槽及震蕩型恒溫金屬。禾囟囟认聹卦≡噭;6、磁力攪拌器(Wise Stir)及渦旋機:用于混勻試劑;7、電子天平:精度 0.0001g;8、-80℃超低溫冰箱(Kaltis):貯藏實驗材料和試劑;9、高溫高壓滅菌鍋(Hirayama)、制冰機(Sanyo)、微波爐(Midea)、恒溫培養(yǎng)箱(Binder)、搖床(IKAKS 4000)、移液槍(Eppendorf)及槍頭、烘箱、研缽及研棒量筒、玻璃杯、容量瓶。
3、梯度 PCR 擴增儀(9700,圖 2-3):設定 PCR 的程序及其擴增;4、瓊脂糖水平電泳儀(圖 2-4)及全自動凝膠成像儀(Gel X 1650,圖 2-5):檢測分析 PCR 擴增結果及觀察、拍照、保存;5、電熱恒溫水槽及震蕩型恒溫金屬。禾囟囟认聹卦≡噭;6、磁力攪拌器(Wise Stir)及渦旋機:用于混勻試劑;7、電子天平:精度 0.0001g;8、-80℃超低溫冰箱(Kaltis):貯藏實驗材料和試劑;9、高溫高壓滅菌鍋(Hirayama)、制冰機(Sanyo)、微波爐(Midea)、恒溫培養(yǎng)箱(Binder)、搖床(IKAKS 4000)、移液槍(Eppendorf)及槍頭、烘箱、研缽及研棒量筒、玻璃杯、容量瓶。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]3種楠木DNA提取及其ISSR標記鑒別[J]. 王英,駱嘉言,鐘文翰,石江濤,樊帥. 四川農業(yè)大學學報. 2016(04)
[2]太湖洞庭地區(qū)紅桔種質資源基因組提取及ISSR親緣關系分析[J]. 朱沛煌,周坤杰,郭天瑋,儲春榮,季孔庶. 林業(yè)科技開發(fā). 2015(05)
[3]不同產地貓豆遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 邱亞玲,秦民堅,戴軼群,及佳,謝國勇,吳剛,朱艷. 中國實驗方劑學雜志. 2015(06)
[4]華山松針葉基因組DNA不同提取方法比較[J]. 謝冬梅,陳國明,何德,李翠新. 廣西林業(yè)科學. 2014(04)
[5]玉米種質材料遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 祁麗婷,李中青,趙晉峰,李齊霞,李顏芳,王瑞,孫萬榮,王敏,王楓葉. 安徽農業(yè)科學. 2014(34)
[6]降香黃檀木材DNA提取及rDNA-ITS序列條形碼分子鑒定[J]. 余敏,張浩,劉盛全,金青,李大周. 林產化學與工業(yè). 2014(05)
[7]28個果桑品種(系)的遺傳多樣性ISSR分析[J]. 黃蓋群,佟萬紅,危玲,殷浩,何寧佳,劉剛,鄭繼川,姚永權,李永遠. 西南農業(yè)學報. 2014(05)
[8]滇西南地區(qū)樟科17種木材解剖特征研究[J]. 孫瑾,王曉靜,王飛,徐恩光,高振忠. 華南農業(yè)大學學報. 2014(05)
[9]美洲黑楊新無性系的ISSR鑒別及SCAR標記轉化[J]. 李薇,王永進,樊軍鋒. 西北林學院學報. 2014(04)
[10]25份槭屬優(yōu)良種質資源親緣關系的ISSR分析[J]. 林樂靜,林立,祝志勇. 廣西植物. 2015(01)
博士論文
[1]基于DNA條形碼的瀕危木材識別技術研究[D]. 焦立超.中國林業(yè)科學研究院 2015
碩士論文
[1]浙江楠EST-SSR標記開發(fā)及天然種群遺傳多樣性研究[D]. 丁亞軍.浙江農林大學 2014
[2]水杉木材DNA提取及DNA條形碼分析[D]. 楊路路.湖北大學 2011
[3]樟科植物DNA Barcode及香樟系統(tǒng)地理學的初步研究[D]. 高大偉.華東師范大學 2008
本文編號:2983758
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